盆腔菌群與上皮性卵巢癌的相關(guān)性研究
發(fā)布時(shí)間:2021-08-01 18:08
目的上皮性卵巢癌是女性生殖系統(tǒng)常見(jiàn)的惡性腫瘤,由于病因及發(fā)生機(jī)制不明,晚期患者五年生存率僅40%,其病死率居?jì)D科惡性腫瘤之首。近來(lái)多項(xiàng)研究表明,人體微環(huán)境菌群的變化可能與人體腫瘤的發(fā)生有關(guān)。當(dāng)前研究發(fā)現(xiàn)女性生殖道具有獨(dú)特的菌落結(jié)構(gòu),盆腔是卵巢存在的微環(huán)境,因而更具有研究?jī)r(jià)值和臨床意義。本課題旨在探究上皮性卵巢癌患者的盆腔菌群特征,闡明盆腔菌群與上皮性卵巢癌的相關(guān)性,為卵巢癌的診治及預(yù)后預(yù)測(cè)提供有效的思路及價(jià)值。方法研究對(duì)象為在浙江大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬邵逸夫醫(yī)院及浙江省腫瘤醫(yī)院住院的手術(shù)患者,分為上皮性卵巢癌組、卵巢良性腫瘤組及子宮肌瘤組(對(duì)照組),共50例,術(shù)中收集直腸子宮陷凹腹腔液標(biāo)本。根據(jù)組織學(xué)類(lèi)型、病理分級(jí)、有無(wú)淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移等臨床特征進(jìn)行分組。采用16Sr RNA基因高通量測(cè)序技術(shù)以及高級(jí)生物信息分析及統(tǒng)計(jì)方法,比較明確盆腔菌群種類(lèi)及豐度,篩選差異菌群,構(gòu)建診斷模型,進(jìn)行菌群功能分析,篩選相關(guān)通路。結(jié)果(1)16Sr RNA基因高通量測(cè)序分析顯示上皮性卵巢癌患者具有獨(dú)特的盆腔菌群結(jié)構(gòu),相對(duì)于肌瘤組有顯著的菌群差異性,但對(duì)于卵巢良性腫瘤組,差異性不顯著。(2)基于觀測(cè)到的OTU數(shù)目,顯示卵...
【文章來(lái)源】:浙江大學(xué)浙江省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:69 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
(1.A)臨床樣本處理流程圖;(1.B)數(shù)據(jù)分析流程圖
浙江大學(xué)碩士學(xué)位論文結(jié)果12圖2提取的部分樣本(上皮性卵巢癌、卵巢良性腫瘤及子宮肌瘤組)的DNA電泳結(jié)果。3.3PCR擴(kuò)增鑒定測(cè)序區(qū)域的不同對(duì)環(huán)境中微生物的豐富性及多樣性估計(jì)影響很大,偏高或偏低都會(huì)對(duì)數(shù)據(jù)的可靠性造成很大的干擾,研究中我們選取的細(xì)菌V3-V4區(qū)域進(jìn)行PCR擴(kuò)増,這一區(qū)域的基因組DNA對(duì)環(huán)境中微生物的種類(lèi)及相對(duì)豐度估計(jì)更加準(zhǔn)確。部分樣本PCR擴(kuò)增結(jié)果如圖3所示,我們可以看到在此條件下大部分樣品菌群基因組都可以被擴(kuò)增出來(lái)。圖3使用V3-V4區(qū)帶有的特異引物PCR擴(kuò)增后部分樣本基因組DNA凝膠電泳鑒定圖(目的條帶為430bp)。
浙江大學(xué)碩士學(xué)位論文結(jié)果12圖2提取的部分樣本(上皮性卵巢癌、卵巢良性腫瘤及子宮肌瘤組)的DNA電泳結(jié)果。3.3PCR擴(kuò)增鑒定測(cè)序區(qū)域的不同對(duì)環(huán)境中微生物的豐富性及多樣性估計(jì)影響很大,偏高或偏低都會(huì)對(duì)數(shù)據(jù)的可靠性造成很大的干擾,研究中我們選取的細(xì)菌V3-V4區(qū)域進(jìn)行PCR擴(kuò)増,這一區(qū)域的基因組DNA對(duì)環(huán)境中微生物的種類(lèi)及相對(duì)豐度估計(jì)更加準(zhǔn)確。部分樣本PCR擴(kuò)增結(jié)果如圖3所示,我們可以看到在此條件下大部分樣品菌群基因組都可以被擴(kuò)增出來(lái)。圖3使用V3-V4區(qū)帶有的特異引物PCR擴(kuò)增后部分樣本基因組DNA凝膠電泳鑒定圖(目的條帶為430bp)。
本文編號(hào):3315997
【文章來(lái)源】:浙江大學(xué)浙江省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:69 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
(1.A)臨床樣本處理流程圖;(1.B)數(shù)據(jù)分析流程圖
浙江大學(xué)碩士學(xué)位論文結(jié)果12圖2提取的部分樣本(上皮性卵巢癌、卵巢良性腫瘤及子宮肌瘤組)的DNA電泳結(jié)果。3.3PCR擴(kuò)增鑒定測(cè)序區(qū)域的不同對(duì)環(huán)境中微生物的豐富性及多樣性估計(jì)影響很大,偏高或偏低都會(huì)對(duì)數(shù)據(jù)的可靠性造成很大的干擾,研究中我們選取的細(xì)菌V3-V4區(qū)域進(jìn)行PCR擴(kuò)増,這一區(qū)域的基因組DNA對(duì)環(huán)境中微生物的種類(lèi)及相對(duì)豐度估計(jì)更加準(zhǔn)確。部分樣本PCR擴(kuò)增結(jié)果如圖3所示,我們可以看到在此條件下大部分樣品菌群基因組都可以被擴(kuò)增出來(lái)。圖3使用V3-V4區(qū)帶有的特異引物PCR擴(kuò)增后部分樣本基因組DNA凝膠電泳鑒定圖(目的條帶為430bp)。
浙江大學(xué)碩士學(xué)位論文結(jié)果12圖2提取的部分樣本(上皮性卵巢癌、卵巢良性腫瘤及子宮肌瘤組)的DNA電泳結(jié)果。3.3PCR擴(kuò)增鑒定測(cè)序區(qū)域的不同對(duì)環(huán)境中微生物的豐富性及多樣性估計(jì)影響很大,偏高或偏低都會(huì)對(duì)數(shù)據(jù)的可靠性造成很大的干擾,研究中我們選取的細(xì)菌V3-V4區(qū)域進(jìn)行PCR擴(kuò)増,這一區(qū)域的基因組DNA對(duì)環(huán)境中微生物的種類(lèi)及相對(duì)豐度估計(jì)更加準(zhǔn)確。部分樣本PCR擴(kuò)增結(jié)果如圖3所示,我們可以看到在此條件下大部分樣品菌群基因組都可以被擴(kuò)增出來(lái)。圖3使用V3-V4區(qū)帶有的特異引物PCR擴(kuò)增后部分樣本基因組DNA凝膠電泳鑒定圖(目的條帶為430bp)。
本文編號(hào):3315997
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