利用CRISPR技術(shù)研究Rgnef在胃癌發(fā)生發(fā)展中的功能
發(fā)布時(shí)間:2021-07-10 18:28
背景與目的:胃癌是十分常見的消化系統(tǒng)惡性腫瘤之一。在我國胃癌發(fā)病率和死亡率都較高,而且由于其缺乏早期的特異性臨床表現(xiàn),不易察覺,導(dǎo)致通常診斷出的胃癌都已進(jìn)入中晚期,發(fā)生了浸潤和轉(zhuǎn)移。目前,治療胃癌主要是通過手術(shù)、化療、放療的方法,但是整體效果并不理想,轉(zhuǎn)移率和術(shù)后復(fù)發(fā)率都很高,5年生存率低至20%~30%。胃癌的發(fā)病機(jī)理是眾多基因長期突變積累,導(dǎo)致一系列基因表達(dá)及信號通路調(diào)節(jié)發(fā)生異常。所以,研究有關(guān)的基因在胃癌發(fā)生、發(fā)展過程中的作用及其調(diào)節(jié)仍然是胃癌發(fā)病機(jī)制基礎(chǔ)理論研究的重要環(huán)節(jié),這類研究對胃癌未來的診療及治療方面新技術(shù)的開發(fā)有重要意義。ARHGEF28(Rho guanine nucleotide exchange factor 28),又稱為:Rgnef、p190RHOGEF、RIP2,是一種蛋白編碼基因,位于人類染色體5q13.2,315836bp,共含有44個(gè)外顯子和45個(gè)內(nèi)含子。由于基因的不同剪切方式,一共有十四種轉(zhuǎn)錄變異體,其中最長的一個(gè)轉(zhuǎn)綠變異體mRNA共6351bp,ORF(開放閱讀框)長5196bp,含有36個(gè)外顯子。Rgnef基因是Rho鳥苷酸交換因子(RhoGEF...
【文章來源】:陜西師范大學(xué)陜西省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:96 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖1-2?Rgnef結(jié)構(gòu)域圖[79]??Fig.?1-2?The?Rgnef?constructs?with?the?different?domains1791??
圖1-5CRISPR結(jié)構(gòu)圖[155】??Fig.?1-5?The?structure?of?CR1SPR[155]???CRISPR/Cas9系統(tǒng)的作用機(jī)芾丨J??CR丨SPR/Cas系統(tǒng)的作用過程共包括三個(gè)階:第一步是得到新的spacer,候首先是尋找到PAM結(jié)構(gòu),將噬菌體DNA或者外源質(zhì)粒中含有PAM的為Protospcer,經(jīng)過核酸切割形成新的Spacer,進(jìn)入到CRISPR序列的5’方步是CR1SPR基因座在菌體內(nèi)的大量進(jìn)行復(fù)制及轉(zhuǎn)錄,再對產(chǎn)物進(jìn)行切割tracrRNA和crRNA,兩者會結(jié)合在一起,然后再與Cas結(jié)合;第三PR/Cas,在crRNA的作用下,找到靶位點(diǎn),Cas發(fā)揮剪刀的功能,使得斷裂,破壞外來遺傳物質(zhì)1155,|56]。??CRISPR/Cas9中,成熟的tracrRNA和crRNA有部分區(qū)域是互補(bǔ)的,所以穩(wěn)定的雙鏈RNA,與Cas9的特定結(jié)構(gòu)域結(jié)合,形成核糖蛋白復(fù)合物。crR用就是特異性的尋找靶基因,在結(jié)構(gòu)上與之完全貼合,解開DNA雙NA則作為支架結(jié)構(gòu),呈游離狀態(tài),這時(shí),它們攜帶的Cas9蛋白開始發(fā)的作用,其中RuvC切割與crRNA序列一致的DNA,HNH切割對應(yīng)的
sctlucncc?CJ5??圖1-5CRISPR結(jié)構(gòu)圖[155】??Fig.?1-5?The?structure?of?CR1SPR[155]??1.3.2?CRISPR/Cas9系統(tǒng)的作用機(jī)芾丨J??CR丨SPR/Cas系統(tǒng)的作用過程共包括三個(gè)階:第一步是得到新的spacer,在這??個(gè)時(shí)候首先是尋找到PAM結(jié)構(gòu),將噬菌體DNA或者外源質(zhì)粒中含有PAM的序列??確定為Protospcer,經(jīng)過核酸切割形成新的Spacer,進(jìn)入到CRISPR序列的5’方向;??第二步是CR1SPR基因座在菌體內(nèi)的大量進(jìn)行復(fù)制及轉(zhuǎn)錄,再對產(chǎn)物進(jìn)行切割后,??產(chǎn)生tracrRNA和crRNA,兩者會結(jié)合在一起,然后再與Cas結(jié)合;第三步是??CRISPR/Cas,在crRNA的作用下,找到靶位點(diǎn),Cas發(fā)揮剪刀的功能,使得外來??基因斷裂,破壞外來遺傳物質(zhì)1155,|56]。??CRISPR/Cas9中
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]Development of genome engineering technologies in cattle: from random to specific[J]. Soo-Young Yum,Ki-Young Youn,Woo-Jae Choi,Goo Jang. Journal of Animal Science and Biotechnology. 2018(02)
[2]CRISPR/Cas9在絲狀真菌基因組編輯中的應(yīng)用[J]. 李紅花,劉鋼. 遺傳. 2017(05)
[3]Current and emerging therapies in unresectable and recurrent gastric cancer[J]. Erin Jou,Lakshmi Rajdev. World Journal of Gastroenterology. 2016(20)
[4]Advanced gastric cancer:Current treatment landscape and future perspectives[J]. Antonia Digklia,Anna Dorothea Wagner. World Journal of Gastroenterology. 2016(08)
[5]Rho小G蛋白相關(guān)激酶的結(jié)構(gòu)與功能[J]. 閆慧娟,勿呢爾,莫日根,范麗菲. 中國細(xì)胞生物學(xué)學(xué)報(bào). 2014(07)
本文編號:3276439
【文章來源】:陜西師范大學(xué)陜西省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:96 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖1-2?Rgnef結(jié)構(gòu)域圖[79]??Fig.?1-2?The?Rgnef?constructs?with?the?different?domains1791??
圖1-5CRISPR結(jié)構(gòu)圖[155】??Fig.?1-5?The?structure?of?CR1SPR[155]???CRISPR/Cas9系統(tǒng)的作用機(jī)芾丨J??CR丨SPR/Cas系統(tǒng)的作用過程共包括三個(gè)階:第一步是得到新的spacer,候首先是尋找到PAM結(jié)構(gòu),將噬菌體DNA或者外源質(zhì)粒中含有PAM的為Protospcer,經(jīng)過核酸切割形成新的Spacer,進(jìn)入到CRISPR序列的5’方步是CR1SPR基因座在菌體內(nèi)的大量進(jìn)行復(fù)制及轉(zhuǎn)錄,再對產(chǎn)物進(jìn)行切割tracrRNA和crRNA,兩者會結(jié)合在一起,然后再與Cas結(jié)合;第三PR/Cas,在crRNA的作用下,找到靶位點(diǎn),Cas發(fā)揮剪刀的功能,使得斷裂,破壞外來遺傳物質(zhì)1155,|56]。??CRISPR/Cas9中,成熟的tracrRNA和crRNA有部分區(qū)域是互補(bǔ)的,所以穩(wěn)定的雙鏈RNA,與Cas9的特定結(jié)構(gòu)域結(jié)合,形成核糖蛋白復(fù)合物。crR用就是特異性的尋找靶基因,在結(jié)構(gòu)上與之完全貼合,解開DNA雙NA則作為支架結(jié)構(gòu),呈游離狀態(tài),這時(shí),它們攜帶的Cas9蛋白開始發(fā)的作用,其中RuvC切割與crRNA序列一致的DNA,HNH切割對應(yīng)的
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【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]Development of genome engineering technologies in cattle: from random to specific[J]. Soo-Young Yum,Ki-Young Youn,Woo-Jae Choi,Goo Jang. Journal of Animal Science and Biotechnology. 2018(02)
[2]CRISPR/Cas9在絲狀真菌基因組編輯中的應(yīng)用[J]. 李紅花,劉鋼. 遺傳. 2017(05)
[3]Current and emerging therapies in unresectable and recurrent gastric cancer[J]. Erin Jou,Lakshmi Rajdev. World Journal of Gastroenterology. 2016(20)
[4]Advanced gastric cancer:Current treatment landscape and future perspectives[J]. Antonia Digklia,Anna Dorothea Wagner. World Journal of Gastroenterology. 2016(08)
[5]Rho小G蛋白相關(guān)激酶的結(jié)構(gòu)與功能[J]. 閆慧娟,勿呢爾,莫日根,范麗菲. 中國細(xì)胞生物學(xué)學(xué)報(bào). 2014(07)
本文編號:3276439
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