應(yīng)用高通量測序DNA甲基化差異體液識別研究
發(fā)布時間:2022-02-24 19:51
目的通過檢測和分析DNA甲基化差異的方法識別三種法庭科學(xué)犯罪現(xiàn)場常見體液(唾液斑、精液斑、血液斑)細胞來源。方法利用亞硫酸氫鹽法對唾液斑、精液斑、血液斑的DNA樣品進行甲基化處理,對由文獻[1]和實驗過程中篩選得到的甲基化位點進行illumina高通量測序,檢測三種體液斑中細胞DNA的甲基化程度,并通過BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)分析每一個位點的甲基化程度與細胞來源的關(guān)系及全部檢測位點的甲基化程度聯(lián)合與細胞來源的關(guān)系。結(jié)果運用BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)對35份樣品的73個位點的甲基化程度進行訓(xùn)練和預(yù)測,可以將唾液、精液、血液三種來源的DNA樣本分開,其準確率達到77.3%。其中精細胞在L81528位點中表現(xiàn)為高甲基化,唾液和血液表現(xiàn)為低甲基化,可將精細胞準確鑒別出來。結(jié)論本研究建立的高通量測序分析DNA甲基化差異的方法可通過增加檢測位點和樣品數(shù)量進一步提高識別體液細胞來源的準確率。
【文章來源】:中國法醫(yī)學(xué)雜志. 2019,34(02)CSCD
【文章頁數(shù)】:6 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 樣本
1.2 主要儀器與試劑
1.3 方法
1.3.1 DNA提取
1.3.2 重亞硫酸鹽處理
1.3.3 PCR擴增篩選位點的特異片段
1.3.4 Index PCR
1.3.5 PCR產(chǎn)物純化回收
1.3.6 測序及分析
2 結(jié)果
3 討論
【參考文獻】:
期刊論文
[1]生物信息學(xué)在法醫(yī)學(xué)中的應(yīng)用與展望[J]. 趙晶,唐暉,嚴江偉. 中國法醫(yī)學(xué)雜志. 2018(01)
[2]DNA甲基化在組織/體液來源鑒定中的研究進展[J]. 賈雲(yún)舒,曹中圍,張文瓊,肖超,韋甜,易少華. 中國法醫(yī)學(xué)雜志. 2016(06)
[3]DNA甲基化標記檢測方法及其法醫(yī)學(xué)應(yīng)用[J]. 周娣,王正,張霽,侯一平. 中國法醫(yī)學(xué)雜志. 2013(05)
本文編號:3643401
【文章來源】:中國法醫(yī)學(xué)雜志. 2019,34(02)CSCD
【文章頁數(shù)】:6 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 樣本
1.2 主要儀器與試劑
1.3 方法
1.3.1 DNA提取
1.3.2 重亞硫酸鹽處理
1.3.3 PCR擴增篩選位點的特異片段
1.3.4 Index PCR
1.3.5 PCR產(chǎn)物純化回收
1.3.6 測序及分析
2 結(jié)果
3 討論
【參考文獻】:
期刊論文
[1]生物信息學(xué)在法醫(yī)學(xué)中的應(yīng)用與展望[J]. 趙晶,唐暉,嚴江偉. 中國法醫(yī)學(xué)雜志. 2018(01)
[2]DNA甲基化在組織/體液來源鑒定中的研究進展[J]. 賈雲(yún)舒,曹中圍,張文瓊,肖超,韋甜,易少華. 中國法醫(yī)學(xué)雜志. 2016(06)
[3]DNA甲基化標記檢測方法及其法醫(yī)學(xué)應(yīng)用[J]. 周娣,王正,張霽,侯一平. 中國法醫(yī)學(xué)雜志. 2013(05)
本文編號:3643401
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