基于增強CT圖像和臨床資料的膽囊息肉良惡性鑒別的影像組學(xué)研究
發(fā)布時間:2021-07-19 10:48
目的:探討基于增強CT圖像和臨床資料的影像組學(xué)鑒別診斷良惡性膽囊息肉樣病變(PLG)的價值。方法:145例PLG接受腹部增強CT檢查、最大徑≥1 cm且經(jīng)病理證實,良性82例,惡性63例,將其隨機按照7:3的比例分為訓(xùn)練集和測試集,回顧性收集這些患者的一般資料并測量相關(guān)傳統(tǒng)CT圖像特征。組學(xué)特征的獲取使用ITK-SNAP軟件手動分割門靜脈期CT圖像的3D ROI,導(dǎo)入AK分析軟件提取影像組學(xué)特征,以Lasso回歸法進行特征降維,借助R語言軟件建立Logistic回歸模型并驗證,采用ROC曲線評價模型的診斷效能。結(jié)果:在測試集中,臨床模型、組學(xué)模型和聯(lián)合模型的AUC值分別為0.861、0.924和0.931,但是聯(lián)合模型和兩個單一模型的AUC值之間的差異沒有統(tǒng)計學(xué)意義。結(jié)論:基于增強CT圖像和臨床資料的影像組學(xué)可有效鑒別≥1cm的膽囊息肉的良惡性。
【文章來源】:中國醫(yī)科大學(xué)遼寧省
【文章頁數(shù)】:38 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
病例篩選流程圖
中國醫(yī)科大學(xué)碩士學(xué)位論文4圖2影像組學(xué)分析流程圖:獲得原始圖像后,進行重采樣,后進行圖像分割,之后使用R語言進行特征提取及篩選,最后建立模型并驗證2.4圖像分割將預(yù)處理后的門脈期CT圖像加載至ITK-SNAP軟件(http://www.itksnap.org,版本3.6.0)中,由2名有經(jīng)驗的影像診斷醫(yī)師在不知曉病理結(jié)果的前提下使用ITK-SNAP軟件在同一窗寬、窗位(150HU、80HU)下手動勾畫門脈期CT圖像的3D感興趣區(qū)(Volumeofinterest,VOI),意見不一致時協(xié)商解決。勾畫時避開臨近明顯強化的血管,將所畫VOI文件以“.nii”格式導(dǎo)出保存至本地。2.5影像組學(xué)特征提取及選擇將重采樣后的門靜脈期CT原始圖像及勾畫好的VOI文件導(dǎo)入AK平臺進行組學(xué)特征提取,VOI自動生成基于病灶形態(tài)學(xué)、CT值大小的相關(guān)特征及基于一階直方圖、高階紋理等相關(guān)的影像組學(xué)特征。采用R語言3.5.2版(https://www.r-project.org)在訓(xùn)練集中選擇影像組學(xué)特征。首先對所有組學(xué)特征的異常值及缺失值進行預(yù)處理,使用中位數(shù)替代異常值及缺失值。然后基于R語言3.5.2版中的“glmnet”包(廣義線性模型),使用Lasso法進行降維,重復(fù)100次,對特征進行不斷迭代選擇,直至篩選得到系數(shù)不為0的特征。2.6臨床特征的提取及選擇追溯每一位入組患者的臨床資料,記錄年齡、性別、病理結(jié)果、CA-125、CA-199、
中國醫(yī)科大學(xué)碩士學(xué)位論文9圖3部分PLG患者的門靜脈期CT圖像A1-A3:病理證實為分化程度不同的腺癌。A1:男性,59歲,PLG位于膽囊底,直徑為1.8cm;A2:女性,66歲,PLG位于膽囊體,直徑為1.7cm;A3:男性,62歲,PLG位于膽囊底,直徑為3.0cm。B1-B3,病理診斷為腺瘤。B1:男性,56歲,PLG位于膽囊底,直徑為1.7cm;B2:女性,65歲,病變位于膽囊頸,直徑為2.8cm;B3:男性,55歲,病變位于膽囊底,直徑為2.1cm。3.2臨床特征模型的構(gòu)建與驗證本研究共納入臨床特征15個,分別是性別、年齡、癥狀、基底寬窄、平掃期CT值、動脈期CT值、門脈期CT值、靜脈期CT值、最大直徑、是否單發(fā)、息肉所在位置、有無結(jié)石。但由于CA-125、CA-199、CEA和平掃期CT值中的缺失值太多,故本研究未將其納入分析。剩余11個特征與PLG的良惡性進行相關(guān)性分析,結(jié)果如圖4所示。
【參考文獻】:
期刊論文
[1]膽囊息肉癌變風(fēng)險分析和臨床處理的研究進展[J]. 鄭亞民,姚貴賓,王悅?cè)A,李非. 醫(yī)學(xué)研究雜志. 2018(08)
[2]膽囊息肉臨床診治的新進展[J]. 張培松,曹葆強,龔仁華. 中醫(yī)臨床研究. 2017(24)
[3]對膽囊息肉樣病變外科處理的思考[J]. 呂文才,賈莉,溫爽,郎桂玲,王希春,孫尚韶,惠揚,于國峰,魏磊,付維利. 中華肝膽外科雜志. 2015 (07)
[4]體檢人員膽囊息肉檢出情況及其相關(guān)因素分析[J]. 王巍,于曉松. 臨床軍醫(yī)雜志. 2015(06)
[5]膽囊息肉樣病變的癌變危險因素分析[J]. 梁荔,馮憲光,周敬強,劉雙. 山東醫(yī)藥. 2014(21)
[6]Analysis of risk factors for polypoid lesions of gallbladder among health examinees[J]. Hua-Li Yang, Lei Kong, Li-Li Hou, Hui-Fang Shen, Yu Wang, Xin-Gang Gu, Jian-Min Qin, Pei-Hao Yin, Qi Li, Department of Ultrasonography, Putuo Hospital, Shanghai University of Traditional Chinese Medicine, Shanghai 200062, China , Department of General Surgery, Putuo Hospital, Shanghai University of Traditional Chinese Medicine, Shanghai 200062, China , Department of Oncology, Putuo Hospital, Shanghai University of Traditional Chinese Medicine, Shanghai 200062, China. World Journal of Gastroenterology. 2012(23)
[7]膽囊息肉樣病變的診治進展[J]. 蘇銘,王學(xué)漢. 中華肝膽外科雜志. 2006(12)
本文編號:3290560
【文章來源】:中國醫(yī)科大學(xué)遼寧省
【文章頁數(shù)】:38 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
病例篩選流程圖
中國醫(yī)科大學(xué)碩士學(xué)位論文4圖2影像組學(xué)分析流程圖:獲得原始圖像后,進行重采樣,后進行圖像分割,之后使用R語言進行特征提取及篩選,最后建立模型并驗證2.4圖像分割將預(yù)處理后的門脈期CT圖像加載至ITK-SNAP軟件(http://www.itksnap.org,版本3.6.0)中,由2名有經(jīng)驗的影像診斷醫(yī)師在不知曉病理結(jié)果的前提下使用ITK-SNAP軟件在同一窗寬、窗位(150HU、80HU)下手動勾畫門脈期CT圖像的3D感興趣區(qū)(Volumeofinterest,VOI),意見不一致時協(xié)商解決。勾畫時避開臨近明顯強化的血管,將所畫VOI文件以“.nii”格式導(dǎo)出保存至本地。2.5影像組學(xué)特征提取及選擇將重采樣后的門靜脈期CT原始圖像及勾畫好的VOI文件導(dǎo)入AK平臺進行組學(xué)特征提取,VOI自動生成基于病灶形態(tài)學(xué)、CT值大小的相關(guān)特征及基于一階直方圖、高階紋理等相關(guān)的影像組學(xué)特征。采用R語言3.5.2版(https://www.r-project.org)在訓(xùn)練集中選擇影像組學(xué)特征。首先對所有組學(xué)特征的異常值及缺失值進行預(yù)處理,使用中位數(shù)替代異常值及缺失值。然后基于R語言3.5.2版中的“glmnet”包(廣義線性模型),使用Lasso法進行降維,重復(fù)100次,對特征進行不斷迭代選擇,直至篩選得到系數(shù)不為0的特征。2.6臨床特征的提取及選擇追溯每一位入組患者的臨床資料,記錄年齡、性別、病理結(jié)果、CA-125、CA-199、
中國醫(yī)科大學(xué)碩士學(xué)位論文9圖3部分PLG患者的門靜脈期CT圖像A1-A3:病理證實為分化程度不同的腺癌。A1:男性,59歲,PLG位于膽囊底,直徑為1.8cm;A2:女性,66歲,PLG位于膽囊體,直徑為1.7cm;A3:男性,62歲,PLG位于膽囊底,直徑為3.0cm。B1-B3,病理診斷為腺瘤。B1:男性,56歲,PLG位于膽囊底,直徑為1.7cm;B2:女性,65歲,病變位于膽囊頸,直徑為2.8cm;B3:男性,55歲,病變位于膽囊底,直徑為2.1cm。3.2臨床特征模型的構(gòu)建與驗證本研究共納入臨床特征15個,分別是性別、年齡、癥狀、基底寬窄、平掃期CT值、動脈期CT值、門脈期CT值、靜脈期CT值、最大直徑、是否單發(fā)、息肉所在位置、有無結(jié)石。但由于CA-125、CA-199、CEA和平掃期CT值中的缺失值太多,故本研究未將其納入分析。剩余11個特征與PLG的良惡性進行相關(guān)性分析,結(jié)果如圖4所示。
【參考文獻】:
期刊論文
[1]膽囊息肉癌變風(fēng)險分析和臨床處理的研究進展[J]. 鄭亞民,姚貴賓,王悅?cè)A,李非. 醫(yī)學(xué)研究雜志. 2018(08)
[2]膽囊息肉臨床診治的新進展[J]. 張培松,曹葆強,龔仁華. 中醫(yī)臨床研究. 2017(24)
[3]對膽囊息肉樣病變外科處理的思考[J]. 呂文才,賈莉,溫爽,郎桂玲,王希春,孫尚韶,惠揚,于國峰,魏磊,付維利. 中華肝膽外科雜志. 2015 (07)
[4]體檢人員膽囊息肉檢出情況及其相關(guān)因素分析[J]. 王巍,于曉松. 臨床軍醫(yī)雜志. 2015(06)
[5]膽囊息肉樣病變的癌變危險因素分析[J]. 梁荔,馮憲光,周敬強,劉雙. 山東醫(yī)藥. 2014(21)
[6]Analysis of risk factors for polypoid lesions of gallbladder among health examinees[J]. Hua-Li Yang, Lei Kong, Li-Li Hou, Hui-Fang Shen, Yu Wang, Xin-Gang Gu, Jian-Min Qin, Pei-Hao Yin, Qi Li, Department of Ultrasonography, Putuo Hospital, Shanghai University of Traditional Chinese Medicine, Shanghai 200062, China , Department of General Surgery, Putuo Hospital, Shanghai University of Traditional Chinese Medicine, Shanghai 200062, China , Department of Oncology, Putuo Hospital, Shanghai University of Traditional Chinese Medicine, Shanghai 200062, China. World Journal of Gastroenterology. 2012(23)
[7]膽囊息肉樣病變的診治進展[J]. 蘇銘,王學(xué)漢. 中華肝膽外科雜志. 2006(12)
本文編號:3290560
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