胃癌相關(guān)circRNA的篩
發(fā)布時間:2023-03-19 05:22
第一部分:胃癌患者血漿中差異表達(dá)circRNA的篩選目的:構(gòu)建胃癌血漿circRNA表達(dá)譜,篩選出差異表達(dá)的circRNA基因。方法:采用circRNA基因芯片技術(shù),獲取circRNA在胃癌患者和正常體檢者血漿中的表達(dá)譜,篩選出表達(dá)上調(diào)或下調(diào)2倍以上的circRNA,并通過GO富集分析和KEGG信號通路富集分析,進(jìn)一步篩選出胃癌標(biāo)志物的候選circRNA。結(jié)果:通過分析胃癌相關(guān)circRNA表達(dá)譜,共發(fā)現(xiàn)566種circRNA在胃癌患者和正常體檢者間存在顯著性差異(P<0.05),其中68種circRNA表達(dá)水平差異超過2倍(28種高表達(dá),40種低表達(dá))。進(jìn)一步行生物信息學(xué)分析,最終篩選得到20個候選circRNA基因(8種高表達(dá),12種低表達(dá))。結(jié)論:成功構(gòu)建了胃癌相關(guān)血漿circRNA表達(dá)譜,并初步篩選出在胃癌血漿中存在表達(dá)差異的20個circRNA基因。第二部分:初篩circRNA在胃癌血漿中的表達(dá)目的:驗證初篩circRNA在胃癌血漿中的表達(dá)情況,并探討其與胃癌臨床病理特征的相關(guān)性。方法:收集胃癌患者和健康體檢者血漿各80例,利用qRT-PCR的方法對篩選結(jié)果進(jìn)行驗證,并...
【文章頁數(shù)】:107 頁
【學(xué)位級別】:博士
【文章目錄】:
中文摘要
Abstract
前言
第一部分 胃癌患者血漿中差異表達(dá)circRNA的篩選
第一章 引言
1.1 circRNA的結(jié)構(gòu)特點
1.2 circRNA的合成
1.3 circRNA的生物學(xué)功能及其作用機(jī)制
1.4 circRNA的檢測技術(shù)
1.5 circRNA與腫瘤發(fā)生、發(fā)展的關(guān)系
1.6 circRNA與胃癌的關(guān)系
1.7 總結(jié)與展望
第二章 材料與方法
2.1 實驗材料
2.2 實驗方法
2.3 統(tǒng)計學(xué)方法
第三章 結(jié)果
3.1 芯片樣品RNA的質(zhì)檢
3.2 芯片掃描結(jié)果
3.3 芯片數(shù)據(jù)的歸一化分析
3.4 表達(dá)差異基因的篩選
第四章 討論
第五章 小結(jié)
第二部分 初篩circRNA在胃癌血漿中的表達(dá)
第一章 引言
第二章 材料與方法
2.1 實驗材料
2.2 實驗方法
2.3 統(tǒng)計學(xué)方法
第三章 結(jié)果
3.1 臨床資料基本特征
3.2 初篩circRNA在胃癌血漿中表達(dá)的驗證
3.3 hsacirc0033634的表達(dá)與胃癌臨床病理參數(shù)間的關(guān)系
3.4 hsacirc0033634表達(dá)的ROC曲線分析
第四章 討論
第五章 小結(jié)
第三部分 hsacirc0033634對胃癌生物學(xué)行為的調(diào)控作用
第一章 引言
第二章 材料與方法
2.1 實驗材料
2.2 實驗方法
2.3 統(tǒng)計學(xué)方法
第三章 結(jié)果
3.1 hsacirc0033634在胃癌細(xì)胞中的表達(dá)
3.2 hsacirc0033634轉(zhuǎn)染后對胃癌細(xì)胞增殖的影響
3.3 hsacirc0033634轉(zhuǎn)染后對胃癌細(xì)胞凋亡的影響
3.4 hsacirc0033634轉(zhuǎn)染后對胃癌細(xì)胞體外遷移能力的影響
3.5 hsacirc0033634轉(zhuǎn)染后對胃癌細(xì)胞體外侵襲能力的影響
第四章 討論
第五章 小結(jié)
第四部分 hsacirc0033634參與胃癌發(fā)生發(fā)展的機(jī)制研究
第一章 引言
第二章 材料與方法
2.1 實驗材料
2.2 實驗方法
2.3 統(tǒng)計學(xué)方法
第三章 結(jié)果
3.1 hsacirc0033634的可能靶基因
3.2 hsa-miR-331-3p在不同胃癌細(xì)胞系中的表達(dá)
3.3 hsacirc0033634調(diào)控hsa-miR-331-3p在胃癌中的作用
3.4 hsacirc0033634和hsa-miR-331-3p對RAS信號通路相關(guān)蛋白表達(dá)的影響
第四章 討論
第五章 小結(jié)
全文結(jié)論
參考文獻(xiàn)
附錄 中英文縮略詞表
在學(xué)期間的研究成果
致謝
本文編號:3764642
【文章頁數(shù)】:107 頁
【學(xué)位級別】:博士
【文章目錄】:
中文摘要
Abstract
前言
第一部分 胃癌患者血漿中差異表達(dá)circRNA的篩選
第一章 引言
1.1 circRNA的結(jié)構(gòu)特點
1.2 circRNA的合成
1.3 circRNA的生物學(xué)功能及其作用機(jī)制
1.4 circRNA的檢測技術(shù)
1.5 circRNA與腫瘤發(fā)生、發(fā)展的關(guān)系
1.6 circRNA與胃癌的關(guān)系
1.7 總結(jié)與展望
第二章 材料與方法
2.1 實驗材料
2.2 實驗方法
2.3 統(tǒng)計學(xué)方法
第三章 結(jié)果
3.1 芯片樣品RNA的質(zhì)檢
3.2 芯片掃描結(jié)果
3.3 芯片數(shù)據(jù)的歸一化分析
3.4 表達(dá)差異基因的篩選
第四章 討論
第五章 小結(jié)
第二部分 初篩circRNA在胃癌血漿中的表達(dá)
第一章 引言
第二章 材料與方法
2.1 實驗材料
2.2 實驗方法
2.3 統(tǒng)計學(xué)方法
第三章 結(jié)果
3.1 臨床資料基本特征
3.2 初篩circRNA在胃癌血漿中表達(dá)的驗證
3.3 hsacirc0033634的表達(dá)與胃癌臨床病理參數(shù)間的關(guān)系
3.4 hsacirc0033634表達(dá)的ROC曲線分析
第四章 討論
第五章 小結(jié)
第三部分 hsacirc0033634對胃癌生物學(xué)行為的調(diào)控作用
第一章 引言
第二章 材料與方法
2.1 實驗材料
2.2 實驗方法
2.3 統(tǒng)計學(xué)方法
第三章 結(jié)果
3.1 hsacirc0033634在胃癌細(xì)胞中的表達(dá)
3.2 hsacirc0033634轉(zhuǎn)染后對胃癌細(xì)胞增殖的影響
3.3 hsacirc0033634轉(zhuǎn)染后對胃癌細(xì)胞凋亡的影響
3.4 hsacirc0033634轉(zhuǎn)染后對胃癌細(xì)胞體外遷移能力的影響
3.5 hsacirc0033634轉(zhuǎn)染后對胃癌細(xì)胞體外侵襲能力的影響
第四章 討論
第五章 小結(jié)
第四部分 hsacirc0033634參與胃癌發(fā)生發(fā)展的機(jī)制研究
第一章 引言
第二章 材料與方法
2.1 實驗材料
2.2 實驗方法
2.3 統(tǒng)計學(xué)方法
第三章 結(jié)果
3.1 hsacirc0033634的可能靶基因
3.2 hsa-miR-331-3p在不同胃癌細(xì)胞系中的表達(dá)
3.3 hsacirc0033634調(diào)控hsa-miR-331-3p在胃癌中的作用
3.4 hsacirc0033634和hsa-miR-331-3p對RAS信號通路相關(guān)蛋白表達(dá)的影響
第四章 討論
第五章 小結(jié)
全文結(jié)論
參考文獻(xiàn)
附錄 中英文縮略詞表
在學(xué)期間的研究成果
致謝
本文編號:3764642
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