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凝膠電泳-毛細(xì)管液相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用技術(shù)分析大腸癌腫瘤與癌旁組織的差異蛋白質(zhì)組

發(fā)布時(shí)間:2018-09-18 15:07
【摘要】:通過(guò)凝膠電泳將大腸癌患者的手術(shù)標(biāo)本組織(腫瘤與癌旁)中的總蛋白按照分子量分成不同的組分,經(jīng)膠內(nèi)水解后,利用毛細(xì)管液相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用技術(shù)對(duì)各個(gè)組分的多肽混合物進(jìn)行蛋白質(zhì)組學(xué)分析,共鑒定出29種差異表達(dá)的蛋白質(zhì),其中腫瘤組織中表達(dá)上調(diào)的蛋白質(zhì)19種,如Fibrinogen beta chain,Vimentin,Fibrinogen gamma chain,Histone H2A type 1-B/E,Isoform 1 of Periostin,Fibrinogen alpha chain,Histone H3.1,Alphaenolase,Protein disulfide-isomerase A3等;在腫瘤組織中表達(dá)下調(diào)的有10種蛋白質(zhì),如Sarcomeric tropomyosin kappa,Transgelin,Heat shock protein beta-1,Talin-1,Isoform 2 of Vinculin,Isoform 1 of Filamin-C等。通過(guò)蛋白質(zhì)印跡實(shí)驗(yàn)對(duì)其中的踝蛋白1(Talin-1)和烯醇化酶(Alpha-enolase)的蛋白質(zhì)組學(xué)鑒定結(jié)果進(jìn)行了驗(yàn)證。生物信息學(xué)分析表明在大腸癌組織中表達(dá)上調(diào)的蛋白多具有胞外分泌的屬性,提示這些蛋白很有可能會(huì)滲透到機(jī)體內(nèi)的循環(huán)系統(tǒng)中,從而在患者血液或者腹水中能夠被檢測(cè)到;而在大腸癌組織中表達(dá)下調(diào)的蛋白則多為細(xì)胞骨架、胞外基質(zhì)纖維等的組成成分,這些蛋白的下調(diào)常與腫瘤細(xì)胞向周圍組織的侵襲和轉(zhuǎn)移有密切關(guān)系。本研究為大腸癌的早期診斷、大腸癌初篩等方面的研究等提供了基礎(chǔ)數(shù)據(jù),對(duì)進(jìn)一步深入研究大腸癌發(fā)病機(jī)制具有重要意義。
[Abstract]:The total proteins in the surgical tissues (tumor and adjacent) of colorectal cancer patients were divided into different components according to their molecular weight by gel electrophoresis. A total of 29 differentially expressed proteins were identified by using capillary liquid chromatography-mass spectrometry for proteomic analysis of polypeptide mixtures of various components, 19 of which were up-regulated in tumor tissues. For example, Fibrinogen beta chain,Vimentin,Fibrinogen gamma chain,Histone H2A type 1-B / type 1 of Periostin,Fibrinogen alpha chain,Histone H3.1 of Periostin,Fibrinogen alpha chain,Histone Alphaenolase protein in disulfide-isomerase A3 and so on, 10 proteins, such as Sarcomeric tropomyosin kappa,Transgelin,Heat shock protein beta-1,Talin-1,Isoform 2 of Vinculin,Isoform 1 of Filamin-C, were down-regulated in tumor tissues. The proteomic identification results of ankle protein 1 (Talin-1) and enolase (Alpha-enolase) were verified by Western blot. Bioinformatics analysis showed that the up-regulated proteins expressed in colorectal cancer tissues have the properties of extracellular secretion, suggesting that these proteins may penetrate into the circulatory system of the body and can be detected in the patient's blood or ascites. However, the down-regulated proteins in colorectal cancer tissues are mainly composed of cytoskeleton and extracellular matrix fibers. The down-regulation of these proteins is closely related to the invasion and metastasis of tumor cells to the surrounding tissues. This study provides the basic data for the early diagnosis of colorectal cancer and the primary screening of colorectal cancer. It is of great significance to further study the pathogenesis of colorectal cancer.
【作者單位】: 吉林大學(xué)中日聯(lián)誼醫(yī)院;吉林省腫瘤醫(yī)院;吉林大學(xué)藥學(xué)院;
【基金】:國(guó)家自然科學(xué)基金(Nos.81572082,81472030) 吉林省科技廳項(xiàng)目(Nos.2011713,20150414015GH,20150101153JC,20140311092YY,2014041005GH)資助~~
【分類號(hào)】:R735.34;O657.63

【相似文獻(xiàn)】

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本文編號(hào):2248298

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