目的:采用液相色譜質(zhì)譜聯(lián)用技術(shù)（LC-MS）對健康志愿者、早期胃癌患者及進(jìn)展期胃癌患者的尿液樣本進(jìn)行檢測,分析三組尿液中代謝產(chǎn)物的差異,進(jìn)而尋找可以預(yù)測早期胃癌的潛在生物學(xué)標(biāo)志物。方法:1、實驗分組:根據(jù)術(shù)前檢查及術(shù)后病理分為早期胃癌組、進(jìn)展期胃癌組。另根據(jù)體檢報告等選取健康志愿者為一組作為對照。2、樣本處理:將存放于標(biāo)本庫中的尿液樣本取出,于室溫下融化,加入乙腈并高速離心（14000rpm,5min）,取尿液樣本的上清液供液相色譜質(zhì)譜聯(lián)用儀檢測分析。3、色譜分析與數(shù)據(jù)處理:通過液相色譜-質(zhì)譜儀對三組尿液樣本進(jìn)行檢測,得到早期胃癌組、進(jìn)展期胃癌組及健康志愿者的代謝產(chǎn)物譜。進(jìn)一步通過matlab軟件對原始數(shù)據(jù)進(jìn)行歸一化等處理并做主成分分析,然后結(jié)合方差分析、偏最小二乘判別分析等統(tǒng)計學(xué)手段,找到早期胃癌患者、進(jìn)展期胃癌患者及健康志愿者之間重要的差異代謝產(chǎn)物,將獲得的數(shù)據(jù)導(dǎo)入人類代謝組數(shù)據(jù)庫,對差異代謝物的結(jié)構(gòu)進(jìn)行鑒定,再利用ROC曲線及均值柱狀圖的繪制,篩選出區(qū)分能力強的差異代謝物作為潛在的生物標(biāo)志物。結(jié)果:通過三組尿液樣本的總離子流程圖,可以直觀地觀察出三組尿液樣本間的代謝產(chǎn)物存在差異差... 

【文章來源】：吉林大學(xué)吉林省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】：64 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

三組樣本的總離子流程圖

第3章實驗結(jié)果22行主成分分析，得到三維主成分分析得分圖（圖3.2）。在得分圖中，樣本間代謝物的差異越大，相距越遠(yuǎn)；代謝物的信息相近則聚集在同一區(qū)域。通過主成分分析得分圖可以直觀地了解同組樣本內(nèi)部及不同樣本間的聚集及離散趨勢。同組尿液樣本的代謝物相似，因而在主成分分析圖上分布的比較聚集。圖中樣本分為4組，不同的顏色代表不同的樣本，即質(zhì)量控制組、進(jìn)展期胃癌組、早期胃癌組及健康組。圖3.2所示，不同尿液樣本間離散較遠(yuǎn)提示代謝產(chǎn)物可能存在較大差異，而同組尿液樣本聚集良好則說明代謝物的差異校因此，從主成分分析得分圖可知，三組不同的尿液樣本間可能存在差異性代謝產(chǎn)物。圖3.2三維主成分分析圖NOR：健康組EGC：早期胃癌組AGC：進(jìn)展期胃癌組QC：質(zhì)量控制組3.4方差分析獲得的原始數(shù)據(jù)經(jīng)matlab軟件歸一化、標(biāo)準(zhǔn)化等處理后，將數(shù)

第3章實驗結(jié)果23據(jù)導(dǎo)入MetaboAnalyst4.0軟件，對健康組、早期胃癌組及進(jìn)展期胃癌組三組尿液樣本數(shù)據(jù)進(jìn)行方差分析。在對方差分析的結(jié)果進(jìn)行篩選時，以F值和P值作為主要依據(jù)。F值用來評估組間差異，F(xiàn)越大，表示差異越顯著，擬合程度也就越好，若F值接近1，則說明各組均值間的差異沒有統(tǒng)計學(xué)意義，若F值遠(yuǎn)大于1，則說明各組均值間的差異有統(tǒng)計學(xué)意義；P值是衡量控制組與實驗組差異大小的指標(biāo)，P值小于0.05時表示兩組存在顯著差異。如圖3.3所示，輸入條件為F值遠(yuǎn)大于1且P值小于0.05時，篩選出的差異產(chǎn)物由紅色表示，即可認(rèn)為是有意義的代謝產(chǎn)物。本次實驗經(jīng)方差分析共篩選出324個具有統(tǒng)計學(xué)意義的代謝物。圖3.3方差分析圖3.5偏最小二乘判別分析（PLS-DA）應(yīng)用MetaboAnalyst4.0軟件中的偏最小二乘判別分析（PLS-DA）方法對方差分析篩選出的差異性代謝產(chǎn)物進(jìn)行判別分析。在判別分析

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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本文編號：3470675