2型糖尿病脾虛證患者血清microRNA表達譜和生物信息學分析(英文)
本文選題:脾虛證 + 型糖尿病; 參考:《中華中醫(yī)藥雜志》2017年08期
【摘要】:目的:通過對2型糖尿病脾虛證患者血清micro RNA(miRNA)表達譜和生物信息學分析,從miRNA水平上探討脾虛證的發(fā)病機制和辨證分型。方法:選擇5例2型糖尿病脾虛證患者和5名健康志愿者,從他們的血清標本中提取RNA,進行miRNA定量PCR芯片實驗。篩選出兩組之間差異表達的miRNA,利用miRSystem數(shù)據(jù)庫進行靶基因預測和功能注釋。結果:在2型糖尿病脾虛證患者和健康志愿者的血清中發(fā)現(xiàn)16個差異表達的miRNA。聚類分析顯示,這16個差異表達的miRNA能夠將2型糖尿病脾虛證患者和健康志愿者很好的區(qū)分。靶基因預測和功能注釋顯示,14個上調miRNA的調控122個靶基因顯著富集到6個KEGG通路和6個GO分子功能。這些富集的KEGG通路包括與脂肪酸、氨基酸和2型糖尿病相關的營養(yǎng)物質代謝通路,鈣離子信號通路,致病的大腸桿菌感染通路和亨廷頓氏舞蹈病通路。這些富集的GO分子功能包括羧酸、脂類、輔因子和藥物結合功能,和酶激活劑和轉錄抑制劑活性功能。然而,2個下調miRNA調控的10個靶基因顯著富集到2個KEGG通路。它們是內質網(wǎng)中的蛋白質加工通路和志賀氏菌病通路。結論:本研究可能為2型糖尿病脾虛證患者的臨床辨證提供了一些血清miRNA標志物,同時從miRNA水平上為脾虛證患者的發(fā)病機制提供了依據(jù)。
[Abstract]:Objective: to investigate the pathogenesis and syndrome differentiation of spleen deficiency syndrome by analyzing the expression profile and bioinformatics of serum micro RNA in type 2 diabetic patients with spleen deficiency syndrome. Methods: five patients with type 2 diabetes mellitus with spleen deficiency syndrome and five healthy volunteers were selected to extract RNAs from their serum samples and carry out miRNA quantitative PCR chip experiments. The differentially expressed miRNAs between the two groups were screened, and the target gene prediction and functional annotation were carried out by using the miRSystem database. Results: sixteen differentially expressed miRNAs were found in the sera of type 2 diabetic patients with spleen deficiency syndrome and healthy volunteers. Cluster analysis showed that the 16 differentially expressed miRNAs could distinguish between type 2 diabetes mellitus patients with spleen deficiency syndrome and healthy volunteers. Target gene prediction and functional annotation showed that 14 up-regulated miRNA-regulated 122 target genes were significantly enriched to 6 KEGG pathways and 6 go molecules. These enriched KEGG pathways include nutrient metabolic pathways associated with fatty acids, amino acids and type 2 diabetes, calcium signaling pathways, pathogenic Escherichia coli infection pathways and Huntington's chorea pathway. These enriched go molecular functions include carboxylic acids, lipids, cofactors and drug binding functions, and enzyme activators and transcription inhibitor activities. However, 10 target genes down-regulated miRNA were significantly enriched into 2 KEGG pathways. They are protein processing pathway and Shigella pathway in endoplasmic reticulum. Conclusion: this study may provide some serum miRNA markers for the patients with spleen deficiency syndrome in type 2 diabetes mellitus and provide evidence for the pathogenesis of spleen deficiency syndrome from the level of miRNA.
【作者單位】: 廣東藥科大學基礎學院生物化學與分子生物學系;廣東藥科大學附屬第一醫(yī)院中醫(yī)科;廣州中醫(yī)藥大學脾胃研究所;廣東藥科大學附屬第一醫(yī)院檢驗科;
【基金】:National Natural Science Foundation of China(No.81102703) Science and Technology Planning Project of Guangdong Province(No.2013A032500005) Administration of Traditional Chinese Medicine of Guangdong Province(No.20123001) Natural Science Foundation for Fostering of Guangdong Pharmaceutical University(No.GYFYLH201303)~~
【分類號】:R259
【參考文獻】
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,本文編號:2014988
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