鞣花酸是一種新興的、發(fā)揮抗癌活性的純天然小分子藥物。近些年來,鞣花酸抑制癌癥的機制和靶點被越來越系統(tǒng)地探究。基于我們近期的研究,鞣花酸可以顯著抑制肝癌細胞的增殖和腫瘤生長,促進肝癌細胞的周期阻滯、凋亡以及DNA損傷,卻對正常肝細胞造成極小的影響。為了探究這一現(xiàn)象所涉及的細胞內(nèi)部信號傳導的變化,尤其是鞣花酸的處理對肝癌細胞轉(zhuǎn)錄組水平的影響。在本研究中,我們對鞣花酸處理的HepG2細胞的轉(zhuǎn)錄組測序結(jié)果進行了差異表達基因的分析,同時與TCGA-LIHC數(shù)據(jù)庫中的肝細胞癌癥樣本特征進行一系列分析對比:1.在DESeq差異分析下,對比50μM鞣花酸處理的HepG2細胞和作為對照組的DMSO處理的HepG2細胞的轉(zhuǎn)錄組測序結(jié)果,我們發(fā)現(xiàn)共有6127個顯著變化的差異表達基因,其中經(jīng)過鞣花酸處理后上調(diào)的差異表達基因有3385個,下調(diào)的差異表達基因有2742個;在TCGA-LIHC數(shù)據(jù)庫中,對比腫瘤組織和癌旁組織的轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù),共有2179個顯著變化的差異表達基因,其中包括在腫瘤中表達較高的差異表達基因1306個,在腫瘤中表達較低的差異表達基因873個。2.因為鞣花酸對肝細胞癌的抑制作用遠遠大于正常肝...

【文章頁數(shù)】：54 頁

【學位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖１?ＴＣＧＡ－ＬＩＨＣ數(shù)據(jù)集差異表達基因火山圖??在ＴＣＧＡ－ＬＩＨＣ數(shù)據(jù)集中包含１３０６個顯著上調(diào)的基因和８７３個顯著影下調(diào)的基因

ｃｅｌｌｕｌａｒ?ｃａｒｃｉｎｏｍａ?ｆｒｏｍ?ＴＣＧＡ）是?ＴＣＧＡ?中??的肝細胞癌樣品數(shù)據(jù)庫，我們從ＴＣＧＡ－ＬＩＨＣ數(shù)據(jù)庫中下載／?３７０個病人的４２０個樣本??（３７０個丨沖瘤樣本和５０個癌旁組織樣本）的ＲＮＡ－ｓｅｑ檢測義件和臨床數(shù)掘文件。通過??Ｒ語言對ＴＣＧＡ－Ｌ....

圖２?ＥＡ處理ＨｅｐＧ２細胞ＲＮＡ－ｓｅｑ數(shù)據(jù)集差異表達基因火山圖??在ＥＡ處理ＨｅｐＧ２細胞ＲＮＡ－ｓｅｑ數(shù)據(jù)集中包含３３８５個顯著上調(diào)的基因和２７４２個顯著影下調(diào)的??

?東北林業(yè)大學碩士學位論文???ＲＮＡ－ｓｅｑ??（ＥＡ?ｖｅｒｓｕｓ?ＤＭＳＯ）??？?Ｄｏｗｎ??２＿?．?ｉ?．?？?Ｎｏ?ｃｈａｎｇｅ??；；？？．?＊?＊Ｕｐ??？?二．，?ｔ＊．?＊?．??ｍ??—ｉ—ｉ—ｉ—ｉ??－５?０?５?１０??Ｉｏｇ２ＦＣ??圖２?ＥＡ處理....

圖６具有相反變化差異表達基因的ＧＯ和ＫＥＧＧ富集分析??圖屮所心為依據(jù)ＦＤＲ?Ｈ彳低到高排列前２０的ＧＯ?ｔｅｒｍｓ和ＫＥＧＧ?ｔｅｒｍｓ

ＫｎａｌｉｎＫ?■■??ｋｉｎｃｌｏｃｈｕｒｃ－?卜滅ｎｃｕｎｉ?■ｎｒｍｉｉｉ??Ｓｐｉｍｌｋ－?ＨＨ?＼１ｉ？ｍａｔｃｈ?ｒｒｐｉｉｉｒ－?■??Ｓｐｉｎｄｌｒ?ｐ？ｋ－?ｍｔｍ?Ｋｏ＊（）?＾ｉｇｎａｌｉｎＲ?ｐ？ｌｈｕｉ＞－?Ｈ??ＡＴＰ?ｈｉｎｄｉｎｅ－?■■■?Ｐｒｅ....

圖１１在ＴＣＧＡ－ＬＩＨＣ數(shù)據(jù)集中調(diào)控細胞周期和ＤＮＡ復制的２３個基因的多因素Ｃｏｘ分析??依據(jù)Ｃｏｘ模型分析結(jié)果，通過Ｋａｐｌａｎ－Ｍｅｉｅｒ法繪制生存曲線，病人被分為高風險組和低風險??

?東北林業(yè)大學碩士學位論文???ｉｊＩＩＩ??１３－?＇＇?＇?ｈ－?／?／??６?一，?－?／?／??Ｓ?廣ｈｒｆ?２?｛／?ＡＵＣ?＝?０．７１８??ｇｌ??％＼ｙ?????？?２?４?６?８?１０?〇．〇?０．２?０．４?０．６?０．８?１．０??Ｔｉｍｅ?（ｙｅａｒｓ）?....

本文編號：3958001