5-羥甲基化胞嘧啶全基因組測定在胃癌的探索
發(fā)布時間:2021-07-13 16:50
1、背景和目的:胃癌是全球范圍內的第四大惡性腫瘤,第二大致死性疾病,東亞地區(qū)的病例占總體的一半以上。從胃癌的組織學分類來說主要有腺癌、腺鱗癌、鱗癌、類癌等,其中絕大部分是胃腺癌。盡管現(xiàn)在可以通過體格檢查、影像學及內鏡下組織活檢等檢查發(fā)現(xiàn)胃癌,但是中國胃癌患者發(fā)現(xiàn)時大都臨床分期較晚,進展期胃癌比例約占70%,嚴重影響預后。因此探究胃惡性腫瘤的相關的致病機制的研究具有重要的意義。表觀遺傳學是DNA堿基序列沒有改變的情況下,其表型出現(xiàn)可傳遞到下一代變化的一門學科。DNA甲基化是其經(jīng)典調控之一,在各種疾病的調控中起到了重要的作用。近年來,5hmC作為胞嘧啶修飾過程的中間產(chǎn)物,豐富了我們對DNA甲基化的表觀遺傳調控過程的認識,也為我們尋找胃癌相關基因提供新的線索。但目前對于全基因組5hmC在胃癌中的研究甚少。在本研究中,我們將通過hMe-Seal化學標記結合高通量測序,研究5hmC在胃癌中的表達,探討特異性5hmC分布及作用位點與胃癌的關系。2、方法1、收集吉林大學第二醫(yī)院胃腸外科2017年1月至2018年1月病理確診為胃癌患者的手術切除標本6例,每組標本包括腫瘤組織、癌旁組織和遠端正常組織。2...
【文章來源】:吉林大學吉林省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:46 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖2.1?:胃癌和癌旁組織與正常組織相比5hmC表達水平??
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圖4.1癌旁中獲得或失去5hmC的?
【參考文獻】:
期刊論文
[1]淺析胃癌的發(fā)病率與患者年齡的關系[J]. 田園園. 當代醫(yī)藥論叢. 2015(07)
[2]表觀遺傳新標志物5hmC的研究進展[J]. 葛苗苗,蔡春. 生物化學與生物物理進展. 2014(09)
[3]Review of salt consumption and stomach cancer risk:Epidemiological and biological evidence[J]. Paul D Terry. World Journal of Gastroenterology. 2009(18)
[4]Hypermethylation and aberrant expression of Wnt antagonist secreted frizzled-related protein 1 in gastric cancer[J]. Cheng-Hai Zhao, Ning Zhang, Department of Pathophysiology, School of Basic Medicine, China Medical University, Shenyang 110001, Liaoning Province, China Xian-Min Bu, Department of General Surgery, the Second Affiliated Hospital, China Medical University, Shenyang 110004, Liaoning Province, China. World Journal of Gastroenterology. 2007(15)
本文編號:3282436
【文章來源】:吉林大學吉林省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:46 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖2.1?:胃癌和癌旁組織與正常組織相比5hmC表達水平??
?第四章結果???今、*’?V?11?;??,s?#?^?\??:丨'倉之、??二?/?、、丨??丨、?廠??、?**?<??*>??'????Gain?of?5hmC?'????_■■,》**、*?,????Lossof5hmC?泛?<〇??圓3.1:5hmC在胃癌患者中的染色體循環(huán)圏???表3,?1.胃:癌中DhMRs.表達水〒???DhMRs表達水平?5hmC上升位點?5hmC下降位點??T/N?1344?17318??P/N?4795?1876??重合位點?U2S?6??P?v.?.?N??Tv,.N?_??|???Garn^StmC??8,???Gairvof徹C?■?7???toa-〇f-5NnC??£???Low-ol-5hmC??hhiiiL-ii?il??IL?CM?J?■■?(V??!?/?/?^?////?^?^?^///??圖3.2?:DhMRs在胃癌中基因區(qū)域富集情況??18??
圖4.1癌旁中獲得或失去5hmC的?
【參考文獻】:
期刊論文
[1]淺析胃癌的發(fā)病率與患者年齡的關系[J]. 田園園. 當代醫(yī)藥論叢. 2015(07)
[2]表觀遺傳新標志物5hmC的研究進展[J]. 葛苗苗,蔡春. 生物化學與生物物理進展. 2014(09)
[3]Review of salt consumption and stomach cancer risk:Epidemiological and biological evidence[J]. Paul D Terry. World Journal of Gastroenterology. 2009(18)
[4]Hypermethylation and aberrant expression of Wnt antagonist secreted frizzled-related protein 1 in gastric cancer[J]. Cheng-Hai Zhao, Ning Zhang, Department of Pathophysiology, School of Basic Medicine, China Medical University, Shenyang 110001, Liaoning Province, China Xian-Min Bu, Department of General Surgery, the Second Affiliated Hospital, China Medical University, Shenyang 110004, Liaoning Province, China. World Journal of Gastroenterology. 2007(15)
本文編號:3282436
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