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水溶液中氨基酸側(cè)鏈對G∶C堿基對間氫鍵影響的理論研究

發(fā)布時(shí)間:2017-10-29 05:25

  本文關(guān)鍵詞:水溶液中氨基酸側(cè)鏈對G∶C堿基對間氫鍵影響的理論研究


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【摘要】:利用量子化學(xué)方法研究了氣相和水溶液下,氨基酸側(cè)鏈與鳥嘌呤和胞嘧啶間的氫鍵作用.應(yīng)用B3LYP/6-31+G(d,p)方法優(yōu)化復(fù)合物幾何結(jié)構(gòu),使用MP2/aug-cc-p VDZ方法進(jìn)行復(fù)合物能量、自然鍵軌道(NBO)電荷和二階穩(wěn)定化能的計(jì)算.結(jié)果表明,水溶液可使氨基酸側(cè)鏈與堿基或堿基對之間氫鍵鍵能顯著減小;帶電復(fù)合物氣相和水溶液氫鍵鍵能之差范圍為50.63~146.48 k J/mol,中性為0.17~24.94 k J/mol;電荷的轉(zhuǎn)移量與氫鍵鍵能成正比,電荷轉(zhuǎn)移量越多,復(fù)合物越穩(wěn)定;二階穩(wěn)定化能與氫鍵鍵長成反比,與電荷轉(zhuǎn)移量成正比,且氣相與水溶液氫鍵二階穩(wěn)定化能之比約為兩相的電荷轉(zhuǎn)移量之比.水溶液對該類體系中氫鍵作用具有明顯影響.
【作者單位】: 遼寧師范大學(xué)化學(xué)化工學(xué)院;
【關(guān)鍵詞】氨基酸側(cè)鏈 鳥嘌呤 胞嘧啶 氫鍵 自然鍵軌道電荷
【基金】:國家自然科學(xué)基金重點(diǎn)項(xiàng)目(批準(zhǔn)號:21133005;21473083) 遼寧省教育廳一般項(xiàng)目(批準(zhǔn)號:L2014426) 遼寧師范大學(xué)實(shí)驗(yàn)室開放項(xiàng)目(批準(zhǔn)號:cx20160111)資助~~
【分類號】:O641.3
【正文快照】: 蛋白質(zhì)和DNA作為生命體中兩種重要的物質(zhì),前者參與了生命活動的所有進(jìn)程,如催化細(xì)胞中各類化學(xué)反應(yīng)的酶,多數(shù)具有催化功能的酶常作為改變DNA結(jié)構(gòu)的工具[1,2],后者具有攜帶和傳遞遺傳信息的功能.蛋白質(zhì)-核酸的相互作用極大地影響著許多細(xì)胞過程,如在細(xì)胞的生長和分裂過程中為了

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1 馬蘭;賴瓊鈺;楊紹利;;含N三臂類肽的合成[J];西南林學(xué)院學(xué)報(bào);2008年03期

2 劉芳;盧俊瑞;陳麗然;劉倩;張明;鮑秀榮;;氯代鄰羥基芐基氨基酸的合成、表征及活性研究[J];天津理工大學(xué)學(xué)報(bào);2009年03期

3 周原;梅虎;楊力;周鵬;楊善彬;李志良;;虛擬原子探針隨機(jī)采樣法用于氨基酸結(jié)構(gòu)描述及其構(gòu)效關(guān)系研究[J];高等學(xué)校化學(xué)學(xué)報(bào);2007年07期

4 ;[J];;年期

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本文編號:1111615

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