背景和目的酪氨酸激酶抑制劑（tyrosine kinase inhibitor,TKI）的廣泛應(yīng)用顯著地改善了慢性髓系白血�。╟hronic myeloid leukemia,CML）患者的緩解率及長(zhǎng)期生存。但仍有小部分患者由于藥物不耐受和（或）耐藥而出現(xiàn)病情進(jìn)展和難治復(fù)發(fā),這也是目前CML臨床治療中的難點(diǎn)和研究熱點(diǎn)。而目前患者對(duì)TKI產(chǎn)生耐藥的機(jī)制主要分為BCR-ABL1依賴性和非BCR-ABL1依賴性兩種。BCR-ABL1依賴性主要是由于激酶區(qū)突變和BCR-ABL1基因擴(kuò)增,而非BCR-ABL1依賴性的耐藥機(jī)制就比較復(fù)雜。新進(jìn)研究發(fā)現(xiàn)CML耐藥患者白血病細(xì)胞中存在能量代謝紊亂,糖酵解亢進(jìn),且伊馬替尼（Imatinib,IM）治療可一定程度使敏感細(xì)胞內(nèi)能量代謝正�；�,而在耐IM的CML細(xì)胞中始終維持著高糖酵解代謝狀態(tài)。探討CML白血病細(xì)胞對(duì)IM產(chǎn)生非BCR-ABL1依賴性耐藥機(jī)制的能量代謝特點(diǎn)以及能量代謝在耐藥機(jī)制中的作用。以及對(duì)TKI耐藥和（或）不耐受的CML患者腫瘤相關(guān)基因突變進(jìn)行檢測(cè)分析。研究方法使用深度測(cè)序及液相色譜聯(lián)用質(zhì)譜技術(shù)（LC-M S）對(duì)比不攜帶BCR-A B L1激... 

【文章來源】：南方醫(yī)科大學(xué)廣東省

【文章頁數(shù)】：111 頁

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

圖１－２?Ｉｍａｔｉｎｉｂ作用Ｋ５６２－Ｓ和Ｋ５６２－Ｒ細(xì)胞４８小時(shí)后的凋亡率（°／〇）??

如基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建（ＷＧＣＮＡ）、體細(xì)胞突變檢測(cè)等。??信息分析流程如下圖所示：??｜?掀激賭振（ｒａｗ?ｄａｔａ?）?｜??－?Ｉ?（ｄｅｓｎ?ｄｔｕ?）］??參考爲(wèi)因組對(duì)比??１???▼?Ｖ??｜?ａ因表挺麗分析?］?｜?１???＇ｆ??＇?ｒ??［?ＲＮＡ－Ｓ？ｑｉａ矢性分析?｜習(xí)分硏１??：?Ｉ?：?”??丨?慕因膝，達(dá)分析］?丨８怡基豳￡３？?｜??ｍｍｓｍｍ?｜?ｓ因集＾分櫨?｜蛋白巨作網(wǎng)絡(luò)??．莒ｍ芬析?（ＧＳＥＡ）?｜?分儕??圖２－１?ＲＮＡ－ｓｅｑ信息分析技術(shù)流程??Ｆｉｇｕｒｅ?２－１?Ｆｌｏｗ?ｃｈａｒｔ?ｏｆ?ＲＮＡ－ｓｅｑ?ｉｎｆｏｒｍａｔｉｏｎ?ａｎａｌｙｓｉｓ??２．１．２．１數(shù)據(jù)質(zhì)控??測(cè)序片段被高通量測(cè)序儀測(cè)得的圖像數(shù)據(jù)經(jīng)ＣＡＳＡＶＡ堿基識(shí)別轉(zhuǎn)化為序列??數(shù)據(jù)（ｒｅａｄｓ），文件為ｆａｓｔｑ格式，其中主要包含測(cè)序片段的序列信息以及其對(duì)??１７??

?第二章慢性髓系白血病細(xì)胞系多組學(xué)研究???ＦＰＫＭ，用盒形圖展示不同樣本基因表達(dá)水平的分布情況，如下圖所示。??可看出六個(gè)樣本的基因定量表達(dá)量分布比較相近，由于Ｋ５６２－Ｓ與Ｋ５６２－Ｒ??均為Ｋ５６２細(xì)胞株來源，上一章節(jié)也通過細(xì)胞鑒定己證實(shí)同源性，基因表達(dá)水平??分布也呈現(xiàn)相近的狀態(tài)。??ｇｅｎｅ?ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ?ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎ??：?！??Ｉ?ｉ?ｉ?ｊ?Ｉ??１０．?ｉｌｌ??Ｉ?ｇｒｏｕｐ??碁?｜?＠?Ｋ５６２－Ｓ??蕃?自Ｋ５６２－Ｒ??５－??［ｌｈ?■■?■■?■■??４＂?奪令？?令?分?ｐ??ｓａｍｐｌｅ??圖２－２樣本基因表達(dá)量分布盒形圖??Ｆｉｇｕｒｅ?２－２?Ｂｏｘ?ｐｌｏｔ?ｏｆ?ｇｅｎｅ?ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ?ｉｎ?ｓａｍｐｌｅｓ??３．１．２差異分析??對(duì)其表達(dá)數(shù)據(jù)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析，篩選樣本在不同狀態(tài)下表達(dá)水平顯著差異??的基因。差異分析主要分為三個(gè)步驟。首先對(duì)原始的ｒｅａｄｃｏｕｎｔ進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化，主??要是對(duì)測(cè)序深度的校正，然后統(tǒng)計(jì)學(xué)模型進(jìn)行假設(shè)檢驗(yàn)概率（ｐ?ｖａｌｕｅ）的計(jì)算，??最后進(jìn)行多重假設(shè)檢驗(yàn)校正，得到校正Ｐ值（ｐａｄｊ）?［２８］。我們每組設(shè)有３個(gè)生物??重復(fù)，差異基因篩選的標(biāo)準(zhǔn)定為丨ｌｏｇ２（ＦｏｌｄＣｈａｎｇｅ）｜＞０＆ｐａｄ＿ｊ＜０．０５，在這個(gè)標(biāo)??準(zhǔn)上我們篩選出了?１３０８?jìng)�(gè)基因，其中７４４個(gè)基因在Ｋ５６２－Ｒ組中表達(dá)上升，５６４??個(gè)基因表達(dá)下降�；鹕綀D可直觀地展現(xiàn)兩組間的差異基因分布情況，如下圖所??不。??２４??

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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博士論文
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碩士論文
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本文編號(hào)：3423202