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法醫(yī)學(xué)常用17個(gè)Y-STR的檢測及其應(yīng)用于群體遺傳學(xué)的研究

發(fā)布時(shí)間:2017-06-08 00:01

  本文關(guān)鍵詞:法醫(yī)學(xué)常用17個(gè)Y-STR的檢測及其應(yīng)用于群體遺傳學(xué)的研究,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。


【摘要】:目的 Y-STR是Y染色體上的短串聯(lián)重復(fù)序列,由于Y染色體具有的非重組性、單體性、父系遺傳等特征,使之成為研究群體遺傳多樣性的重要標(biāo)記,被廣泛應(yīng)用于個(gè)體識別、親權(quán)鑒定、基因作圖以及群體遺傳學(xué)、民族學(xué)等領(lǐng)域。目前應(yīng)用Y-STR研究人類起源、進(jìn)化和演變以及人群間的遺傳關(guān)系已在國內(nèi)外掀起熱潮。蒙古族自古就生息在我國北方草原,是一個(gè)有著悠久歷史的民族;然而,利用Y-STR數(shù)據(jù)推測蒙古族起源和進(jìn)化的研究并不多見。因此,通過對蒙古族男性17個(gè)Y-STR的檢測來研究蒙古族男性人群多態(tài)性,進(jìn)而研究與其它各族群之間的群體遺傳學(xué)關(guān)系就顯得尤為重要。本研究期望通過收集中國不同省份、不同民族的Y-STR基因座頻率數(shù)據(jù),計(jì)算不同群體間的遺傳距離,構(gòu)建不同民族、不同地區(qū)間的系統(tǒng)發(fā)生樹,來分析其遺傳距離并探討它們之間的遺傳關(guān)系。 方法 使用酚-氯仿法提取125例內(nèi)蒙古區(qū)蒙古族男性DNA,分別使用Y-FilerTM試劑盒和國產(chǎn)GoldeneyeTM試劑盒進(jìn)行PCR擴(kuò)增,再用3130XL Genetic Analyzer遺傳分析儀進(jìn)行毛細(xì)管電泳,ABI GeneMapper ID software V3.2軟件對電泳數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,獲得內(nèi)蒙古區(qū)蒙古族125例健康無關(guān)男性個(gè)體的17個(gè)Y-STR基因座遺傳多態(tài)性數(shù)據(jù)。 通過中國知網(wǎng),Pubmed等公用數(shù)據(jù)庫收集中國其它各省份、各民族群體的Y-STR基因座頻率數(shù)據(jù);將獲得的文獻(xiàn)數(shù)據(jù)與內(nèi)蒙古蒙古族的檢測數(shù)據(jù)匯總,多次篩選后統(tǒng)計(jì)出17個(gè)法醫(yī)學(xué)常用Y-STR基因座位點(diǎn)(DYS19、DYS385a/b、 DYS389Ⅰ、DYS389Ⅱ、DYS390、DYS391、DYS392、DYS393、DYS437、DYS438、 DYS439、DYS448、DYS456、DYS458、DYS635、Y-GATA-H4)在中國33個(gè)族群中的等位基因頻率,用phylip3.65統(tǒng)計(jì)軟件包計(jì)算各群體間的遺傳距離,并通過Neighbor-joining法構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)生樹,分析各族群間的遺傳關(guān)系。 結(jié)果 對125例蒙古族無關(guān)男性個(gè)體的17個(gè)Y-STR基因座進(jìn)行檢測,125例樣品共檢測出114種單倍型,其中106種單倍型僅出現(xiàn)1次,3種單倍型出現(xiàn)3次,5種單倍型出現(xiàn)2次。DYS19、DYS389Ⅰ、DYS389Ⅱ、DYS390、DYS391、DYS392、 DYS393、DYS437、DYS438、DYS439、DYS448、DYS456、DYS458、DYS635、Y-GATA-H4分別檢出了5、3、7、8、4、7、5、4、5、5、6、6、7、8、5個(gè)等位基因,DYS385a/b檢出42種單倍型。其GD值分別為0.7321、0.5907、0.7286、0.7083、0.6053、0.7350、0.6822、0.4781、0.5059、0.7474、0.7627、0.6115、0.7863、0.7708、0.6396、0.964。其中DYS437的GD值最低,為0.4781,DYS385a/b的GD值最高,為0.964。除DYS437外,其它基因座的GD值均大于0.5,結(jié)果表明17個(gè)Y-STR基因座在內(nèi)蒙古區(qū)蒙古族人群中均具有較好的多態(tài)性,適合法醫(yī)學(xué)應(yīng)用。 比較所有33個(gè)族群的17個(gè)Y-STR基因座等位基因頻率數(shù)據(jù)并計(jì)算出它們的遺傳距離,根據(jù)遺傳距離采用Neighbor-joining法構(gòu)建了33個(gè)人群之間的系統(tǒng)發(fā)生樹。在樹狀圖上,可以看出在系統(tǒng)發(fā)生樹的下半部分,臺灣泰雅族和排灣族遺傳距離較近,之后與臺灣漢族聚為一個(gè)亞類。緊接著分別與福建畬族、福建漢族、成都漢族、浙江漢族聚合。廣西的九個(gè)少數(shù)民族依次聚合后與浙江漢族所在的南方群體聚合,構(gòu)成南方人群。太原漢族和北京漢族相距較近,之后依次與蘭州漢族,河南漢族聚為一個(gè)亞類,最后和蒙古漢族、山東漢族聚合。第一部分檢測的蒙古族與新疆哈薩克族遺傳距離較近,并與蒙古漢族,山東漢族聚為一類。而湖南漢族,云南白族,云南佤族則構(gòu)成了南方漢族和北方漢族之間的過渡人群。 結(jié)論 1、對內(nèi)蒙古125例蒙古族無關(guān)男性個(gè)體17個(gè)Y-STR基因座頻率數(shù)據(jù)進(jìn)行檢測,結(jié)果表明17個(gè)Y-STR基因座在內(nèi)蒙古區(qū)蒙古族男性人群中均具有較好的多態(tài)性,適合法醫(yī)學(xué)應(yīng)用。可以為蒙古族的Y-STR數(shù)據(jù)庫、親權(quán)鑒定和法醫(yī)學(xué)個(gè)體識別等法醫(yī)學(xué)應(yīng)用提供數(shù)據(jù)支持,同時(shí)也為研究該民族基因多態(tài)性,分析人類起源、進(jìn)化、族群之間的親緣關(guān)系提供了重要理論依據(jù)。 2、中國漢族和少數(shù)民族之間在遺傳信息多態(tài)性上存在顯著差異,南方漢族人群與北方漢族人群也存在一定的遺傳距離,內(nèi)蒙古蒙古族與新疆哈薩克族遺傳距離較近,西藏藏族獨(dú)自聚為一類。
【關(guān)鍵詞】:Y-STR 蒙古族 法醫(yī)學(xué) 民族起源 群體遺傳學(xué)
【學(xué)位授予單位】:鄭州大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2014
【分類號】:D919
【目錄】:
  • 摘要4-6
  • Abstract6-11
  • 第一部分 內(nèi)蒙古自治區(qū)蒙古族17個(gè)Y-STR基因座的多態(tài)性研究11-39
  • 前言11-13
  • 材料和方法13-22
  • 1 材料13-14
  • 1.1 樣本13
  • 1.2 主要試劑13-14
  • 1.3 主要儀器14
  • 2 方法14-22
  • 2.1 DNA的提取14-16
  • 2.2 PCR擴(kuò)增16-20
  • 2.3 使用ABI3130XL測序儀進(jìn)行毛細(xì)管電泳檢測20
  • 2.4 分析結(jié)果20-21
  • 2.5 統(tǒng)計(jì)分析21-22
  • 結(jié)果22-33
  • 1、基因分型圖22-25
  • 2 17個(gè)Y-STR等位基因頻率分布表25-28
  • 3、單倍型分型結(jié)果28-33
  • 討論33-36
  • 結(jié)論36-37
  • 參考文獻(xiàn)37-39
  • 第二部分 17個(gè)Y-STR基因座用于中國境內(nèi)33個(gè)人群遺傳關(guān)系推斷的研究39-60
  • 前言39-41
  • 材料和方法41-49
  • 1 材料41
  • 2 方法41-49
  • 結(jié)果49-52
  • 討論52-56
  • 1、我國的民族分布52
  • 2 選擇Y-STR進(jìn)行統(tǒng)計(jì)研究的理由52-53
  • 3、系統(tǒng)發(fā)生樹的對比與討論53-56
  • 結(jié)論56-57
  • 參考文獻(xiàn)57-60
  • 綜述60-72
  • 參考文獻(xiàn)70-72
  • 中英文縮略詞索引72-73
  • 個(gè)人簡歷、在學(xué)期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文及研究成果73-74
  • 致謝74

【參考文獻(xiàn)】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 劉超;陳玲;陳曉輝;劉長暉;王慧君;;廣州漢族人群12個(gè)Y-STR基因座多態(tài)性及法醫(yī)學(xué)應(yīng)用研究[J];南方醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào);2007年05期

2 宋興勃;范紅;應(yīng)斌武;陸小軍;王軍;葉遠(yuǎn)馨;;成都地區(qū)漢族人群17個(gè)Y短串聯(lián)重復(fù)序列基因座遺傳多態(tài)性分析[J];南方醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào);2009年10期

3 李建伏;郭茂祖;;系統(tǒng)發(fā)生樹構(gòu)建技術(shù)綜述[J];電子學(xué)報(bào);2006年11期

4 趙方,伍新堯,蔡貴慶,許傳超;Modified-Powerstates軟件在法醫(yī)生物統(tǒng)計(jì)中應(yīng)用[J];中國法醫(yī)學(xué)雜志;2003年05期

5 王永在;王勇;黃太宇;冬日布;胡日查;徐艷麗;;內(nèi)蒙古漢族人群17個(gè)Y-STR基因座遺傳多態(tài)性[J];中國法醫(yī)學(xué)雜志;2009年02期

6 王克杰;武紅艷;楊衛(wèi)紅;;河南漢族人群16個(gè)Y-STR基因座遺傳多態(tài)性[J];中國法醫(yī)學(xué)雜志;2010年02期

7 魯滌;袁麗;楊雪;;北京漢族群體17個(gè)Y-STR基因座遺傳多態(tài)性[J];中國法醫(yī)學(xué)雜志;2010年06期

8 楊立;蔡繼峰;常云峰;文繼舫;;湖南漢族人群16個(gè)Y-STR基因座遺傳多態(tài)性[J];中國法醫(yī)學(xué)雜志;2011年02期

9 王毅,單祥年;SRY基因的研究進(jìn)展[J];國外醫(yī)學(xué).遺傳學(xué)分冊;2000年04期

10 段穩(wěn)銘,王濱有;男子不育癥的分子遺傳學(xué)研究進(jìn)展[J];國外醫(yī)學(xué).遺傳學(xué)分冊;2000年04期


  本文關(guān)鍵詞:法醫(yī)學(xué)常用17個(gè)Y-STR的檢測及其應(yīng)用于群體遺傳學(xué)的研究,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。



本文編號:430672

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