基于核磁共振代謝組學(xué)的胰腺癌代謝分型和不同分化程度的胰腺癌模型血清代謝差異的研究
發(fā)布時(shí)間:2021-11-19 14:45
第一部分基于組織核磁共振代謝組學(xué)的胰腺癌代謝分型的研究目的:探索基于核磁共振(NMR)代謝組學(xué)技術(shù)建立胰腺癌組織代謝分型,揭示胰腺癌在組織代謝組學(xué)層面的異質(zhì)性,發(fā)現(xiàn)不同分型患者在臨床進(jìn)展和預(yù)后的差異。方法:采用1H NMR波譜檢測(cè)113例胰腺癌組織樣本(PCa組)和56例正常胰腺組織樣本(Control組)代謝數(shù)據(jù),通過(guò)分層聚類(lèi)分析(HCA)獲得PCa不同亞組。聯(lián)合單變量和多變量統(tǒng)計(jì)方法分析不同亞組代謝變化、相關(guān)代謝通路及組間代謝差異,根據(jù)亞組代謝特征確定代謝分型。收集并比較各分型患者臨床資料的差異。受試者工作特征曲線(xiàn)(ROC)分析篩選區(qū)分胰腺癌以及區(qū)分特定分型的代謝標(biāo)志物。結(jié)果:根據(jù)HCA分析,得到PCa-1、2A和2B三個(gè)亞組。與Control組相比,PCa各亞組代謝變化顯著,表現(xiàn)為糖類(lèi)、羧酸類(lèi)、部分氨基酸及氨基酸分解產(chǎn)物含量的上升和三羧酸循環(huán)底物、嘧啶、嘌呤、核苷類(lèi)、膽堿類(lèi)以及煙酰胺類(lèi)物質(zhì)含量的降低,僅有少部分代謝物呈不同變化趨勢(shì),提示不同亞組總體代謝重構(gòu)趨勢(shì)相似。亞組間比較顯示,各亞組中代謝物含量變化程度和代謝變化主要相關(guān)通路并不相同。PCa-1組以高氨基...
【文章來(lái)源】:福建醫(yī)科大學(xué)福建省
【文章頁(yè)數(shù)】:156 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【部分圖文】:
胰腺癌組織(PCa)與正常胰腺組織(Control)水溶性萃取物平均1HNMR圖譜,黑框表示其內(nèi)的譜線(xiàn)放大20倍;波譜歸屬見(jiàn)表1.2.
42圖1.3PCa各亞組與對(duì)照組的組織核磁共振波譜數(shù)據(jù)OPLS-DA比較得分圖及代謝物火山圖。A-C. Control vs PCa-1、Control vs PCa-2A 和 Control vs PCa-2B OPLS-DA 得分圖。R2X、R2Y和 Q2來(lái)源于 10 次交叉驗(yàn)證和響應(yīng)排序檢驗(yàn), P 值為 CV-ANOVA 檢驗(yàn),D-F. Control vs PCa-1、Control vs PCa-2A 和 Control vs PCa-2B 代謝物火山圖。右側(cè)圖為左側(cè)綠色框區(qū)域的放大圖。每一個(gè)圓點(diǎn)代表一個(gè)代謝物,圓點(diǎn)的大小按照 VIP 值從大到小分為 4 種大。<10%、10-30%、30%-60%和>60%)進(jìn)行編碼。圓點(diǎn)的顏色按照 Pcorr 絕對(duì)值大小進(jìn)行編碼,越高越偏向紅色。橫坐標(biāo)由后組該代謝物平均含量/前組該代謝物平均含量比值的Log2值進(jìn)行表示,
5 基于 PCa 各亞組與 Control 組代謝差異的關(guān)鍵代謝通路。A-C.ControlvsPCa- PCa-2B 代謝差異的相關(guān)代謝通路點(diǎn)狀圖,圓點(diǎn)代表代謝通路,縱軸和圓點(diǎn)顏路的-Log10(P 值)表示和編碼,-Log10(P 值)越高,圓點(diǎn)位置越高、顏色越偏向路與代謝差異相關(guān)的可信度越高。橫軸代表各代謝通路的代謝影響,該通路對(duì)代,離原點(diǎn)越遠(yuǎn),半徑越大。P 值采用通路富集分析計(jì)算獲得,代謝影響采用通路算得出,上述工作采用 MetaboAnalysts 3.0 服務(wù)實(shí)現(xiàn)。各圖中代謝通路數(shù)字標(biāo)識(shí)標(biāo)識(shí)。D. PCa 各亞組與 Control 組比較,P 值最小的前 20 各代謝通路熱圖。圖中Ca-2A、PCa-2B 分別代表 PCa-1、PCa-2A 和 PCa-2B 與 Control 組代謝差異通路果中,P 值最小的前 20 位代謝通路。各代謝通路顏色按照 P 值得大小進(jìn)行編碼近黃色,P 值越低,顏色越接近棕色,P 值越高。黑色則代表該通路不屬于 P 值 位代謝通路。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]Dysregulated lipid metabolism in cancer[J]. Feng Zhang, Guangwei Du, Department of Integrative Biology and Pharmacology, The University of Texas Health Science Center at Houston, Houston, TX 77030, United States. World Journal of Biological Chemistry. 2012(08)
本文編號(hào):3505263
【文章來(lái)源】:福建醫(yī)科大學(xué)福建省
【文章頁(yè)數(shù)】:156 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【部分圖文】:
胰腺癌組織(PCa)與正常胰腺組織(Control)水溶性萃取物平均1HNMR圖譜,黑框表示其內(nèi)的譜線(xiàn)放大20倍;波譜歸屬見(jiàn)表1.2.
42圖1.3PCa各亞組與對(duì)照組的組織核磁共振波譜數(shù)據(jù)OPLS-DA比較得分圖及代謝物火山圖。A-C. Control vs PCa-1、Control vs PCa-2A 和 Control vs PCa-2B OPLS-DA 得分圖。R2X、R2Y和 Q2來(lái)源于 10 次交叉驗(yàn)證和響應(yīng)排序檢驗(yàn), P 值為 CV-ANOVA 檢驗(yàn),D-F. Control vs PCa-1、Control vs PCa-2A 和 Control vs PCa-2B 代謝物火山圖。右側(cè)圖為左側(cè)綠色框區(qū)域的放大圖。每一個(gè)圓點(diǎn)代表一個(gè)代謝物,圓點(diǎn)的大小按照 VIP 值從大到小分為 4 種大。<10%、10-30%、30%-60%和>60%)進(jìn)行編碼。圓點(diǎn)的顏色按照 Pcorr 絕對(duì)值大小進(jìn)行編碼,越高越偏向紅色。橫坐標(biāo)由后組該代謝物平均含量/前組該代謝物平均含量比值的Log2值進(jìn)行表示,
5 基于 PCa 各亞組與 Control 組代謝差異的關(guān)鍵代謝通路。A-C.ControlvsPCa- PCa-2B 代謝差異的相關(guān)代謝通路點(diǎn)狀圖,圓點(diǎn)代表代謝通路,縱軸和圓點(diǎn)顏路的-Log10(P 值)表示和編碼,-Log10(P 值)越高,圓點(diǎn)位置越高、顏色越偏向路與代謝差異相關(guān)的可信度越高。橫軸代表各代謝通路的代謝影響,該通路對(duì)代,離原點(diǎn)越遠(yuǎn),半徑越大。P 值采用通路富集分析計(jì)算獲得,代謝影響采用通路算得出,上述工作采用 MetaboAnalysts 3.0 服務(wù)實(shí)現(xiàn)。各圖中代謝通路數(shù)字標(biāo)識(shí)標(biāo)識(shí)。D. PCa 各亞組與 Control 組比較,P 值最小的前 20 各代謝通路熱圖。圖中Ca-2A、PCa-2B 分別代表 PCa-1、PCa-2A 和 PCa-2B 與 Control 組代謝差異通路果中,P 值最小的前 20 位代謝通路。各代謝通路顏色按照 P 值得大小進(jìn)行編碼近黃色,P 值越低,顏色越接近棕色,P 值越高。黑色則代表該通路不屬于 P 值 位代謝通路。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]Dysregulated lipid metabolism in cancer[J]. Feng Zhang, Guangwei Du, Department of Integrative Biology and Pharmacology, The University of Texas Health Science Center at Houston, Houston, TX 77030, United States. World Journal of Biological Chemistry. 2012(08)
本文編號(hào):3505263
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