DNAH10突變?cè)谛〖?xì)胞肺癌原發(fā)化療耐藥中的作用及機(jī)制探討
發(fā)布時(shí)間:2021-10-19 14:49
小細(xì)胞肺癌(SCLC)是一種侵襲性惡性腫瘤,占所有肺癌診斷的14%。吸煙是造成DNA損傷的重要原因,并且是SCLC的主要原因(>95%的患者)。已有研究證明,幾乎所有SCLC腫瘤中均有RB1和TP53的雙等位基因功能喪失改變,但是未知意義突變的豐度和異質(zhì)性對(duì)SCLC病理生理學(xué)的機(jī)制性研究提出了嚴(yán)峻的挑戰(zhàn)。盡管進(jìn)行了數(shù)十年的積極研究,SCLC的治療選擇仍然有限。在過(guò)去的幾年中,基于鉑類藥物的化學(xué)療法已經(jīng)成為小細(xì)胞肺癌(SCLC)患者的標(biāo)準(zhǔn)一線治療方法。大部分患者在早期化療中反應(yīng)良好,但極容易出現(xiàn)耐藥性,亦有一部分患者在最初治療階段即出現(xiàn)化療耐藥,但目前尚不清楚SCLC中順鉑耐藥性發(fā)展的機(jī)制。所以解決小細(xì)胞肺癌的化療耐藥成為SCLC的治療需要解決的關(guān)鍵問(wèn)題。在本研究中,第一部分利用數(shù)據(jù)庫(kù)信息分析了來(lái)自癌癥藥物敏感性基因組學(xué)小細(xì)胞肺癌細(xì)胞系(GDSC,N=55)的全外顯子測(cè)序(WES)數(shù)據(jù)集和已發(fā)表研究的小細(xì)胞肺癌的隊(duì)列(N=101)的WES數(shù)據(jù)和整體生存率(OS),以尋找順鉑耐藥性靶基因和與不良預(yù)后相關(guān)的基因。結(jié)果發(fā)現(xiàn)SCLC中的DNAH10突變與原發(fā)順鉑耐藥性相關(guān)(P=0.0350...
【文章來(lái)源】:南方醫(yī)科大學(xué)廣東省
【文章頁(yè)數(shù)】:176 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【部分圖文】:
圖3?55個(gè)SCLC細(xì)胞系的基因組改變是根據(jù)其對(duì)順鉆的敏感性排列的(從對(duì)順鉑敏感性??到耐藥性的排列)
?博士學(xué)位論文???3、在GDSC-SCLC細(xì)胞系中鑒定差異表達(dá)基因(DEG)??通過(guò)limma軟件包在R軟件中分析了?GDSC-SCLC細(xì)胞系的mRNA表達(dá)矩??陣文件。?值<〇.〇5,?〇3/2或£2/3。被選為截止標(biāo)準(zhǔn)。所有157度的熱圖??顯示在圖5A中。與順鉑敏感的GDSC-SCLC細(xì)胞系相比,在耐順鉑的??GDSC-SCLC細(xì)胞系中觀察到60個(gè)上調(diào)的差異表達(dá)基因和97個(gè)下調(diào)的差異表達(dá)??基因(圖5B,表5)。??:■???^? ̄-?4l?C<Jlo?,e??〇FC*0?5?5Tr?ni?ii?e<〇fi?9e<*BiOTfterMtt?ro(<>o*n9ene'?9^??ppferaipipiip?二—??h?*'?a?b??圖5顯示DEG的熱圖和火山圖。(A)DNAH10突變和野生型DNAH10SCLC細(xì)胞系[60??個(gè)上調(diào)的基因(紅色)和97個(gè)下調(diào)的基因(藍(lán)色)]之間所有157個(gè)DEG的熱圖。(B)??DNAH10突變的和野生型DNAH10SCLC細(xì)胞系之間差異表達(dá)的mRNA的火山圖。紅色??表示高表達(dá),綠色表示低表達(dá)(|FC|>?1.5和P<0.05)。使用R軟件(版本3.6)中的limma??軟件包計(jì)算DEG。60個(gè)高表達(dá)DEG和97個(gè)低表達(dá)DEG;鹕綀D由R語(yǔ)言的ggplot2軟??件包進(jìn)行。DEGs:差異表達(dá)基因;FC:倍數(shù)變化;SCLC:小細(xì)胞肺癌。??23??
?TMB?(MuVMbp)?Q?Q?令弋奪??z?,?J??d?0?C3?DNAHIO-wildtype?ceil?lines?f?CU?DNAHIO-wlldtype?cell?Hnes??5-]?(=□?DNAHKMnutated?cell?iln???D?DNAH10-muta?d?c?tl?lines??3“?ilmiaiii?iii??*??b?〇.?^b.?<V?b.?A?*V?Etoposide?lrinot?can?Topot*can??z?,??圖7?(A)基于GDSC數(shù)據(jù)庫(kù)中55個(gè)SCLC細(xì)胞系的DNAH10突變狀態(tài)的TMB分布。(B)??GDSC中55個(gè)SCLC細(xì)胞系的TMB和WES與In?IC50值之間的相關(guān)性(P?=?0.0166;??Sprearmanr?=?0.3247)。?(C)?DNAH10突變患者的DDR相關(guān)途徑中突變計(jì)數(shù)增加的趨勢(shì)。??(D)基于GDSC數(shù)據(jù)庫(kù)中55個(gè)SCLC細(xì)胞系的DNAH10突變狀態(tài)的DNAH10表達(dá)分布。??(E)?DNAH10突變患者免疫檢查點(diǎn)表達(dá)的趨勢(shì)。(F)基于GDSC中SCLC細(xì)胞系DNAH10??突變狀態(tài)的三種藥物的IC50值。SCLC:小細(xì)胞肺癌;GDSC:癌癥項(xiàng)目中藥物敏感性的??基因組學(xué);FA,范科尼貧血;HR,同源重組;NHEJ,非同源末端連接;BER,基礎(chǔ)??切除修復(fù);MMR,不匹配維修;NER,核苷酸切除修復(fù);DSB,雙鏈斷裂;SSB,單??鏈斷裂;TMB,腫瘤突變負(fù)擔(dān)。??7?DNAH10表達(dá)與免疫檢查點(diǎn)及DDR途徑相關(guān)性??我們發(fā)現(xiàn)DNAH10的RNA表達(dá)水平與免疫檢査點(diǎn)(例如LAG3,CTAL4,?TIGIT和??H
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]運(yùn)用抗PD-L1抗體治療晚期癌癥患者的安全性與療效評(píng)價(jià)[J]. 姜孝新,Julie R.Brahmer,Scott S.Tykodi,Laura Q.M.Chow. 腫瘤藥學(xué). 2012(03)
本文編號(hào):3445078
【文章來(lái)源】:南方醫(yī)科大學(xué)廣東省
【文章頁(yè)數(shù)】:176 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【部分圖文】:
圖3?55個(gè)SCLC細(xì)胞系的基因組改變是根據(jù)其對(duì)順鉆的敏感性排列的(從對(duì)順鉑敏感性??到耐藥性的排列)
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?TMB?(MuVMbp)?Q?Q?令弋奪??z?,?J??d?0?C3?DNAHIO-wildtype?ceil?lines?f?CU?DNAHIO-wlldtype?cell?Hnes??5-]?(=□?DNAHKMnutated?cell?iln???D?DNAH10-muta?d?c?tl?lines??3“?ilmiaiii?iii??*??b?〇.?^b.?<V?b.?A?*V?Etoposide?lrinot?can?Topot*can??z?,??圖7?(A)基于GDSC數(shù)據(jù)庫(kù)中55個(gè)SCLC細(xì)胞系的DNAH10突變狀態(tài)的TMB分布。(B)??GDSC中55個(gè)SCLC細(xì)胞系的TMB和WES與In?IC50值之間的相關(guān)性(P?=?0.0166;??Sprearmanr?=?0.3247)。?(C)?DNAH10突變患者的DDR相關(guān)途徑中突變計(jì)數(shù)增加的趨勢(shì)。??(D)基于GDSC數(shù)據(jù)庫(kù)中55個(gè)SCLC細(xì)胞系的DNAH10突變狀態(tài)的DNAH10表達(dá)分布。??(E)?DNAH10突變患者免疫檢查點(diǎn)表達(dá)的趨勢(shì)。(F)基于GDSC中SCLC細(xì)胞系DNAH10??突變狀態(tài)的三種藥物的IC50值。SCLC:小細(xì)胞肺癌;GDSC:癌癥項(xiàng)目中藥物敏感性的??基因組學(xué);FA,范科尼貧血;HR,同源重組;NHEJ,非同源末端連接;BER,基礎(chǔ)??切除修復(fù);MMR,不匹配維修;NER,核苷酸切除修復(fù);DSB,雙鏈斷裂;SSB,單??鏈斷裂;TMB,腫瘤突變負(fù)擔(dān)。??7?DNAH10表達(dá)與免疫檢查點(diǎn)及DDR途徑相關(guān)性??我們發(fā)現(xiàn)DNAH10的RNA表達(dá)水平與免疫檢査點(diǎn)(例如LAG3,CTAL4,?TIGIT和??H
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]運(yùn)用抗PD-L1抗體治療晚期癌癥患者的安全性與療效評(píng)價(jià)[J]. 姜孝新,Julie R.Brahmer,Scott S.Tykodi,Laura Q.M.Chow. 腫瘤藥學(xué). 2012(03)
本文編號(hào):3445078
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