第一部分靜止幾活化胰腺星狀細(xì)胞差異表達(dá)基因的篩選及生物信息學(xué)分析目的:胰腺癌具有發(fā)現(xiàn)晚、進(jìn)展快、可手術(shù)比例小、高耐藥率以及高病死率的特點(diǎn),被稱為“癌癥之王”,而其顯著病理特點(diǎn)為:以PSC為中心,ECM主導(dǎo)的胰腺癌組織纖維結(jié)締組織生成。隨著基因技術(shù)、信息技術(shù)的飛速發(fā)展,大數(shù)據(jù)時(shí)代的到來(lái),生物信息學(xué)這一門跨學(xué)科手段成為人們從宏觀角度解讀疾病的又一利器。因此我們采用這一手段,篩選靜止及活化狀態(tài)下PSC的差異表達(dá)基因并對(duì)其進(jìn)行生物信息學(xué)分析。方法:選取北京協(xié)和醫(yī)院8例經(jīng)病理確診為胰腺導(dǎo)管腺癌患者的癌組織原代培養(yǎng)PSC。連續(xù)5天每天加入ATRA避光培養(yǎng)獲得靜止?fàn)顟B(tài)PSC,分別提取靜止及活化狀態(tài)下PSC基因組進(jìn)行測(cè)序分析,從中篩選出DEG,利用包括GO分析和KEGG生物學(xué)通路富集分析在內(nèi)的生物信息學(xué)方法,進(jìn)一步探索DEG間的生物關(guān)聯(lián)及作用。結(jié)果:從33289條基因中篩選出192個(gè)DEG,其中上調(diào)表達(dá)基因109個(gè),下調(diào)表達(dá)基因83個(gè),其中排在前三位的下調(diào)基因是:HR、RP11-624L4.1和FGF9。GO富集分析生物過(guò)程BP部分排在前2位的是:細(xì)胞外結(jié)構(gòu)組織和細(xì)胞外基質(zhì)組織;CC部分排在前3位的是... 

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【文章頁(yè)數(shù)】：44 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【文章目錄】：
序
摘要
Abstract
前言
第一部分 靜止及活化狀態(tài)胰腺星狀細(xì)胞差異表達(dá)基因的篩選
    1. 材料與方法
        1.1 樣本收集
        1.2 實(shí)驗(yàn)材料
        1.3 實(shí)驗(yàn)方法
    2. 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
        2.1 DEG篩選
        2.2 生物信息學(xué)分析
    3. 討論
    4. 結(jié)論
第二部分FGF9及其相關(guān)受體的RT-qPCR驗(yàn)證
    1. 材料與方法
        1.1 實(shí)驗(yàn)所需試劑、耗材及儀器見表 1.1
        1.2 實(shí)驗(yàn)方法
    2. 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
        2.1 qPCR結(jié)果
    3. 討論
    4. 結(jié)論
綜述
參考文獻(xiàn)
作者簡(jiǎn)介
致謝


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]成纖維細(xì)胞生長(zhǎng)因子受體2在胃癌中的研究進(jìn)展[J]. 魏文珍,王玉平,周永寧.  醫(yī)學(xué)綜述. 2016(12)
[2]成纖維細(xì)胞生長(zhǎng)因子及其受體抑制劑的研究進(jìn)展[J]. 杜培娟.  化學(xué)與生物工程. 2014(12)
[3]成纖維細(xì)胞生長(zhǎng)因子受體3研究進(jìn)展[J]. 楊啟紅.  國(guó)外醫(yī)學(xué).遺傳學(xué)分冊(cè). 2003(05)



本文編號(hào)：3442181