基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的畬藥“十二時(shí)辰”治療類風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎的機(jī)制研究
發(fā)布時(shí)間:2020-10-26 04:29
目的:分析畬藥“十二時(shí)辰”治療類風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎(Rheumatoid Arthritis,RA)的有效成分及可能作用機(jī)制。方法:通過文獻(xiàn)挖掘并利用TCMSP等數(shù)據(jù)庫(kù)獲取畬藥“十二時(shí)辰”的已知化學(xué)成分和相關(guān)靶點(diǎn);將獲得的靶點(diǎn)信息與Drug Bank數(shù)據(jù)庫(kù)中抗RA藥物靶點(diǎn)進(jìn)行映射,分析藥物治療RA的可能性;利用Cytoscape軟件分別構(gòu)建“成分-靶點(diǎn)”網(wǎng)絡(luò)和“十二時(shí)辰抗RA靶點(diǎn)-人體蛋白”蛋白質(zhì)互作(PPI)網(wǎng)絡(luò),分析網(wǎng)絡(luò)拓?fù)浣Y(jié)構(gòu);利用David數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行GO富集和KEGG分析,分析藥物治療RA的可能分子機(jī)制。結(jié)果:畬藥“十二時(shí)辰”含有油酸、棕櫚酸、齊墩果酸、十五烷酸等潛在抗RA化合物,潛在抗RA關(guān)鍵靶點(diǎn)為前列腺素G/H合成酶1、2和凋亡調(diào)節(jié)因子Bcl-2等; GO結(jié)果提示其治療RA的基因功能主要體現(xiàn)在炎癥反應(yīng)、凋亡過程負(fù)調(diào)節(jié)、NF-κB轉(zhuǎn)錄因子活性正調(diào)節(jié)、蛋白質(zhì)同源二聚化活性等方面;KEGG結(jié)果暗示主要相關(guān)信號(hào)通路有TNF、PI3K-Akt、Rheumatoid arthritis、Toll樣受體和MAPK等信號(hào)通路。結(jié)論:畬藥“十二時(shí)辰”可能通過多靶點(diǎn)、多信號(hào)途徑的相互作用,抑制成纖維樣滑膜細(xì)胞的異常增殖,減輕炎癥反應(yīng),發(fā)揮治療RA的作用。
【部分圖文】:
另外,網(wǎng)絡(luò)的拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)分析結(jié)果表明:網(wǎng)絡(luò)集中度為0.299,網(wǎng)絡(luò)密度為0.038,網(wǎng)絡(luò)異質(zhì)性為1.594,最短路徑為2808(67%),節(jié)點(diǎn)平均中介中心度為0.044,大于平均中介中心度的節(jié)點(diǎn)有10個(gè)。這說明“十二時(shí)辰”中含有的化合物可能作用于整個(gè)生物網(wǎng)絡(luò)系統(tǒng),而非單一作用于某一個(gè)蛋白靶點(diǎn),從而提示了“十二時(shí)辰”作用的整體性和復(fù)雜性。2.4“十二時(shí)辰抗RA靶點(diǎn)-人體蛋白”PPI網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建與分析
以HPRD數(shù)據(jù)庫(kù)中獲取的人體蛋白互作數(shù)據(jù)作為背景網(wǎng)絡(luò),與21個(gè)“十二時(shí)辰”抗RA靶點(diǎn),構(gòu)建“十二時(shí)辰抗RA靶點(diǎn)-人體蛋白”PPI網(wǎng)絡(luò),如圖2所示。各靶點(diǎn)相應(yīng)的度值見表4,根據(jù)表格可發(fā)現(xiàn)靶點(diǎn)Bcl-2、前列腺素G/H合成酶1和前列腺素G/H合成酶2的度值排名均較靠前,結(jié)合2.3進(jìn)一步證實(shí)了這3個(gè)靶點(diǎn)在“十二時(shí)辰”治療RA中具有重要作用。圖3“十二時(shí)辰”化學(xué)成分抗RA相關(guān)靶點(diǎn)GO富集分析
“十二時(shí)辰”化學(xué)成分抗RA相關(guān)靶點(diǎn)GO富集分析
本文編號(hào):2856493
【部分圖文】:
另外,網(wǎng)絡(luò)的拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)分析結(jié)果表明:網(wǎng)絡(luò)集中度為0.299,網(wǎng)絡(luò)密度為0.038,網(wǎng)絡(luò)異質(zhì)性為1.594,最短路徑為2808(67%),節(jié)點(diǎn)平均中介中心度為0.044,大于平均中介中心度的節(jié)點(diǎn)有10個(gè)。這說明“十二時(shí)辰”中含有的化合物可能作用于整個(gè)生物網(wǎng)絡(luò)系統(tǒng),而非單一作用于某一個(gè)蛋白靶點(diǎn),從而提示了“十二時(shí)辰”作用的整體性和復(fù)雜性。2.4“十二時(shí)辰抗RA靶點(diǎn)-人體蛋白”PPI網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建與分析
以HPRD數(shù)據(jù)庫(kù)中獲取的人體蛋白互作數(shù)據(jù)作為背景網(wǎng)絡(luò),與21個(gè)“十二時(shí)辰”抗RA靶點(diǎn),構(gòu)建“十二時(shí)辰抗RA靶點(diǎn)-人體蛋白”PPI網(wǎng)絡(luò),如圖2所示。各靶點(diǎn)相應(yīng)的度值見表4,根據(jù)表格可發(fā)現(xiàn)靶點(diǎn)Bcl-2、前列腺素G/H合成酶1和前列腺素G/H合成酶2的度值排名均較靠前,結(jié)合2.3進(jìn)一步證實(shí)了這3個(gè)靶點(diǎn)在“十二時(shí)辰”治療RA中具有重要作用。圖3“十二時(shí)辰”化學(xué)成分抗RA相關(guān)靶點(diǎn)GO富集分析
“十二時(shí)辰”化學(xué)成分抗RA相關(guān)靶點(diǎn)GO富集分析
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