根據(jù)2019年1月國家癌癥中心發(fā)布的最新一期全國癌癥統(tǒng)計數(shù)據(jù),2015年我國惡性腫瘤發(fā)病人數(shù)約為392.9萬人,死亡人數(shù)約為233.8萬人。這意味著平均每天有超過1萬人被確診為癌癥,每分鐘有7.5個人被確診為癌癥。與歷史數(shù)據(jù)相比,這一數(shù)據(jù)呈持續(xù)上升態(tài)勢。與此同時,近10多年來,惡性腫瘤的發(fā)病率每年保持約3.9%的增幅,死亡率每年保持2.5%的增幅;其中,結(jié)直腸癌成為危害我國人口健康的惡性腫瘤之一,其余4種分別是:肺癌、肝癌、上消化系統(tǒng)腫瘤和女性乳腺癌。此外,在男性當(dāng)中,前列腺癌的發(fā)病率近年來上升趨勢明顯,已位居男性發(fā)病中的第6位�；蛐酒透咄繙y序技術(shù)的廣泛應(yīng)用,產(chǎn)生了大量的基因表達(dá)譜數(shù)據(jù)和測序數(shù)據(jù)。與此同時,新一代人工智能技術(shù)的出現(xiàn),能夠為分析這些生物大數(shù)據(jù)提供算法與技術(shù)基礎(chǔ),從而預(yù)測腫瘤相關(guān)標(biāo)志物和篩選藥物靶點。對于這些分析結(jié)果,可以通過實驗室或臨床實驗進(jìn)行驗證,而在大數(shù)據(jù)時代則可以通過多個公開的生物信息數(shù)據(jù)庫進(jìn)行驗證。這種綜合分析在揭示癌癥的生物學(xué)過程研究中扮演了重要的角色。本研究將通過生物信息學(xué)方法與工具,通過挖掘GEO(Gene Expression Omnibus)和TC...

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【學(xué)位級別】：博士

【部分圖文】：

圖1.1基因表達(dá)譜數(shù)據(jù)分布圖：(a)GSE26910；(b)GSE69223；(c)GSE55945；(d)

重慶醫(yī)科大學(xué)博士研究生學(xué)位論文批次效應(yīng)和其他不必要的影響因素。歸一化之后的DNA甲基化表達(dá)譜數(shù)據(jù)和基因表達(dá)譜數(shù)據(jù)如圖1.4所示。圖1.1基因表達(dá)譜數(shù)據(jù)分布圖：(a)GSE26910；(b)GSE69223；(c)GSE55945；(d)GSE46602；(e)GSE30174Fi....

圖1.2甲基化數(shù)據(jù)分布圖：(a)GSE52955；(b)GSE73549；(c)GSE84749；(d)GSE76938Fig.1.2Datadistributionofmethylationprofilingdata:(a)GSE52955;(b)GSE73549;(c)

重慶醫(yī)科大學(xué)博士研究生學(xué)位論文圖1.2甲基化數(shù)據(jù)分布圖：(a)GSE52955；(b)GSE73549；(c)GSE84749；(d)GSE76938Fig.1.2Datadistributionofmethylationprofilingdata:(a)GSE52955;(b)....

圖1.3去除基因表達(dá)譜的批次效應(yīng)Fig.1.3Rejectbatcheffectsforgeneexpressionprofilingdata

重慶醫(yī)科大學(xué)博士研究生學(xué)位論文圖1.3去除基因表達(dá)譜的批次效應(yīng)Fig.1.3Rejectbatcheffectsforgeneexpressionprofilingdata18

圖1.4歸一化之后的基因甲基化表達(dá)譜：(a1)GSE76938genemethylationprofilingdatavaluedistribution；(a2)normalizationofGSE76938genemethylationprofilingdata；(b1)GSE73549genemethylationprofilingdatavaluedistribution；(b2)normalizationofGSE73549gene

重慶醫(yī)科大學(xué)博士研究生學(xué)位論文圖1.4歸一化之后的基因甲基化表達(dá)譜：(a1)GSE76938genemethylationprofilingdatavaluedistribution；(a2)normalizationofGSE76938genemethylationprofil....

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