磷酸果糖激酶相關(guān)微小RNA影響腫瘤細(xì)胞糖代謝的機(jī)制研究
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【摘要】:背景及意義癌癥是嚴(yán)重威脅人類健康的惡性疾病之一。在所有癌癥中,肺癌是男性死亡人數(shù)最多、女性死亡人數(shù)高居第二位的惡性腫瘤。與正常細(xì)胞通過線粒體進(jìn)行氧化磷酸化不同的是,癌細(xì)胞主要通過糖酵解過程獲得生命活動(dòng)所需要的能量,產(chǎn)生大量乳酸和少量ATP,這種現(xiàn)象被稱作瓦博格效應(yīng)(Warburg effect)。磷酸果糖激酶(phosphofructokinase, PFK)是糖酵解途徑中最關(guān)鍵的限速酶,它能夠催化6-磷酸果糖反應(yīng)生成1,6-二磷酸果糖。微小RNA (microRNA, miRNA)是一類內(nèi)源性的、在進(jìn)化上非常保守的、其長(zhǎng)度約為22個(gè)核苷酸的非編碼小RNA。經(jīng)過一系列加工,成熟的miRNA能夠完全或不完全地與nRNA的3'端非翻譯區(qū)結(jié)合,通過抑制翻譯或使得靶向mRNA降解來調(diào)節(jié)基因表達(dá)。越來越多的研究表明,niRNA在腫瘤的發(fā)生、發(fā)展中具有重要的作用;除了能夠抑制癌細(xì)胞的增殖、促進(jìn)癌細(xì)胞的凋亡外,miRNA還能通過調(diào)控糖代謝途徑中的酶,來調(diào)節(jié)糖代謝途徑,但是否存在niRNA通過靶向PFK,從而調(diào)控癌細(xì)胞糖酵解途徑,目前尚不清楚。本研究旨在闡明PFK相關(guān)miRN A調(diào)控肺癌細(xì)胞糖代謝的機(jī)制,為分子靶向藥物的研發(fā)提供理論依據(jù)。方法(1)通過查閱、分析文獻(xiàn),篩選出適合于進(jìn)一步研究的肝型磷酸果糖激酶(PFK liver type, PFKL) 。(2)運(yùn)用生物信息學(xué)方法篩選,發(fā)現(xiàn)miR-128與PFKL之間存在潛在的靶點(diǎn)關(guān)系。(3)根據(jù)miRNA合成原則,設(shè)計(jì)合成miR-128的mimics、inhibitor及其對(duì)應(yīng)的陰性對(duì)照。用Lipofectamine 2000裝miR-128的mimics和inhibitor分別轉(zhuǎn)染NCI-H460 及 NCI-H1299細(xì)胞,以分別升高或降低細(xì)胞中miR-128的水平。運(yùn)用實(shí)時(shí)熒光定量PCR (qRT-PCR)分析轉(zhuǎn)染后,miR-128在細(xì)胞中的表達(dá)變化,以確認(rèn)轉(zhuǎn)染效果。(4)用qRT-PCR分析轉(zhuǎn)染相對(duì)應(yīng)的RNAs之后,細(xì)胞內(nèi)PFKL在nRNA水平的表達(dá)變化;Western blot分析PFKL在蛋白水平的表達(dá)變化。(5)通過雙熒光素酶報(bào)告分析系統(tǒng),進(jìn)一步確認(rèn)niR-128與PFKL之間的靶點(diǎn)關(guān)系。(6)運(yùn)用MTT、結(jié)晶紫染色法分別分析轉(zhuǎn)染RNAs之后,對(duì)細(xì)胞生長(zhǎng)及克隆形成的影響;熒光光度法分析轉(zhuǎn)染RNAs之后,對(duì)細(xì)胞內(nèi)ATP含量變化的影響;分光光度法分析轉(zhuǎn)染RNAs之后,對(duì)細(xì)胞葡萄糖攝入量和乳酸生成量的影響。評(píng)價(jià)miR-128表達(dá)水平的變化對(duì)肺癌細(xì)胞糖代謝的影響。(7) qRT-PCR分析干擾AKT信號(hào)通路對(duì)miR-128及PFKL表達(dá)的影響。(8)通過Western blot分析異常表達(dá)miR-128之后,對(duì)總AKT及磷酸化AKT表達(dá)量的影響,分析niR-128調(diào)控糖酵解的機(jī)制。結(jié)果(1)PFKL在肺癌細(xì)胞NCI-H460中相對(duì)高表達(dá);miR-128在NCI-H1299中相對(duì)高表達(dá);miR-128的表達(dá)與PFKL的表達(dá)呈負(fù)相關(guān)。(2)生物信息學(xué)篩選發(fā)現(xiàn),PFKL是miR-128的潛在靶點(diǎn),雙熒光素酶報(bào)告分析進(jìn)一步驗(yàn)證了它們之間存在的靶點(diǎn)關(guān)系。同時(shí),miR-128表達(dá)水平上調(diào)能抑制PFKL在mRNA水平及蛋白水平的表達(dá);反之,抑制miR-128的表達(dá),則能促進(jìn)PFKL在mRNA水平及蛋白水平的表達(dá)。共轉(zhuǎn)染miR-128與PFKL的過表達(dá)載體,能夠補(bǔ)救由miR-128引起的PFKL的表達(dá)下降。(3)上調(diào)miR-128的表達(dá)能夠抑制肺癌細(xì)胞的生長(zhǎng)以及克隆的形成;而抑制miR-128的表達(dá),則能促進(jìn)肺癌細(xì)胞的生長(zhǎng)以及克隆的形成;干擾PFKL的表達(dá)能夠抑制肺癌細(xì)胞的生長(zhǎng)以及克隆的形成,過表達(dá)PFKL能夠促進(jìn)肺癌細(xì)胞的生長(zhǎng)以及克隆的形成。(4)在臨床患病樣本中,PFKL的表達(dá)顯著高于正常樣本;而miR-128在臨床患病樣本中的表達(dá)則顯著低于正常樣本;在臨床患病樣本中,miR-128的表達(dá)與PFKL的表達(dá)呈負(fù)相關(guān)。(5)上調(diào)miR-128的表達(dá)能夠使得肺癌細(xì)胞內(nèi)ATP含量增加、葡萄糖攝入量減少以及乳酸生成量減少;而抑制miR-128的表達(dá),則使得肺癌細(xì)胞內(nèi)ATP含量減少、葡萄糖攝入量增加以及乳酸生成量增加;干擾PFKL的表達(dá)能夠使得肺癌細(xì)胞內(nèi)ATP含量增加、葡萄糖攝入量減少以及乳酸生成量減少,過表達(dá)PFKL能夠減少肺癌細(xì)胞內(nèi)ATP含量,增加葡萄糖攝入量以及乳酸生成量。(6)干擾AKT信號(hào)通路能夠促進(jìn)miR-128的表達(dá);相反,干擾AKT信號(hào)通路則顯著抑制PFKL在mRNA水平的表達(dá)。(7)過表達(dá)miR-128能夠顯著降低磷酸化AKT的表達(dá);相反,抑制miR-128的表達(dá)對(duì)磷酸化AKT的表達(dá)無明顯影響;異常表達(dá)的miR-128對(duì)總AKT水平無明顯影響。結(jié)論本研究闡明了miR-128與PFKL之間的靶點(diǎn)調(diào)控機(jī)制,進(jìn)一步驗(yàn)證了miRNAs對(duì)糖酵解途徑中關(guān)鍵限速酶的調(diào)控作用。同時(shí),研究表明,miR-128通過調(diào)控糖酵解途徑中的最為關(guān)鍵的限速酶PFKL (PFK liver type),從而對(duì)肺癌細(xì)胞內(nèi)ATP含量、肺癌細(xì)胞葡萄糖攝入量以及乳酸生成量產(chǎn)生影響。我們的研究結(jié)果還表明,miR-128對(duì)糖酵解過程的調(diào)節(jié),可能是通過AKT信號(hào)通路來完成的。這些結(jié)果說明,miRNA在肺癌細(xì)胞的糖酵解途徑中起著重要的作用;同時(shí),miR-128可能作為肺癌治療的新靶點(diǎn)。
【關(guān)鍵詞】:微小RNA128 肝型磷酸果糖激酶 肺癌 糖酵解 代謝
【學(xué)位授予單位】:寧波大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2015
【分類號(hào)】:R730.2
【目錄】:
- 摘要4-7
- Abstract7-13
- 引言13-15
- 1 實(shí)驗(yàn)方案設(shè)計(jì)15-20
- 1.1 實(shí)驗(yàn)的目的及意義15
- 1.2 研究?jī)?nèi)容15-16
- 1.2.1 miR-128的靶點(diǎn)確認(rèn)分析15
- 1.2.2 miR-128及PFKL在肺癌細(xì)胞中的初始表達(dá)分析15
- 1.2.3 miR-128對(duì)PFKL的表達(dá)調(diào)控分析15
- 1.2.4 異常表達(dá)miR-128或PFKL對(duì)細(xì)胞生長(zhǎng)以及克隆形成的影響15-16
- 1.2.5 臨床樣本分析16
- 1.2.6 PFKL表達(dá)量與患者總體生存率的相關(guān)性分析16
- 1.2.7 異常表達(dá)miR-128或PFKL對(duì)細(xì)胞葡萄糖攝入及乳酸生成的影響16
- 1.2.8 異常表達(dá)miR-128或PFKL對(duì)細(xì)胞內(nèi)ATP含量的影響16
- 1.2.9 miR-128作用于PFKL的機(jī)制分析16
- 1.3 技術(shù)路線圖16-17
- 1.4 實(shí)驗(yàn)方案17-20
- 1.4.1 肺正常上皮細(xì)胞及肺癌細(xì)胞的培養(yǎng)17-18
- 1.4.2 細(xì)胞總RNA提取及qRT-PCR18
- 1.4.3 雙熒光素酶報(bào)告分析18
- 1.4.4 miR-128對(duì)PFKL的蛋白調(diào)控分析18
- 1.4.5 MTT分析18
- 1.4.6 結(jié)晶紫染色法18
- 1.4.7 臨床血液樣本中PFKL及miR-128表達(dá)分析18
- 1.4.8 KM-plot分析18
- 1.4.9 葡萄糖攝入量及乳酸生成量的測(cè)定18
- 1.4.10 ATP含量的測(cè)定18-19
- 1.4.11 miR-128調(diào)控PFKL的作用機(jī)制分析19
- 1.4.12 數(shù)據(jù)總結(jié)分析19-20
- 2 實(shí)驗(yàn)材料與方法20-42
- 2.1 實(shí)驗(yàn)材料20-30
- 2.1.1 主要實(shí)驗(yàn)儀器20-21
- 2.1.2 主要試劑耗材21-24
- 2.1.3 實(shí)驗(yàn)細(xì)胞株、菌株及載體24
- 2.1.4 肺癌患者及健康志愿者血液樣本收集24
- 2.1.5 主要試劑及配制24-30
- 2.2 實(shí)驗(yàn)方法30-42
- 2.2.1 細(xì)胞培養(yǎng)和傳代30
- 2.2.2 細(xì)胞復(fù)蘇30-31
- 2.2.3 細(xì)胞凍存31
- 2.2.4 細(xì)胞計(jì)數(shù)31
- 2.2.5 合成RNAs31
- 2.2.6 轉(zhuǎn)染RNAs31-32
- 2.2.7 總RNA提取32
- 2.2.8 RNA純度分析32
- 2.2.9 逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)32-33
- 2.2.10 質(zhì)粒的構(gòu)建33-35
- 2.2.11 無內(nèi)毒素質(zhì)粒提取35
- 2.2.12 雙熒光素酶報(bào)告分析相關(guān)操作35-36
- 2.2.13 普通PCR和qRT-PCR36-38
- 2.2.14 Western blot檢測(cè)蛋白表達(dá)38-39
- 2.2.15 MTT分析細(xì)胞生長(zhǎng)情況39-40
- 2.2.16 細(xì)胞克隆形成實(shí)驗(yàn)40
- 2.2.17 臨床血液樣本中PFKL及miR-128表達(dá)測(cè)定40
- 2.2.18 KM-plot分析相關(guān)操作40
- 2.2.19 細(xì)胞葡萄糖攝入量的測(cè)定40
- 2.2.20 細(xì)胞內(nèi)乳酸含量的測(cè)定40
- 2.2.21 細(xì)胞內(nèi)ATP含量測(cè)定40
- 2.2.22 miR-128調(diào)控PFKL的機(jī)制分析40
- 2.2.23 統(tǒng)計(jì)方法40-42
- 3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果42-59
- 3.1 篩選出PFKL相關(guān)的miRNA42
- 3.2 成功構(gòu)建PFKL 3’UTR野生型及突變型載體42-43
- 3.3 PFKL是miR-128的直接靶點(diǎn)43-45
- 3.4 PFKL在NCI-H460中相對(duì)高表達(dá),miR-128在NCI-H1299中相對(duì)高表達(dá)45
- 3.5 成功構(gòu)建PFKL過表達(dá)載體45-46
- 3.6 miR-128抑制PFKL在mRNA及蛋白水平的表達(dá)46-49
- 3.7 過表達(dá)PFKL能夠補(bǔ)救由miR-128引起的PFKL mRNA水平降低49-50
- 3.8 過表達(dá)PFKL能夠補(bǔ)救由miR-128引起的PFKL蛋白水平的降低50-51
- 3.9 miR-128能夠抑制肺癌細(xì)胞的生長(zhǎng)及克隆的形成51-52
- 3.10 miR-128的表達(dá)與PFKL的表達(dá)呈負(fù)相關(guān)52-54
- 3.11 miR-128介導(dǎo)代謝方式的轉(zhuǎn)變54-56
- 3.12 miR-128通過AKT信號(hào)通路來調(diào)控PFKL56-57
- 3.13 異常表達(dá)miR-128對(duì)AKT在mRNA水平的表達(dá)無明顯影響57-59
- 4 結(jié)論59-61
- 5 討論61-63
- 參考文獻(xiàn)63-66
- 附錄A 縮寫表66-68
- 附錄B 綜述68-80
- 參考文獻(xiàn)75-80
- 在學(xué)研究成果80-82
- 致謝82
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