基于網(wǎng)絡(luò)間隨機(jī)游走算法的lncRNA與疾病關(guān)系預(yù)測
發(fā)布時(shí)間:2021-08-21 06:11
通過構(gòu)造疾病之間、lncRNA之間、基因之間的相似性網(wǎng)絡(luò)模型,根據(jù)已有三者之間的相互關(guān)聯(lián)數(shù)據(jù),引入網(wǎng)絡(luò)間隨機(jī)游走算法預(yù)測潛在與疾病相關(guān)的lncRNA。將該算法應(yīng)用到已有數(shù)據(jù)庫中的lncRNA與疾病關(guān)聯(lián)信息數(shù)據(jù)上,通過10倍交叉驗(yàn)證和AUC評估該算法。結(jié)果表明:與其他算法相比,該算法在10倍交叉驗(yàn)證下有更優(yōu)的AUC值,顯示該算法具有良好的預(yù)測性能。進(jìn)一步應(yīng)用該算法預(yù)測了與胃癌和結(jié)直腸癌相關(guān)的lncRNA,結(jié)果與已知的醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)一致,表明該算法對于新疾病相關(guān)lnRNA的預(yù)測結(jié)果是有效的。
【文章來源】:浙江理工大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2020,43(05)
【文章頁數(shù)】:8 頁
【部分圖文】:
網(wǎng)絡(luò)間隨機(jī)游走算法結(jié)構(gòu)框架
LRLSLDA、GrwLDA、BPLLDA和
本文編號(hào):3355038
【文章來源】:浙江理工大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2020,43(05)
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網(wǎng)絡(luò)間隨機(jī)游走算法結(jié)構(gòu)框架
LRLSLDA、GrwLDA、BPLLDA和
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