研究背景環(huán)狀RNA（circular RNA,circRNA）是一類新型的非編碼RNA,在惡性腫瘤的進(jìn)展中發(fā)揮重要作用。然而,circRNA在食管鱗狀細(xì)胞癌（esophageal squamous cell carcinoma,ESCC）中的作用尚不清楚,因此我們構(gòu)建我國(guó)高發(fā)區(qū)ESCC的circRNA表達(dá)譜,并探討關(guān)鍵circRNA在ESCC中的功能及機(jī)制。第一部分 食管鱗狀細(xì)胞癌相關(guān)circRNA表達(dá)譜分析目的構(gòu)建我國(guó)高發(fā)區(qū)ESCC相關(guān)circRNA表達(dá)譜,篩選出差異表達(dá)circRNA并對(duì)其進(jìn)行功能預(yù)測(cè)。方法選取6對(duì)ESCC組織和配對(duì)癌旁正常組織樣本,采取基因芯片技術(shù)和微陣列分析構(gòu)建circRNA表達(dá)譜;以差異倍數(shù)（FC）≥ 2倍且p<0.05為條件,篩選差異表達(dá)的circRNA;通過(guò)GO和Pathway分析,預(yù)測(cè)circRNA的功能;構(gòu)建circRNA-miRNA調(diào)控網(wǎng)絡(luò)圖,探討circRNA作用機(jī)制。結(jié)果CircRNA在ESCC組織與匹配癌旁正常組織的表達(dá)差異明顯,共發(fā)現(xiàn)15908個(gè)circRNAs表達(dá)失調(diào)（FC≥2.0,p值<0.05）,其中上調(diào)7161個(gè),下調(diào)87... 

【文章來(lái)源】：鄭州大學(xué)河南省 211工程院校

【文章頁(yè)數(shù)】：128 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：博士

【部分圖文】：

圖２食管鱗癌全樣本ｃｉｒｃＲＮＡ表達(dá)分析（Ａ）聚類分析，（Ｂ）相關(guān)性分析，（Ｃ）箱線圖，??（Ｄ）主成分分析??Ｆｉｇｕｒｅ?２?Ａｎａｌｙｓｉｓ?

?第一部分食管鱗狀細(xì)胞癌相關(guān)ｃｉｒｃＲＮＡ表達(dá)譜分析???Ｅ?Ｆ??■?Ｕｐｒｅｇｕｌａｔｅｄ?ｃｉｒｃＲＮＡｓ?ＩＳｆＫＩｆｌ??Ｈ?Ｄｏｗｎｒｅｇｕｌａｔ？ｄ?ｃｉｒｃＲＮＡｓ??□?Ｔｏｔａｌ?ｎｒｃＲＮＡｓ?１６０００?■??■?ｕｐ－ｒｅｇｕｌａＫｄ?ｃｉｒｃＲＮＡ??ｎ?１４０００?■?Ｃ??■?ｄｏｗｎ－ｒｅａｕｌａｔｅｄ?ｃｉｒｃＲＮＡ??１２０００?漏??＾?＾?ｄ?ａ?ｔｏｔａｌ?ａｒｃＫＮＡ??ｌ＿塵―—＂＾?ｉ１??圖３食管鱗狀細(xì)胞癌ｃｉｒＲＮＡ差異表達(dá)（Ａ）聚類分析圖，（Ｂ）散點(diǎn)圖，（Ｃ）火山圖，??（Ｄ）圓環(huán)圖，（Ｅ）?ｃｉｒｃＲＮＡ染色體分布圖，（Ｆ）?ｃｉｒｃＲＮＡ來(lái)源圖??Ｆｉｇｕｒｅ?３?Ｄｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｌ?ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ?ｏｆ?ｃｉｒｃＲＮＡｓ?ｉｎ?ＥＳＣＣ．?（Ａ）?Ｈｉｅｒａｒｃｈｉｃａｌ?ｃｌｕｓｔｅｒｉｎｇ．?（Ｂ）?Ｓｃａｔｔｅｒ??ｐｌｏｔ．?（Ｃ）?Ｖｏｌｃａｎｏ?ｐｌｏｔ．?（Ｄ）?Ｃｉｒｃｏｓ?ｐｌｏｔ．?（Ｅ）?ＣｉｒｃＲＮＡ?ｃｈｒｏｍｏｓｏｍａｌ?ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎｓ．?（Ｆ）?ＣｉｒｃＲＮＡ??ｓｏｕｒｃｅ．??２．３差異ｃｉｒｃＲＮＡ基因注釋富集分析??２．３．１?ＧＯ基因功能富集分析??圖４Ａ可見(jiàn)ｃｉｒｃＲＮＡ的宿主基因在ＢＰ、ＣＣ和ＭＦ中均有分布。ＢＰ中，差??異表達(dá)ｃｉｒｃＲＮＡ主要分布在細(xì)胞過(guò)程（ｃｅｌｌｕｌａｒ?ｐｒｏｃｅｓｓ）、單組織過(guò)程??（ｓｉｎｇｌｅ－ｏｒｇａｎｉｓｍ）、代謝過(guò)程（ｍｅｔａｂｏｌｉｃ?ｐｒｏｃｅｓｓ）、生物調(diào)節(jié)（ｂｉｏｌｏｇｉｃａｌ?ｒｅｇｕｌａｔｉｏｎ）??和生物過(guò)程調(diào)節(jié)（ｒ

?第一部分食管鱗狀細(xì)胞癌相關(guān)ｃｉｒｃＲＮＡ表達(dá)譜分析???＿?＿｜屢＿?顯＿?Ｉ??－??圖４Ａ食管鱗狀細(xì)胞癌差異表達(dá)ｃｉｒｃＲＮＡ基因ＧＯ功能分類圖??Ｆｉｇｕｒｅ?４Ａ?Ｃｌａｓｓｉｆｉｃａｔｉｏｎ?ｏｆ?ＧＯ?ｆｕｎｃｔｉｏｎ?ｏｆ?ｄｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｌｌｙ?ｅｘｐｒｅｓｓｅｄ?ｃｉｒｃＲＮＡ?ｉｎ?ＥＳＣＣ??２．３．２?Ｐａｔｈｗａｙ富集分析??圖４Ｂ可見(jiàn)，ｃｉｒｃＲＮＡ差異表達(dá)主要富集Ｐａｔｈｗａｙ有細(xì)胞外基質(zhì)受體相互作??用（ＥＣＭ－ｒｅｃｅｐｔｏｒ?ｉｎｔｅｒａｃｔｉｏｎ）、粘著斑（ｆｏｃａｌ?ａｄｈｅｓｉｏｎ）、蛋白質(zhì)消化與吸收??（ｐｒｏｔｅｉｎ?ｄｉｇｅｓｔｉｏｎ?ａｎｄ?ａｂｓｏｒｐｔｉｏｎ）、阿米巴�。ǎ粒恚铮澹猓椋幔螅椋螅�、緊密接頭（ｔｉｇｈｔ??ｊｕｎｃｔｉｏｎ）和ＤＮＡ復(fù)制（ＤＮＡ?ｒｅｐｌｉｃａｔｉｏｎ）等，其他Ｐａｔｈｗａｙ上也有少量富集。??圖４Ｂ食管鱗狀細(xì)胞癌差異表達(dá)ｃｉｒｃＲＮＡ基Ｗ?ＫＥＧＧ－Ｐａｔｈｗａｙ閣??Ｆｉｇｕｒｅ?４Ｂ?ＫＥＧＧ－Ｐａｔｈｗａｙ?ｏｆ?ｄｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｌｌｙ?ｅｘｐｒｅｓｓｅｄ?ｃｉｒｃＲＮＡ?ｇｅｎｅｓ?ｉｎ?ＥＳＣＣ??２５??

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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本文編號(hào)：3396753