MtDNA SNPs復(fù)合檢測體系建立及法醫(yī)學(xué)應(yīng)用研究
發(fā)布時間:2021-01-18 05:34
生物性檢材易受外來環(huán)境等因素干擾,一直是困擾法醫(yī)生物痕跡學(xué)專家們的難點問題,如腐敗組織、陳舊骨骼等,因檢材的降解,使DNA序列的完整性受到破壞,影響鑒定結(jié)論的得出。目前國內(nèi)外法醫(yī)學(xué)實驗室應(yīng)用最為廣泛的STR檢測系統(tǒng),通常適用于常規(guī)檢材,但對微量DNA檢材、降解檢材、無核檢材等則常常因等位基因丟失、非特異性擴增、或擴增不出檢測片段,導(dǎo)致檢測失敗,至今法醫(yī)生物痕跡學(xué)(法醫(yī)物證)領(lǐng)域尚未完全解決這一難題。人類線粒體DNA (mitochondrial DNA, mtDNA)是位于細(xì)胞核以外的唯一基因組DNA,主要遵循母系遺傳,母親和子女、兄弟姐妹之間的mtDNA在理論上是一致的,個體唯一的mtDNA不存在。mtDNA是由一萬六千多個堿基對組成的環(huán)狀閉合共價雙鏈分子,外有被膜包圍,這樣的特性使其在外界環(huán)境中不易受到核酸外切酶的影響。每個細(xì)胞核DNA只有兩個拷貝,而每個細(xì)胞的mtDNA有成千上萬個拷貝,突變率是核DNA的5~10倍,但在外界環(huán)境中更易保存下來,擴增時拷貝數(shù)更高,對于考古、大型災(zāi)難調(diào)查、親緣關(guān)系認(rèn)定、核DNA分型失敗的法醫(yī)學(xué)檢材等,mtDNA遺傳標(biāo)記具有良好的應(yīng)用前景。單核苷酸多態(tài)...
【文章來源】:南方醫(yī)科大學(xué)廣東省
【文章頁數(shù)】:104 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
GenescanTM一120LIZTM電泳圖譜
離編輯hins,用于分析電泳結(jié)果的基因型。孫論200時認(rèn)為是陽性信號,可判讀基因型。圖2一 1GenescanTM一120LIZTM電泳圖譜FigZ一 1Eleetrophorogram。 roeneseanTM一 120LlzTMsizestandard
引物與模板互補的序列到其3’端的距離不超過30核昔酸,如果所需引物的總長度超過30個單核昔酸,則通過在sBE引物5’端加入不同長度的 poly-T[29J/Poly-C124]調(diào)整(圖2一6)。根據(jù)選擇位點的堿基變異類型進行設(shè)計延伸引物,如一位點為“刀C,,突變,另一位點為‘℃廳”突變,用相同或相近長度的單堿基延伸引物同時檢測兩個位點的兩種多態(tài)性,在4一6個堿基的間隔范圍內(nèi)檢測更多SNPs位點。當(dāng)利用正義鏈無法設(shè)計出理想的正向引物,可根據(jù)反義鏈設(shè)計反向引物,檢測的變異類型與報道的互補。引物由大連寶生物公司合成,引物為PAGE純化。各位點單堿基延伸引物見表2一2所示:
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]濰坊地區(qū)11個mtSNP位點單倍型頻率調(diào)查[J]. 王新杰,羅莉靜,許欣,魏金葉. 法醫(yī)學(xué)雜志. 2008(04)
[2]應(yīng)用mAPLP方法分析湖南漢族、苗族和土家族mtDNA編碼區(qū)多態(tài)性[J]. 周海燕,倪斌,鄒永華,張蕊,陳勇. 遺傳. 2008(06)
[3]正交實驗法在PCR反應(yīng)條件優(yōu)化中的應(yīng)用[J]. 楊水云,李續(xù)娥,吳明宇,孫飛龍,李劍君. 生物數(shù)學(xué)學(xué)報. 2005(02)
[4]影響多重PCR擴增效果的因素[J]. 黃銀花,胡曉湘,徐慰倬,高宇,馮繼東,孫漢,李寧. 遺傳. 2003(01)
[5]用SnaP Shot的方法對線粒體7146位點進行基因分型[J]. 柯玉雄,衛(wèi)燦東,金建中,金力. 復(fù)旦學(xué)報(自然科學(xué)版). 2002(06)
[6]過量DMSO顯著降低低模板濃度PCR擴增的特異性[J]. 肖志壯,曲音波,汪天虹,高培基,劉夢海. 遺傳. 2001(04)
[7]DMSO對PCR擴增反應(yīng)的影響[J]. 徐葵,邱志明,汪曉英. 昆明醫(yī)學(xué)院學(xué)報. 2001(01)
[8]PCR反應(yīng)條件的優(yōu)化[J]. 袁長青,李平,李君文. 中國公共衛(wèi)生. 1999(03)
[9]提高PCR擴增大DNA片段的特異性和產(chǎn)量[J]. 盧一凡,鄧?yán)^先,肖成祖,馬清鈞. 遺傳. 1996(05)
博士論文
[1]微測序法檢測Y-SNP和mt-SNP的研究[D]. 杜宏.四川大學(xué) 2006
本文編號:2984377
【文章來源】:南方醫(yī)科大學(xué)廣東省
【文章頁數(shù)】:104 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
GenescanTM一120LIZTM電泳圖譜
離編輯hins,用于分析電泳結(jié)果的基因型。孫論200時認(rèn)為是陽性信號,可判讀基因型。圖2一 1GenescanTM一120LIZTM電泳圖譜FigZ一 1Eleetrophorogram。 roeneseanTM一 120LlzTMsizestandard
引物與模板互補的序列到其3’端的距離不超過30核昔酸,如果所需引物的總長度超過30個單核昔酸,則通過在sBE引物5’端加入不同長度的 poly-T[29J/Poly-C124]調(diào)整(圖2一6)。根據(jù)選擇位點的堿基變異類型進行設(shè)計延伸引物,如一位點為“刀C,,突變,另一位點為‘℃廳”突變,用相同或相近長度的單堿基延伸引物同時檢測兩個位點的兩種多態(tài)性,在4一6個堿基的間隔范圍內(nèi)檢測更多SNPs位點。當(dāng)利用正義鏈無法設(shè)計出理想的正向引物,可根據(jù)反義鏈設(shè)計反向引物,檢測的變異類型與報道的互補。引物由大連寶生物公司合成,引物為PAGE純化。各位點單堿基延伸引物見表2一2所示:
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]濰坊地區(qū)11個mtSNP位點單倍型頻率調(diào)查[J]. 王新杰,羅莉靜,許欣,魏金葉. 法醫(yī)學(xué)雜志. 2008(04)
[2]應(yīng)用mAPLP方法分析湖南漢族、苗族和土家族mtDNA編碼區(qū)多態(tài)性[J]. 周海燕,倪斌,鄒永華,張蕊,陳勇. 遺傳. 2008(06)
[3]正交實驗法在PCR反應(yīng)條件優(yōu)化中的應(yīng)用[J]. 楊水云,李續(xù)娥,吳明宇,孫飛龍,李劍君. 生物數(shù)學(xué)學(xué)報. 2005(02)
[4]影響多重PCR擴增效果的因素[J]. 黃銀花,胡曉湘,徐慰倬,高宇,馮繼東,孫漢,李寧. 遺傳. 2003(01)
[5]用SnaP Shot的方法對線粒體7146位點進行基因分型[J]. 柯玉雄,衛(wèi)燦東,金建中,金力. 復(fù)旦學(xué)報(自然科學(xué)版). 2002(06)
[6]過量DMSO顯著降低低模板濃度PCR擴增的特異性[J]. 肖志壯,曲音波,汪天虹,高培基,劉夢海. 遺傳. 2001(04)
[7]DMSO對PCR擴增反應(yīng)的影響[J]. 徐葵,邱志明,汪曉英. 昆明醫(yī)學(xué)院學(xué)報. 2001(01)
[8]PCR反應(yīng)條件的優(yōu)化[J]. 袁長青,李平,李君文. 中國公共衛(wèi)生. 1999(03)
[9]提高PCR擴增大DNA片段的特異性和產(chǎn)量[J]. 盧一凡,鄧?yán)^先,肖成祖,馬清鈞. 遺傳. 1996(05)
博士論文
[1]微測序法檢測Y-SNP和mt-SNP的研究[D]. 杜宏.四川大學(xué) 2006
本文編號:2984377
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