本文選題：圖論指數(shù)　切入點(diǎn)：高選擇性拓?fù)渲笖?shù)　出處：《河南大學(xué)》2016年碩士論文　論文類型：學(xué)位論文

【摘要】：EAID指數(shù)是一個(gè)高選擇性的拓?fù)渲笖?shù),由許祿教授所提出。我們采用超過(guò)1400萬(wàn)個(gè)分子驗(yàn)證該指數(shù)的唯一性,未發(fā)現(xiàn)簡(jiǎn)并。在本論文中簡(jiǎn)并的定義為:如果兩個(gè)結(jié)構(gòu)不同的化合物衍生出的某個(gè)拓?fù)渲笖?shù)具有相同值,也就是說(shuō)這兩個(gè)分子結(jié)構(gòu)不能被此指數(shù)唯一性區(qū)分,則稱此兩個(gè)化合物簡(jiǎn)并。前述的化合物結(jié)構(gòu)包括:含碳原子數(shù)1-22的鏈烷烴的380多萬(wàn)分子,含雜原子的38萬(wàn)多個(gè)分子,含1-13個(gè)苯環(huán)的400多萬(wàn)苯環(huán)型化合物和3個(gè)實(shí)際數(shù)據(jù)庫(kù)(NCI,Pubchem,STocks)590多萬(wàn)個(gè)分子。然而,當(dāng)用更大的數(shù)據(jù)集驗(yàn)證EAID指數(shù)唯一性時(shí),出現(xiàn)了簡(jiǎn)并。在含碳原子數(shù)為23和24的2000多萬(wàn)分子的研究中,分別出現(xiàn)了5對(duì)和13對(duì)簡(jiǎn)并分子,同時(shí),在對(duì)ZINC實(shí)際數(shù)據(jù)庫(kù)的2000多萬(wàn)化合物分子的研究中出現(xiàn)了10對(duì)簡(jiǎn)并分子。這說(shuō)明EAID指數(shù)對(duì)圖論結(jié)構(gòu)的唯一性區(qū)分仍存在不足,需要對(duì)其進(jìn)一步改進(jìn)。為了提高指數(shù)EAID的選擇性,我們基于EAID指數(shù)提出了2-EAID指數(shù),并采用前述共計(jì)5500多萬(wàn)個(gè)分子檢驗(yàn)了2-EAID的唯一性。結(jié)果顯示,只有在ZINC數(shù)據(jù)庫(kù)中出現(xiàn)了2對(duì)簡(jiǎn)并分子,其他數(shù)據(jù)庫(kù)無(wú)簡(jiǎn)并存在。很顯然,與EAID相比,2-EAID指數(shù)的選擇性得到了顯著提高。我們嘗試著探究如果將EAID指數(shù)與其他指數(shù)相結(jié)合,是否能提高指數(shù)的選擇性。具體來(lái)說(shuō),我們結(jié)合Wiener指數(shù)和EAID指數(shù)衍生了新的拓?fù)渲笖?shù),稱為3-EAID。在對(duì)3-EAID指數(shù)進(jìn)行唯一性測(cè)試時(shí),我們不僅采用了2-EAID指數(shù)檢驗(yàn)的所有數(shù)據(jù)集,還增加了2個(gè)數(shù)據(jù)集:(1)含25個(gè)碳原子的3600多萬(wàn)同分異構(gòu)體分子;(2)含14個(gè)苯環(huán)的1500多萬(wàn)化合物。結(jié)果表明3-EAID指數(shù)可以完全區(qū)分所有實(shí)際數(shù)據(jù)庫(kù)和虛擬數(shù)據(jù)庫(kù)中的1.07多億化合物分子。與其相對(duì)照,EAID指數(shù)對(duì)數(shù)據(jù)集(1)和(2)的驗(yàn)證結(jié)果分別是75和29對(duì)簡(jiǎn)并,2-EAID指數(shù)對(duì)數(shù)據(jù)集(1)和(2)的驗(yàn)證結(jié)果分別是15和1對(duì)簡(jiǎn)并。本文所用到的虛擬數(shù)據(jù)庫(kù)源于實(shí)驗(yàn)室的內(nèi)部程序,其中,飽和鏈烷烴與含雜原子分子是由我們實(shí)驗(yàn)室的結(jié)構(gòu)生成器窮舉生成的,苯環(huán)型化合物是由我們所發(fā)表的一個(gè)算法窮舉所得的,實(shí)際數(shù)據(jù)庫(kù)則是通過(guò)網(wǎng)絡(luò)免費(fèi)下載的�？傊�,根據(jù)我們的文獻(xiàn)知識(shí),含23-25個(gè)碳原子的鏈烷烴化合物窮舉迄今尚屬首次,而3-EAID指數(shù)是迄今為止區(qū)分能力最強(qiáng)的拓?fù)渲笖?shù)。截止2015年6月,在美國(guó)化學(xué)文摘服務(wù)社的世界上最大的化學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù),注冊(cè)的有機(jī)的和無(wú)機(jī)的化合物分子尚不足1億。因此,3-EAID指數(shù)的化合物結(jié)構(gòu)唯一性表征能力已具有潛在的實(shí)際應(yīng)用價(jià)值,如:大型化合物數(shù)據(jù)庫(kù)的管理,有機(jī)化合物結(jié)構(gòu)的評(píng)價(jià),計(jì)算機(jī)輔助藥物合成。
[Abstract]:......
【學(xué)位授予單位】：河南大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2016
【分類號(hào)】：O641

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本文編號(hào)：1574520