本文選題：定量蛋白質(zhì)組學(xué) + 高分辨飛行時(shí)間質(zhì)譜　； 參考：《分析化學(xué)》2016年03期

【摘要】：利用Triple TOF 5600高分辨質(zhì)譜儀分析牛血清白蛋白等3種蛋白質(zhì)標(biāo)準(zhǔn)品,研究了質(zhì)譜離子強(qiáng)度與蛋白質(zhì)樣品相對(duì)含量的相關(guān)性。蛋白質(zhì)標(biāo)準(zhǔn)品用胰酶酶切后,稀釋成1~1024 fmol/7μL的系列溶液,考察在1~1024 fmol上樣量情況下,肽段的前體離子計(jì)數(shù)(cps)、蛋白質(zhì)全部肽段的離子計(jì)數(shù)之和以及被檢出肽段數(shù)目與上樣量的相關(guān)性,以及相同樣品在3次平行實(shí)驗(yàn)之間這些數(shù)值的變化幅度。結(jié)果表明。被檢出肽段數(shù)目與上樣量正相關(guān),當(dāng)cps超過1000時(shí),所有肽段離子強(qiáng)度之和與上樣量呈線性關(guān)系,但是用最靈敏肽段的離子強(qiáng)度表示更為準(zhǔn)確。3次測量同一肽段的最高離子強(qiáng)度通常不會(huì)超過最低強(qiáng)度的1.5倍,提示當(dāng)不同樣品中同一蛋白的離子強(qiáng)度相差3倍以上是判斷不同樣品中相同蛋白質(zhì)的含量具有差異的可靠閾值。本研究提供了一種利用高分辨率和高掃描速度蛋白質(zhì)組組學(xué)定性數(shù)據(jù)進(jìn)行半定量分析的方法,簡便、快速,可為相關(guān)生物學(xué)和醫(yī)學(xué)研究提供參考。
[Abstract]:Three kinds of protein standard were analyzed by Triple TOF 5600 high resolution mass spectrometer, and the correlation between ion strength and relative content of protein samples was studied. After digested with trypsin, the standard protein was diluted into a series of solution of 1t0 024 fmol/7 渭 L, and the sample amount of 1 1 024 fmol was investigated. The number of precursors of the peptide segment is counted by the number of CPS, the sum of the ion counts of the whole peptide segment of the protein, the correlation between the number of the detected peptide segments and the amount of the sample, and the variation of these values between the three parallel experiments of the same sample. The results show that. The number of peptides detected was positively correlated with the amount of sample. When cps exceeded 1000, the sum of ionic strength of all peptide segments was linearly related to the amount of sample. But the ion strength of the most sensitive peptide segment is expressed more accurately by measuring the maximum ionic strength of the same peptide segment for more than 1.5 times the minimum intensity. It is suggested that the difference of ionic strength of the same protein in different samples is more than 3 times, which is the reliable threshold to judge the difference of the content of the same protein in different samples. This study provides a method of semi-quantitative analysis based on high resolution and high scanning speed qualitative data of proteomics. It is simple and rapid and can be used as a reference for related biological and medical research.
【作者單位】： 深圳大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院微生物工程重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;深圳大學(xué)生命與海洋科學(xué)學(xué)院深圳市海洋生物資源與生態(tài)環(huán)境重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【基金】：深圳市科技項(xiàng)目(Nos.JSGG20140703163838793,20150006)資助
【分類號(hào)】：Q503;O657.63

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本文編號(hào)：1822412