miRNA 452-5p及miRNA215-5p在結直腸癌組織中表達及意義
發(fā)布時間:2021-07-03 01:51
[目的](1)利用基因高通量Miseq測序技術對比分析結直腸癌組織與癌旁正常腸粘膜組織中miRNA的差異表達。(2)應用實時熒光定量PCR(Quantitative Real time PCR RT-qPCR)技術驗證 miRNA452-5p 和 miRNA215-5p 在結直腸癌組織與癌旁正常腸粘膜組織中表達,并通過分析其與臨床病理資料之間的關系,為進一步研究miRNA 452-5p和miRNA215-5p在結直腸癌中生物學功能及其調控下游靶基因機制奠定基礎。(3)繪制 ROC 曲線(Receiver operating characteristic,ROC)和曲線下面積(Area under the ROC curve,AUC)評估 miRNA452-5p、miRNA215-5p及2-miRNA panel的診斷價值,期望探索出潛在的結直腸癌診斷價值的分子標志物和治療靶點。[方法](1)收集3例結直腸癌組織及配對癌旁正常腸粘膜組織送至上?党缮镉邢薰具M行基因高通量Miseq測序篩選差異表達miRNA。(2)收集2017年7月至2017年10月在昆明醫(yī)科大學第一附屬醫(yī)院消化內鏡中...
【文章來源】:昆明醫(yī)科大學云南省
【文章頁數(shù)】:48 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
高通量Miseq測序實驗流程
1.2結直腸癌組織差異表達的miRNA??結直腸癌組織與癌旁正常腸粘膜組織差異表達miRNA中40種miRNA表達上調,??48種miRNA表達下調(表1,圖3)。??1.3?miRNA在染色體上的分布差異結果見圖4??1.4?miRNA對其耙基因的調節(jié)??采用Mirdbv5和Targetscan7.1兩種耙基因預測軟件預測結直腸癌組織與癌??旁正常腸粘膜組織間差異表達miRNA的靶基因。測出上調miRNAS靶基因共412,??下調miRNAS靶基因372,其中上調miR-375耙基因2個,miR215-5p靶基因9??個,miRl-3p靶基因115個,miR99a-5p靶基因12個,miR218-5p靶基因149??個,miR100-5p靶基因12個,miR195-5p靶基因113個;下調miR7-5p耙基因??20?個,miR335-3p?靶基因?28?個,miR135b-5p?靶基因?104?個,miR-1246?靶基因??20?個,miR223-3p?耙基因?38?個,miR-7974?耙基因?86?個,miR452-5p?耙基因?26??個(表2-3)。??1.5差異表達miRNA的GO生物過程和KEGG通路??結直腸癌組織與癌旁正常腸粘膜組織間差異表達miRNA的GO分析結果表明,??在這些變化的miRNA中
結直腸癌組織與癌旁正常腸粘膜組織差異表達miRNA中40種miRNA表達上調,??48種miRNA表達下調(表1,圖3)。??1.3?miRNA在染色體上的分布差異結果見圖4??1.4?miRNA對其耙基因的調節(jié)??采用Mirdbv5和Targetscan7.1兩種耙基因預測軟件預測結直腸癌組織與癌??旁正常腸粘膜組織間差異表達miRNA的靶基因。測出上調miRNAS靶基因共412,??下調miRNAS靶基因372,其中上調miR-375耙基因2個,miR215-5p靶基因9??個,miRl-3p靶基因115個,miR99a-5p靶基因12個,miR218-5p靶基因149??個,miR100-5p靶基因12個,miR195-5p靶基因113個;下調miR7-5p耙基因??20?個,miR335-3p?靶基因?28?個,miR135b-5p?靶基因?104?個,miR-1246?靶基因??20?個,miR223-3p?耙基因?38?個,miR-7974?耙基因?86?個,miR452-5p?耙基因?26??個(表2-3)。??1.5差異表達miRNA的GO生物過程和KEGG通路??結直腸癌組織與癌旁正常腸粘膜組織間差異表達miRNA的GO分析結果表明,??在這些變化的miRNA中
【參考文獻】:
期刊論文
[1]microRNA-200c靶向抑制轉錄因子激活蛋白2α表達增強結腸癌細胞增殖能力的體外研究[J]. 樊麗君,李美寧,王爽,孫建文,牛萬通,程牛亮. 腫瘤研究與臨床. 2015 (04)
[2]Early stage colon cancer[J]. Hugh James Freeman. World Journal of Gastroenterology. 2013(46)
[3]結直腸癌病因與發(fā)病機制最新研究進展[J]. 張濤濤,閻巖. 科協(xié)論壇(下半月). 2009(07)
博士論文
[1]血清microRNA作為生物標記物在結直腸腺癌早期診斷中的應用[D]. 鄭桂喜.山東大學 2014
[2]microRNA在結腸癌上皮間質轉化中的作用與機制研究[D]. 張志勇.第四軍醫(yī)大學 2012
本文編號:3261619
【文章來源】:昆明醫(yī)科大學云南省
【文章頁數(shù)】:48 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
高通量Miseq測序實驗流程
1.2結直腸癌組織差異表達的miRNA??結直腸癌組織與癌旁正常腸粘膜組織差異表達miRNA中40種miRNA表達上調,??48種miRNA表達下調(表1,圖3)。??1.3?miRNA在染色體上的分布差異結果見圖4??1.4?miRNA對其耙基因的調節(jié)??采用Mirdbv5和Targetscan7.1兩種耙基因預測軟件預測結直腸癌組織與癌??旁正常腸粘膜組織間差異表達miRNA的靶基因。測出上調miRNAS靶基因共412,??下調miRNAS靶基因372,其中上調miR-375耙基因2個,miR215-5p靶基因9??個,miRl-3p靶基因115個,miR99a-5p靶基因12個,miR218-5p靶基因149??個,miR100-5p靶基因12個,miR195-5p靶基因113個;下調miR7-5p耙基因??20?個,miR335-3p?靶基因?28?個,miR135b-5p?靶基因?104?個,miR-1246?靶基因??20?個,miR223-3p?耙基因?38?個,miR-7974?耙基因?86?個,miR452-5p?耙基因?26??個(表2-3)。??1.5差異表達miRNA的GO生物過程和KEGG通路??結直腸癌組織與癌旁正常腸粘膜組織間差異表達miRNA的GO分析結果表明,??在這些變化的miRNA中
結直腸癌組織與癌旁正常腸粘膜組織差異表達miRNA中40種miRNA表達上調,??48種miRNA表達下調(表1,圖3)。??1.3?miRNA在染色體上的分布差異結果見圖4??1.4?miRNA對其耙基因的調節(jié)??采用Mirdbv5和Targetscan7.1兩種耙基因預測軟件預測結直腸癌組織與癌??旁正常腸粘膜組織間差異表達miRNA的靶基因。測出上調miRNAS靶基因共412,??下調miRNAS靶基因372,其中上調miR-375耙基因2個,miR215-5p靶基因9??個,miRl-3p靶基因115個,miR99a-5p靶基因12個,miR218-5p靶基因149??個,miR100-5p靶基因12個,miR195-5p靶基因113個;下調miR7-5p耙基因??20?個,miR335-3p?靶基因?28?個,miR135b-5p?靶基因?104?個,miR-1246?靶基因??20?個,miR223-3p?耙基因?38?個,miR-7974?耙基因?86?個,miR452-5p?耙基因?26??個(表2-3)。??1.5差異表達miRNA的GO生物過程和KEGG通路??結直腸癌組織與癌旁正常腸粘膜組織間差異表達miRNA的GO分析結果表明,??在這些變化的miRNA中
【參考文獻】:
期刊論文
[1]microRNA-200c靶向抑制轉錄因子激活蛋白2α表達增強結腸癌細胞增殖能力的體外研究[J]. 樊麗君,李美寧,王爽,孫建文,牛萬通,程牛亮. 腫瘤研究與臨床. 2015 (04)
[2]Early stage colon cancer[J]. Hugh James Freeman. World Journal of Gastroenterology. 2013(46)
[3]結直腸癌病因與發(fā)病機制最新研究進展[J]. 張濤濤,閻巖. 科協(xié)論壇(下半月). 2009(07)
博士論文
[1]血清microRNA作為生物標記物在結直腸腺癌早期診斷中的應用[D]. 鄭桂喜.山東大學 2014
[2]microRNA在結腸癌上皮間質轉化中的作用與機制研究[D]. 張志勇.第四軍醫(yī)大學 2012
本文編號:3261619
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