Luminal亞型與basal-like亞型乳腺癌間的差異蛋白質(zhì)篩選研究
發(fā)布時間:2022-02-20 03:35
目的利用ITRAQ蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)探索luminal亞型及basal-like亞型乳腺癌之間的差異蛋白質(zhì),尋找靶向蛋白質(zhì)及基因,為指導(dǎo)治療basal-like亞型乳腺癌提供新思路。方法1.將luminal亞型乳腺癌細(xì)胞MCF-7細(xì)胞及basal-like亞型乳腺癌細(xì)胞MDA-MB-231細(xì)胞分別分為3組,每組分別提取蛋白質(zhì),行蛋白質(zhì)組學(xué)的標(biāo)記相關(guān)的肽段、質(zhì)譜的分析,然后數(shù)據(jù)庫比對,最后進(jìn)行生信分析。2.經(jīng)查閱文獻(xiàn)后,挑選出最具實(shí)驗(yàn)意義的30個蛋白質(zhì),行q PCR在轉(zhuǎn)錄水平上進(jìn)行驗(yàn)證,結(jié)合文獻(xiàn)進(jìn)行分析,再挑選出質(zhì)譜與q PCR結(jié)果相符的有統(tǒng)計學(xué)意義的差異蛋白質(zhì)。結(jié)果用ITRAQ定量蛋白質(zhì)組方法鑒定差異蛋白,發(fā)現(xiàn)所有差異蛋白質(zhì)共有2796個,其中A/B(A代表MDA-MB-231細(xì)胞,B代表MCF-7細(xì)胞)上調(diào)差異表達(dá)蛋白質(zhì)有1591個,下調(diào)差異表達(dá)蛋白質(zhì)有1205個。根據(jù)生物信息學(xué)分析發(fā)現(xiàn),差異蛋白質(zhì)主要參與多細(xì)胞生物的進(jìn)程、細(xì)胞粘附、細(xì)胞運(yùn)動,并且主要參與代謝途徑、腫瘤途徑等,代謝途徑其中常見的為糖酵解/糖異生代謝途徑、碳代謝途徑、谷胱甘肽代謝途徑等。結(jié)合文獻(xiàn),發(fā)現(xiàn)luminal亞型乳腺...
【文章來源】:南華大學(xué)湖南省
【文章頁數(shù)】:56 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
中文摘要
Abstract
英文縮略詞表
第1章 前言
第2章 實(shí)驗(yàn)材料
2.1 細(xì)胞株
2.2 試劑
2.3 主要溶液配制
2.4 主要儀器
2.5 生物信息學(xué)軟件
第3章 實(shí)驗(yàn)方法
3.1 細(xì)胞培養(yǎng)
3.2 蛋白樣品制備和iTRAQ標(biāo)記
3.3 質(zhì)譜分析
3.4 RT-PCR驗(yàn)證
第4章 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
4.1 預(yù)實(shí)驗(yàn)結(jié)果
4.2 正式實(shí)驗(yàn)結(jié)果
第5章 討論
第6章 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
蛋白組學(xué)的發(fā)展以及在乳腺癌研究中的應(yīng)用
前言
1.蛋白組學(xué)的概念
2.乳腺癌蛋白質(zhì)組學(xué)研究的技術(shù)進(jìn)展
3.蛋白組學(xué)在乳腺癌診治過程中科研進(jìn)展
結(jié)語
參考文獻(xiàn)
致謝
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]鈣結(jié)合蛋白39通過激活ERK信號通路促進(jìn)肝細(xì)胞性肝癌的生長和轉(zhuǎn)移[J]. Jiang,L.Yan,Q.Fang,王石,耿小平. 肝膽外科雜志. 2017(03)
[2]乳腺癌在中國的流行狀況和疾病特征[J]. 鄭瑩,吳春曉,張敏璐. 中國癌癥雜志. 2013(08)
[3]膜結(jié)合蛋白在腫瘤侵襲轉(zhuǎn)移中的作用[J]. 郎翠翠,田字彬. 齊魯醫(yī)學(xué)雜志. 2011(02)
[4]應(yīng)用8標(biāo)iTRAQ技術(shù)結(jié)合2D LC-MS/MS分析大鼠再生肝的差異蛋白質(zhì)組[J]. 張一甫,秦兆宇,劉曉慧,林成招,賀福初. 分析測試學(xué)報. 2010(05)
[5]糖酵解代謝在惡性腫瘤細(xì)胞中的特異性表型及其意義[J]. 彭秋平,梁后杰. 臨床腫瘤學(xué)雜志. 2009(05)
[6]乳腺癌分子標(biāo)志和分子分型[J]. 王曉稼,邵喜英. 醫(yī)學(xué)分子生物學(xué)雜志. 2008(02)
[7]乳腺癌HER2檢測指南[J]. 《乳腺癌HER2檢測指南》編寫組,霍臨明. 中華病理學(xué)雜志. 2006(10)
[8]乳腺癌治療的新循證醫(yī)學(xué)證據(jù)和臨床實(shí)踐[J]. 江澤飛,姚開泰,宋三泰. 中華醫(yī)學(xué)雜志. 2005(43)
[9]蛋白質(zhì)組學(xué)的進(jìn)展[J]. 李林,sunm.shcnc.ac.cn. 生物化學(xué)與生物物理進(jìn)展. 2000(03)
[10]乳腺癌靶向治療:Herceptin的研究進(jìn)展[J]. 周愛萍,馮奉儀. 國外醫(yī)學(xué)(腫瘤學(xué)分冊). 2000(03)
博士論文
[1]RNA結(jié)合蛋白QKI-5在腎癌發(fā)生發(fā)展中的功能研究[D]. 張瑞麗.新疆醫(yī)科大學(xué) 2016
[2]HER2陽性乳腺癌患者預(yù)后和三陰性乳腺癌治療的臨床及相關(guān)基礎(chǔ)研究[D]. 杜豐.北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院 2016
碩士論文
[1]基于iTRAQ技術(shù)對肝癌轉(zhuǎn)移相關(guān)蛋白的初探[D]. 宋琳嵐.重慶醫(yī)科大學(xué) 2016
[2]CK5/6蛋白在不同分子類型乳腺癌的表達(dá)及臨床意義[D]. 李利英.大連醫(yī)科大學(xué) 2014
[3]不同分子類型乳腺癌Bcl-2蛋白表達(dá)的意義[D]. 韓芳.大連醫(yī)科大學(xué) 2014
[4]非肌細(xì)胞肌球蛋白重鏈ⅡA亞型在乳腺癌轉(zhuǎn)移中的作用[D]. 吳珊珊.吉林大學(xué) 2012
本文編號:3634235
【文章來源】:南華大學(xué)湖南省
【文章頁數(shù)】:56 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
中文摘要
Abstract
英文縮略詞表
第1章 前言
第2章 實(shí)驗(yàn)材料
2.1 細(xì)胞株
2.2 試劑
2.3 主要溶液配制
2.4 主要儀器
2.5 生物信息學(xué)軟件
第3章 實(shí)驗(yàn)方法
3.1 細(xì)胞培養(yǎng)
3.2 蛋白樣品制備和iTRAQ標(biāo)記
3.3 質(zhì)譜分析
3.4 RT-PCR驗(yàn)證
第4章 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
4.1 預(yù)實(shí)驗(yàn)結(jié)果
4.2 正式實(shí)驗(yàn)結(jié)果
第5章 討論
第6章 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
蛋白組學(xué)的發(fā)展以及在乳腺癌研究中的應(yīng)用
前言
1.蛋白組學(xué)的概念
2.乳腺癌蛋白質(zhì)組學(xué)研究的技術(shù)進(jìn)展
3.蛋白組學(xué)在乳腺癌診治過程中科研進(jìn)展
結(jié)語
參考文獻(xiàn)
致謝
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]鈣結(jié)合蛋白39通過激活ERK信號通路促進(jìn)肝細(xì)胞性肝癌的生長和轉(zhuǎn)移[J]. Jiang,L.Yan,Q.Fang,王石,耿小平. 肝膽外科雜志. 2017(03)
[2]乳腺癌在中國的流行狀況和疾病特征[J]. 鄭瑩,吳春曉,張敏璐. 中國癌癥雜志. 2013(08)
[3]膜結(jié)合蛋白在腫瘤侵襲轉(zhuǎn)移中的作用[J]. 郎翠翠,田字彬. 齊魯醫(yī)學(xué)雜志. 2011(02)
[4]應(yīng)用8標(biāo)iTRAQ技術(shù)結(jié)合2D LC-MS/MS分析大鼠再生肝的差異蛋白質(zhì)組[J]. 張一甫,秦兆宇,劉曉慧,林成招,賀福初. 分析測試學(xué)報. 2010(05)
[5]糖酵解代謝在惡性腫瘤細(xì)胞中的特異性表型及其意義[J]. 彭秋平,梁后杰. 臨床腫瘤學(xué)雜志. 2009(05)
[6]乳腺癌分子標(biāo)志和分子分型[J]. 王曉稼,邵喜英. 醫(yī)學(xué)分子生物學(xué)雜志. 2008(02)
[7]乳腺癌HER2檢測指南[J]. 《乳腺癌HER2檢測指南》編寫組,霍臨明. 中華病理學(xué)雜志. 2006(10)
[8]乳腺癌治療的新循證醫(yī)學(xué)證據(jù)和臨床實(shí)踐[J]. 江澤飛,姚開泰,宋三泰. 中華醫(yī)學(xué)雜志. 2005(43)
[9]蛋白質(zhì)組學(xué)的進(jìn)展[J]. 李林,sunm.shcnc.ac.cn. 生物化學(xué)與生物物理進(jìn)展. 2000(03)
[10]乳腺癌靶向治療:Herceptin的研究進(jìn)展[J]. 周愛萍,馮奉儀. 國外醫(yī)學(xué)(腫瘤學(xué)分冊). 2000(03)
博士論文
[1]RNA結(jié)合蛋白QKI-5在腎癌發(fā)生發(fā)展中的功能研究[D]. 張瑞麗.新疆醫(yī)科大學(xué) 2016
[2]HER2陽性乳腺癌患者預(yù)后和三陰性乳腺癌治療的臨床及相關(guān)基礎(chǔ)研究[D]. 杜豐.北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院 2016
碩士論文
[1]基于iTRAQ技術(shù)對肝癌轉(zhuǎn)移相關(guān)蛋白的初探[D]. 宋琳嵐.重慶醫(yī)科大學(xué) 2016
[2]CK5/6蛋白在不同分子類型乳腺癌的表達(dá)及臨床意義[D]. 李利英.大連醫(yī)科大學(xué) 2014
[3]不同分子類型乳腺癌Bcl-2蛋白表達(dá)的意義[D]. 韓芳.大連醫(yī)科大學(xué) 2014
[4]非肌細(xì)胞肌球蛋白重鏈ⅡA亞型在乳腺癌轉(zhuǎn)移中的作用[D]. 吳珊珊.吉林大學(xué) 2012
本文編號:3634235
本文鏈接:http://sikaile.net/yixuelunwen/zlx/3634235.html
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