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miRNA 452-5p及miRNA215-5p在結(jié)直腸癌組織中表達(dá)及意義

發(fā)布時(shí)間:2021-07-03 01:51
  [目的](1)利用基因高通量Miseq測(cè)序技術(shù)對(duì)比分析結(jié)直腸癌組織與癌旁正常腸粘膜組織中miRNA的差異表達(dá)。(2)應(yīng)用實(shí)時(shí)熒光定量PCR(Quantitative Real time PCR RT-qPCR)技術(shù)驗(yàn)證 miRNA452-5p 和 miRNA215-5p 在結(jié)直腸癌組織與癌旁正常腸粘膜組織中表達(dá),并通過(guò)分析其與臨床病理資料之間的關(guān)系,為進(jìn)一步研究miRNA 452-5p和miRNA215-5p在結(jié)直腸癌中生物學(xué)功能及其調(diào)控下游靶基因機(jī)制奠定基礎(chǔ)。(3)繪制 ROC 曲線(Receiver operating characteristic,ROC)和曲線下面積(Area under the ROC curve,AUC)評(píng)估 miRNA452-5p、miRNA215-5p及2-miRNA panel的診斷價(jià)值,期望探索出潛在的結(jié)直腸癌診斷價(jià)值的分子標(biāo)志物和治療靶點(diǎn)。[方法](1)收集3例結(jié)直腸癌組織及配對(duì)癌旁正常腸粘膜組織送至上?党缮镉邢薰具M(jìn)行基因高通量Miseq測(cè)序篩選差異表達(dá)miRNA。(2)收集2017年7月至2017年10月在昆明醫(yī)科大學(xué)第一附屬醫(yī)院消化內(nèi)鏡中... 

【文章來(lái)源】:昆明醫(yī)科大學(xué)云南省

【文章頁(yè)數(shù)】:48 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

miRNA 452-5p及miRNA215-5p在結(jié)直腸癌組織中表達(dá)及意義


高通量Miseq測(cè)序?qū)嶒?yàn)流程

結(jié)直腸癌,靶基因,差異表達(dá),綠色


1.2結(jié)直腸癌組織差異表達(dá)的miRNA??結(jié)直腸癌組織與癌旁正常腸粘膜組織差異表達(dá)miRNA中40種miRNA表達(dá)上調(diào),??48種miRNA表達(dá)下調(diào)(表1,圖3)。??1.3?miRNA在染色體上的分布差異結(jié)果見(jiàn)圖4??1.4?miRNA對(duì)其耙基因的調(diào)節(jié)??采用Mirdbv5和Targetscan7.1兩種耙基因預(yù)測(cè)軟件預(yù)測(cè)結(jié)直腸癌組織與癌??旁正常腸粘膜組織間差異表達(dá)miRNA的靶基因。測(cè)出上調(diào)miRNAS靶基因共412,??下調(diào)miRNAS靶基因372,其中上調(diào)miR-375耙基因2個(gè),miR215-5p靶基因9??個(gè),miRl-3p靶基因115個(gè),miR99a-5p靶基因12個(gè),miR218-5p靶基因149??個(gè),miR100-5p靶基因12個(gè),miR195-5p靶基因113個(gè);下調(diào)miR7-5p耙基因??20?個(gè),miR335-3p?靶基因?28?個(gè),miR135b-5p?靶基因?104?個(gè),miR-1246?靶基因??20?個(gè),miR223-3p?耙基因?38?個(gè),miR-7974?耙基因?86?個(gè),miR452-5p?耙基因?26??個(gè)(表2-3)。??1.5差異表達(dá)miRNA的GO生物過(guò)程和KEGG通路??結(jié)直腸癌組織與癌旁正常腸粘膜組織間差異表達(dá)miRNA的GO分析結(jié)果表明,??在這些變化的miRNA中

靶基因,分布差異,染色體,綠色


結(jié)直腸癌組織與癌旁正常腸粘膜組織差異表達(dá)miRNA中40種miRNA表達(dá)上調(diào),??48種miRNA表達(dá)下調(diào)(表1,圖3)。??1.3?miRNA在染色體上的分布差異結(jié)果見(jiàn)圖4??1.4?miRNA對(duì)其耙基因的調(diào)節(jié)??采用Mirdbv5和Targetscan7.1兩種耙基因預(yù)測(cè)軟件預(yù)測(cè)結(jié)直腸癌組織與癌??旁正常腸粘膜組織間差異表達(dá)miRNA的靶基因。測(cè)出上調(diào)miRNAS靶基因共412,??下調(diào)miRNAS靶基因372,其中上調(diào)miR-375耙基因2個(gè),miR215-5p靶基因9??個(gè),miRl-3p靶基因115個(gè),miR99a-5p靶基因12個(gè),miR218-5p靶基因149??個(gè),miR100-5p靶基因12個(gè),miR195-5p靶基因113個(gè);下調(diào)miR7-5p耙基因??20?個(gè),miR335-3p?靶基因?28?個(gè),miR135b-5p?靶基因?104?個(gè),miR-1246?靶基因??20?個(gè),miR223-3p?耙基因?38?個(gè),miR-7974?耙基因?86?個(gè),miR452-5p?耙基因?26??個(gè)(表2-3)。??1.5差異表達(dá)miRNA的GO生物過(guò)程和KEGG通路??結(jié)直腸癌組織與癌旁正常腸粘膜組織間差異表達(dá)miRNA的GO分析結(jié)果表明,??在這些變化的miRNA中

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]microRNA-200c靶向抑制轉(zhuǎn)錄因子激活蛋白2α表達(dá)增強(qiáng)結(jié)腸癌細(xì)胞增殖能力的體外研究[J]. 樊麗君,李美寧,王爽,孫建文,牛萬(wàn)通,程牛亮.  腫瘤研究與臨床. 2015 (04)
[2]Early stage colon cancer[J]. Hugh James Freeman.  World Journal of Gastroenterology. 2013(46)
[3]結(jié)直腸癌病因與發(fā)病機(jī)制最新研究進(jìn)展[J]. 張濤濤,閻巖.  科協(xié)論壇(下半月). 2009(07)

博士論文
[1]血清microRNA作為生物標(biāo)記物在結(jié)直腸腺癌早期診斷中的應(yīng)用[D]. 鄭桂喜.山東大學(xué) 2014
[2]microRNA在結(jié)腸癌上皮間質(zhì)轉(zhuǎn)化中的作用與機(jī)制研究[D]. 張志勇.第四軍醫(yī)大學(xué) 2012



本文編號(hào):3261619

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