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串聯(lián)質(zhì)譜中肽段氨基酸同分異構(gòu)體碎裂規(guī)律的研究

發(fā)布時(shí)間:2019-09-13 17:40
【摘要】:串聯(lián)質(zhì)譜在蛋白質(zhì)組學(xué)以及肽類分子的研究中發(fā)揮著重要作用,利用分析物在氣相中產(chǎn)生的碎片離子對多肽/蛋白結(jié)構(gòu)進(jìn)行鑒定。組成多肽的一些特殊氨基酸可能會(huì)產(chǎn)生異構(gòu)現(xiàn)象,如側(cè)鏈含有羧基的天冬氨酸在生理?xiàng)l件下可以發(fā)生D-L構(gòu)型或α和β結(jié)構(gòu)的轉(zhuǎn)化。在生物體中發(fā)生的氨基酸構(gòu)型的轉(zhuǎn)變往往會(huì)影響蛋白的結(jié)構(gòu)和生物功能,如神經(jīng)肽的活性與手性氨基酸的存在密切相關(guān)。質(zhì)子化多肽的碎裂常常被用于肽段氨基酸序列的鑒定,鈉離子與多肽的結(jié)合物在串聯(lián)質(zhì)譜的碎裂過程中往往能夠給出不同于質(zhì)子化肽的碎片信息,作為多肽鑒定過程中信息的補(bǔ)充。在本論文中,我們使用串聯(lián)質(zhì)譜的方法研究了側(cè)鏈參與形成的多肽異構(gòu)體與手性多肽的碎裂,結(jié)合理論計(jì)算,研究了Na+作用下多肽的氣相結(jié)構(gòu)和引發(fā)的碎裂途徑。本論文的研究內(nèi)容包括兩個(gè)部分:1.谷胱甘肽及其同分異構(gòu)體ECG在串聯(lián)質(zhì)譜中的碎裂特征研究。半胱氨酸具有與絲氨酸類似的結(jié)構(gòu),但是在Na離子作用下表現(xiàn)出完全不同的碎裂行為,而谷胱甘肽是含有半胱氨酸的天然活性肽。以此為出發(fā)點(diǎn),我們圍繞含有半胱氨酸的多肽進(jìn)行研究,從串聯(lián)質(zhì)譜碎裂的角度區(qū)分谷胱甘肽及其同分異構(gòu)體ECG。對比了質(zhì)子化以及在Na+作用下的碎裂途徑差異,在谷胱甘肽的碎裂中觀察到了特征的45 Da(NH3+CO)的中性丟失,以及碎裂中不常見的(b1)b1-H+Na,并通過理論計(jì)算對反應(yīng)過程進(jìn)行了模擬,證明了反應(yīng)發(fā)生的合理性。2.含有手性氨基酸多肽在串聯(lián)質(zhì)譜中的碎裂規(guī)律研究。氨基酸構(gòu)型的改變是蛋白翻譯后修飾的一種方式,這種修飾沒有引起分子量的改變,但往往會(huì)改變蛋白的結(jié)構(gòu)以及生物活性。在我們的實(shí)驗(yàn)中,以含有芳香性氨基酸的神經(jīng)肽為研究對象,采用串聯(lián)質(zhì)譜的方法,在碰撞誘導(dǎo)解離模式下對質(zhì)子化肽、鈉離子化肽、肽與葫蘆脲8的非共價(jià)復(fù)合物進(jìn)行碎裂,通過實(shí)驗(yàn)結(jié)果的對比發(fā)現(xiàn),多肽與葫蘆脲8形成的非共價(jià)相互作用的復(fù)合物在碎裂行為上表現(xiàn)出一致的規(guī)律,即在涉及手性氨基酸親核進(jìn)攻形成的b離子處斷裂形成豐度差異明顯的碎片,在碎裂譜圖中得到了很好的區(qū)分效果,表明在分析體系中引入大分子結(jié)構(gòu)的化合物可以更有效地利用串聯(lián)質(zhì)譜進(jìn)行手性多肽的識(shí)別。利用Na離子化多肽碎裂中的特征離子對多肽中的特殊結(jié)構(gòu)進(jìn)行鑒定,利用多肽與葫蘆脲的非共價(jià)相互作用形成的復(fù)合物離子在氣相中產(chǎn)生的特殊碎片離子,實(shí)現(xiàn)對多肽中手性氨基酸的檢測。希望我們的研究對多肽氣體相的碎裂方式提供有意義的信息,有助于提高質(zhì)譜在蛋白鑒定中的準(zhǔn)確度。
【學(xué)位授予單位】:吉林大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2017
【分類號(hào)】:O629.7;O657.63

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本文編號(hào):2535724

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