本文關(guān)鍵詞：扶綏肝癌高發(fā)區(qū)HBV前S區(qū)、C區(qū)基因突變與肝癌的關(guān)系及參照序列的建立

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【摘要】：目的探究扶綏縣肝癌高發(fā)區(qū)乙型肝炎病毒(Hepatitis B virus,HBV)前S(PreS)、前C/BCP(PreC/BCP)區(qū)基因突變與肝細(xì)胞癌(Hepatocellular carcinoma, HCC)發(fā)生發(fā)展的關(guān)系,并建立扶綏縣HBV流行株P(guān)reS,S, PreC/BCP基因參照序列。方法1.從扶綏肝癌高發(fā)區(qū)肝癌高危人群隊列中,選取30例HBV相關(guān)肝癌患者發(fā)病前連續(xù)2-5年以及肝癌確診年份的血清作為病例組,并以35例相同連續(xù)年份未發(fā)生肝癌成員同期的血清標(biāo)本作為對照組,經(jīng)抽提DNA,巢式PCR等實驗方法,擴(kuò)增得到HBV前S(PreS)區(qū)、S區(qū)、前C/BCP(PreC/BCP)區(qū)產(chǎn)物,經(jīng)純化測序,采用病例對照研究、縱向研究、巢式病例對照研究等方法,觀察前S區(qū)缺失,前S2起始密碼子突變、C3026T、T53C、T1858C、A1775G、G1896A和A1762T/G1764A突變與肝癌發(fā)生的關(guān)系。2.選取2013年扶綏縣HBV無癥狀攜帶者(Asymptomatic carrier,AsC)89例,測定其PreS、S、PreC/BCP基因,采用同源性分析等方法確定基因型,并按基因型在MEGA軟件中進(jìn)行序列比對,建立參照序列。結(jié)果1.A1775G、T1858C、PreS區(qū)缺失在病例組中的發(fā)生率顯著高于對照組(P0.05),比值比(odds ratio,OR)分別為0.215、3.636、4.306。而A1762T/G1764A、G1896A、C3026T、PreS2起始密碼子,T53C突變在兩組的差異無統(tǒng)計學(xué)意義(P0.05)。2.縱向研究顯示,PreC/BCP區(qū)27例、PreS區(qū)28例肝癌病例中,從進(jìn)入隊列觀察開始年份至發(fā)生肝癌期間,大部分肝癌患者A1762T/G1764A、T1858C、PreS區(qū)缺失,PreS2起始密碼子突變,C3026T、G1896A于肝癌發(fā)生前4-5已出現(xiàn)并趨于穩(wěn)定,T53C在肝癌診斷前2-3年開始出現(xiàn),5例觀察到了基因突變的動態(tài)變化。3.巢式病例對照研究顯示,病例組T1858C,PreS區(qū)缺失,1775無突變的發(fā)生率顯著高于對照組(P0.05),OR值分別為2.877,4.267,3.706。4.建立的扶綏縣參照序列與Gen Bank收錄的中國其他地區(qū)同基因型HBV序列(CDQ448627、EU439006)相比差異較大,最高可達(dá)2.07%。與中國地區(qū)HBV參照序列(CHN-HBV07-B和CHN-HBV07-C)相比差異較小；扶綏縣不同基因型間參照序列的差異程度大于不同地區(qū)同基因型序列間的差異,最小2.87%,最大可達(dá)9.65%。結(jié)論1.T1858C,PreS區(qū)缺失能夠增加肝癌發(fā)生的風(fēng)險,是肝癌發(fā)生的危險因素,A1775G能夠降低肝癌發(fā)生的風(fēng)險,是肝癌的保護(hù)性因素。2.A1762T/G1764A、T1858C、PreS區(qū)缺失,PreS2起始密碼子突變、C3026T、G1896A作用于肝癌發(fā)展的早期階段,A1775G由突變型變?yōu)橐吧蛯Ω伟┑陌l(fā)生具有提示作用。3.中國不同地區(qū)間參照序列差異較大,同地區(qū)不同基因型間差異更大。中國相同基因型的HBV DNA同源性較高,穩(wěn)定性較大。
【關(guān)鍵詞】：HBV 基因突變 肝癌 參照序列
【學(xué)位授予單位】：廣西醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2016
【分類號】：R735.7
【目錄】：

• 個人簡歷3-6
• 摘要6-8
• ABSTRACT8-11
• 第一部分 扶綏肝癌高發(fā)區(qū)HBV前S區(qū)、前C/BCP區(qū)基因突變與肝癌關(guān)系的研究11-42
• 1. 前言11-14
• 2. 材料與方法14-23
• 2.1 研究對象14-15
• 2.2 實驗儀器及試劑15
• 2.3 實驗方法15-22
• 2.4 HBV基因型的確定22
• 2.5 HBV基因變異的分析22-23
• 2.6 統(tǒng)計學(xué)方法23
• 3. 結(jié)果23-30
• 3.1 兩組一般資料均衡性比較23
• 3.2 研究對象HBV DNA擴(kuò)增及測序結(jié)果23-24
• 3.3 基因型分布情況24-25
• 3.4 HBV PreS基因、PreC/BCP基因突變分析25-27
• 3.5 肝癌患者發(fā)病前后各時期HBV PreS、PreC/BCP基因突變動態(tài)分析27-30
• 3.6 HBV PreS、PreC/BCP基因突變與肝癌關(guān)系的巢式病例對照研究30
• 4. 討論30-36
• 參考文獻(xiàn)36-42
• 第二部分 扶綏縣肝癌高發(fā)區(qū)HBV流行株基因參照序列建立42-52
• 1. 前言42
• 2. 材料與方法42-44
• 2.1 資料42-43
• 2.2 主要試劑與儀器43
• 2.3 實驗方法43
• 2.4 分型及序列分析43-44
• 3. 結(jié)果44-48
• 3.1 HBV DNA PreS、S、PreC/BCP基因擴(kuò)增結(jié)果44
• 3.2 HBV基因型的確定44
• 3.3 扶綏縣B型、C型HBV流行株P(guān)reS、S、Pre-C/BCP基因參照序列的建立44-46
• 3.4 扶綏縣不同基因型間HBV流行株P(guān)reS、S、Pre-C/BCP基因參照序列的比較46-47
• 3.5 扶綏縣HBV流行株P(guān)reS、S、前C/BCP基因參照序列與其他地區(qū)HBV DNA的比較47
• 3.6 扶綏縣HBV流行株P(guān)reS、S、前C/BCP基因參照序列與中國地區(qū)HBV參照序列的比較47-48
• 4. 討論48-50
• 參考文獻(xiàn)50-52
• 研究總結(jié)與創(chuàng)新點(diǎn)52-53
• 附錄53-54
• 綜述54-67
• 參考文獻(xiàn)61-67
• 致謝67-68
• 攻讀學(xué)位期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文68

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