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延邊朝鮮族和漢族人群15個常染色體STR基因座遺傳多態(tài)性

發(fā)布時間:2018-08-22 19:20
【摘要】:目的:通過對中國吉林省延邊地區(qū)朝鮮族人群與漢族人群常染色體上CSF1PO、D7S820、D8S1179、D21S11、D2S1338、D3S1358、D13S317、D16S539、TH01、D18S51、D19S433、TPOX、vWA、D5S818、FGA 這十五個 STR基因座的檢測和數(shù)據(jù)分析,評價其法醫(yī)學價值,為法醫(yī)學個體識別、親權鑒定、人類遺傳學及其他相關學科提供參考數(shù)據(jù)。方法:研究對象選取延邊朝鮮族無血緣個體血樣224例,延邊漢族無血緣個體血樣407例,全部血樣均按照Chelex-100方法來進行DNA的提取,獲取的DNA 樣本通過 AmpFlSTR(?)Identifiler(?)Plus PCR Amplification Kit 擴增常染色體中十五個STR基因座。擴增后產物的檢測使用ABI310型DNA序列分析儀來完成,檢測出來的數(shù)據(jù)通過GeneScan Analysis3.7和Genetyper3.7這兩種基因分析軟件來處理。針對研究中涉及的十五個STR基因座的多態(tài)性參數(shù)按照Modified-Powerstates標準版的計算模式來處理。同時,選擇中國境內6個民族群體以及5個外國民族群體常染色體中的這十五個STR基因座進行對比分析,為群體遺傳學的研究提供基礎數(shù)據(jù)資料。根據(jù)POPTREE2軟件的Neighbour-Joining(N-J)法設計的研究模式,按照等位基因頻率來確定遺傳距離,最終形成完整的系統(tǒng)進化樹。結果:延邊朝鮮族人群中的15個STR基因座共檢出等位基因157個,基因頻率在0.001-0.513之間;共檢出基因型415種,基因型頻率在0.004-0.317之間;雜合度分布在0.625-0.866之間,平均雜合度為0.7732,多態(tài)信息含量(PIC)分布在0.57-0.85之間,個人識別力(DP)在0.800-0.966之間,累計個人識別力(TDP)大于0.999999999,非父排除率(EP)分布在0.322-0.727之間,累計非父排除率(CEP)大于0.99999729延邊漢族人群中的15個STR基因座共檢出等位基因158個,基因頻率在0.001-0.546之間;共檢出基因型531種,基因型頻率在0.002-0.309之間;雜合度分布在0.604-0.853之間,平均雜合度為0.7712,多態(tài)信息含量(PIC)分布在0.55-0.85之間,個人識別力(DP)在0.790-0.966之間,累計個人識別力(TDP)大于0.999999999,非父排除率(EP)分布在0.296-0.700之間,累計非父排除率(CEP)大于0.99999763中國吉林省延邊地區(qū)的朝鮮族與漢族這兩個民族群體在進行遺傳距離的分析中可以看出,周邊其他民族群體與朝、漢兩民族群體之間的遺傳距離要明顯小于地理位置更遠的其他民族群體。延邊朝鮮族和漢族與國內外11個民族群體的系統(tǒng)進化樹結果顯示延邊朝鮮族與韓國之間的親緣關系最近。結論:延邊朝鮮族和漢族的15個STR基因座中除TH01、D3S1358與T0PX外其它均顯示高度多態(tài)性遺傳性,適合朝鮮族和漢族群體法醫(yī)學鑒定。延邊朝鮮族、漢族和其他群體之間均存在不同程度的差異性,可闡明建立群體數(shù)據(jù)庫的必要性。
[Abstract]:Objective: to evaluate the forensic value of 15 STR loci of CSF1POP D7S820 D8S1179, D21S1138 D3S1358, D16S539, TH01S51D19S433TPOXVWAD5S818FGA, based on the detection and data analysis of 15 STR loci in Korean and Han populations in Yanbian area, Jilin Province, China, and to evaluate the forensic value of D21S11S1338, D13S517, D16S539 and TH01S51D19S433TPOXVWAXD5S818FGA. Human genetics and other related disciplines provide reference data. Methods: two hundred and twenty-four unrelated individuals of Yanbian Korean nationality and 407 Han nationality of Yanbian Han nationality were selected to extract DNA according to Chelex-100 method. Fifteen STR loci of autosomes were amplified by AmpFlSTR (?) Identifiler (?) Plus PCR Amplification Kit) from the obtained DNA samples. ABI310 DNA sequence analyzer was used to detect the amplified products. The detected data were processed by GeneScan Analysis3.7 and Genetyper3.7. The polymorphic parameters of 15 STR loci involved in the study were treated according to the calculation model of Modified-Powerstates Standard Edition. At the same time, the 15 STR loci of 6 ethnic groups and 5 foreign ethnic groups in China were selected for comparative analysis, which provided basic data for the study of population genetics. According to the research model designed by Neighbour-Joining (N-J) method of POPTREE2 software, genetic distance is determined according to allele frequency, and a complete phylogenetic tree is formed. Results: a total of 157 alleles were detected in 15 STR loci in Yanbian Korean population, with a frequency of 0.001-0.513, a total of 415 genotypes (0.004-0.317), heterozygosity between 0.625 and 0.866, a total of 415 genotypes (0.004-0.317) and heterozygosity (0.625-0.866). The average heterozygosity was 0.7732, the polymorphic information content (PIC) was between 0.57-0.85, the personal recognition power (DP) was between 0.800-0.966, the cumulative personal recognition power (TDP) was greater than 0.99999999 9, and the non-paternal exclusion rate (EP) was 0.322-0.727. The cumulative non-paternal exclusion rate (CEP) of 15 STR loci in Yanbian Han population was greater than 0.99999729, with a total of 158 alleles with a gene frequency of 0.001-0.546, a total of 531 genotypes with genotype frequencies ranging from 0.002-0.309, and heterozygosity between 0.604-0.853. The average heterozygosity was 0.7712, the polymorphic information content (PIC) was between 0.55-0.85, the personal recognition power (DP) was between 0.790-0.966, the cumulative personal recognition power (TDP) was greater than 0.99999999 9, and the non-paternal exclusion rate (EP) was 0.296-0.700. The cumulative non-paternal exclusion rate (CEP) of the Korean and Han ethnic groups in Yanbian region of Jilin Province, China, is greater than 0.99999763. In the analysis of genetic distance, it can be seen that the surrounding ethnic groups and the DPRK, The genetic distance between Han and Han ethnic groups is obviously smaller than that of other ethnic groups with farther geographical location. The phylogenetic tree of Yanbian Korean and Han ethnic groups and 11 ethnic groups at home and abroad showed that Yanbian Korean nationality had the closest phylogenetic relationship with Korea. Conclusion: the 15 STR loci of Yanbian Korean and Han nationality showed highly polymorphic inheritance except TH01D3S1358 and T0PX, which are suitable for forensic identification of Korean and Han populations. There are some differences among Korean, Han and other groups in Yanbian, which can clarify the necessity of establishing group database.
【學位授予單位】:延邊大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2017
【分類號】:D919

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本文編號:2198062

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