發(fā)布時(shí)間：2021-10-31 10:37

　　癌癥是現(xiàn)代社會(huì)威脅人類健康的主要因素之一,但癌癥免疫療法也正在徹底改變腫瘤學(xué)。腫瘤浸潤(rùn)的免疫細(xì)胞對(duì)免疫治療的臨床反應(yīng)有深遠(yuǎn)的影響,免疫組庫(kù)中的Ig/Tc R基因序列多樣性反映了B/T細(xì)胞增殖克隆性和機(jī)體的免疫狀況,與實(shí)體腫瘤、自身免疫病和感染都密切相關(guān)。單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)的發(fā)展推動(dòng)了免疫組庫(kù)測(cè)序技術(shù)的成熟與完善,日益增長(zhǎng)的免疫組數(shù)據(jù)需要高效的免疫組庫(kù)分析技術(shù)以快速準(zhǔn)確地實(shí)現(xiàn)高通量數(shù)據(jù)的分析,從而更深入、細(xì)致的探究復(fù)雜免疫系統(tǒng)內(nèi)細(xì)胞異質(zhì)性。此外,免疫組學(xué)研究能推動(dòng)癌癥免疫治療的發(fā)展,從免疫組學(xué)數(shù)據(jù)探究癌癥早期篩查對(duì)于癌癥治療有著重要意義,如何基于免疫組學(xué)數(shù)據(jù)利用機(jī)器學(xué)習(xí)方法開發(fā)癌癥預(yù)測(cè)模型是一個(gè)極具挑戰(zhàn)性的問題。因此,本論文主要從以下三個(gè)方面開展研究:第一部分,針對(duì)日益增長(zhǎng)的單細(xì)胞免疫組學(xué)數(shù)據(jù),對(duì)現(xiàn)有分析流程存在的問題進(jìn)行分析,設(shè)計(jì)一套較為完整的基于單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序數(shù)據(jù)的免疫組庫(kù)分析流程,開發(fā)一套高效實(shí)用的免疫組庫(kù)分析工具。第二部分,基于非小細(xì)胞肺癌、結(jié)直腸癌、黑色素瘤三種癌癥的單細(xì)胞免疫組庫(kù)數(shù)據(jù),借助免疫組庫(kù)分析工具,選取TCRβ鏈的CDR3蛋白序列進(jìn)行V/J基因表達(dá)量分析、V/J基因共享... 

【文章來(lái)源】：哈爾濱工業(yè)大學(xué)黑龍江省 211工程院校 985工程院校

【文章頁(yè)數(shù)】：70 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
ABSTRACT
第1章 緒論
    1.1 課題背景及研究的目的和意義
    1.2 單細(xì)胞免疫組學(xué)研究現(xiàn)狀
        1.2.1 單細(xì)胞免疫組數(shù)據(jù)獲取途徑
        1.2.2 基于單細(xì)胞的免疫組庫(kù)分析現(xiàn)狀
    1.3 癌癥預(yù)測(cè)研究現(xiàn)狀
        1.3.1 癌癥診斷現(xiàn)狀
        1.3.2 癌癥預(yù)測(cè)模型研究進(jìn)展
    1.4 本文的主要研究?jī)?nèi)容
第2章 基于scRNA-seq數(shù)據(jù)的免疫組庫(kù)分析流程構(gòu)建
    2.1 引言
    2.2 現(xiàn)有免疫組庫(kù)分析流程的問題分析及改進(jìn)
        2.2.1 免疫數(shù)據(jù)結(jié)果格式規(guī)范化
        2.2.2 規(guī)范免疫數(shù)據(jù)的克隆型分析
    2.3 基于scRNA-seq數(shù)據(jù)的免疫組庫(kù)分析流程構(gòu)建方法
        2.3.1 初始數(shù)據(jù)的質(zhì)量控制
        2.3.2 與參考序列的比對(duì)
        2.3.3 免疫相關(guān)序列的組裝
        2.3.4 Ig/TcR注釋
        2.3.5 免疫組庫(kù)下游分析
    2.4 免疫組庫(kù)分析流程應(yīng)用
    2.5 本章小結(jié)
第3章 三種癌癥的單細(xì)胞免疫組庫(kù)分析
    3.1 引言
    3.2 癌癥的免疫組庫(kù)數(shù)據(jù)及分析方法
        3.2.1 癌癥免疫組庫(kù)分析的數(shù)據(jù)準(zhǔn)備
        3.2.2 三種癌癥及其亞型的免疫組庫(kù)對(duì)比分析方法
    3.3 三種癌癥的免疫組庫(kù)分析結(jié)果
        3.3.1 非小細(xì)胞肺癌的免疫組庫(kù)分析結(jié)果
        3.3.2 結(jié)直腸癌的免疫組庫(kù)分析結(jié)果
        3.3.3 黑色素瘤的免疫組庫(kù)分析結(jié)果
        3.3.4 癌癥亞型的免疫組庫(kù)對(duì)比分析結(jié)果
    3.4 本章小結(jié)
第4章 基于單細(xì)胞數(shù)據(jù)的癌癥預(yù)測(cè)模型建立
    4.1 引言
    4.2 癌癥預(yù)測(cè)模型的數(shù)據(jù)準(zhǔn)備及建立方法
        4.2.1 癌癥預(yù)測(cè)模型的數(shù)據(jù)準(zhǔn)備
        4.2.2 癌癥預(yù)測(cè)模型的建立方法
    4.3 癌癥預(yù)測(cè)模型的結(jié)果
    4.4 本章小結(jié)
結(jié)論
參考文獻(xiàn)
附錄
致謝


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]三種統(tǒng)計(jì)指標(biāo)在IGH免疫組庫(kù)分析中的應(yīng)用[J]. 王芳,房建成,許媛麗,李婷婷,劉紅星.  中國(guó)免疫學(xué)雜志. 2018(11)
[2]免疫組庫(kù)分析在血液腫瘤中的研究和應(yīng)用進(jìn)展[J]. 劉紅星,陳雪,王芳.  白血病·淋巴瘤. 2017 (02)
[3]大數(shù)據(jù):基于高通量測(cè)序的抗體組學(xué)發(fā)展與應(yīng)用[J]. 張?jiān)趯?管茜,張鎮(zhèn)海.  南方醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào). 2015(04)
[4]Identification of metastasis-associated genes in colorectal cancer through an integrated genomic and transcriptomic analysis[J]. Xiaobo Li,Sihua Peng.  Chinese Journal of Cancer Research. 2013(06)



本文編號(hào)：3467978