發(fā)布時(shí)間：2021-05-28 08:37

　　目的:采用孟德爾隨機(jī)化方法,選擇代表維生素D（Vitamin D,VD）水平/缺乏的遺傳變異構(gòu)建遺傳風(fēng)險(xiǎn)評(píng)分（Genetic risk score,GRS）,以此作為工具變量,進(jìn)行VD水平/缺乏與原發(fā)性肝癌（簡(jiǎn)稱“肝癌”）發(fā)生的因果關(guān)系分析。方法:1、采用1:1頻數(shù)匹配的病例對(duì)照研究方法。病例組為南方醫(yī)科大學(xué)順德醫(yī)院收治的30～79歲新發(fā)肝癌病例,共1068例;1068例健康對(duì)照以及構(gòu)建工具變量的2000例健康個(gè)體均來自于順德健康篩查人群。2、采用酶聯(lián)免疫法檢測(cè)血清25（OH）D濃度。選擇GWAS報(bào)道且在亞洲人群中經(jīng)驗(yàn)證以及課題組前期驗(yàn)證的共9個(gè)VD關(guān)聯(lián)變異作為目標(biāo)遺傳變異（rs12785878、rs1790349、rs4588、rs7041、rs1155563、rs10741657、rs12794714、rs6013897和rs2209314）,應(yīng)用TaqMan熒光定量PCR技術(shù)進(jìn)行基因分型。3、按照血清25（OH）D<50nmol/L判斷為VD缺乏的標(biāo)準(zhǔn),將VD水平進(jìn)行分類（VD缺乏/不缺乏）。為排除季節(jié)因素（日照時(shí)數(shù)）影響VD水平所致的混雜偏倚,僅納入采樣時(shí)間相近（1～5月... 

【文章來源】：廣東藥科大學(xué)廣東省

【文章頁數(shù)】：100 頁

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
abstract
第一章 前言
    1.1 肝癌的流行現(xiàn)狀
    1.2 VD抗肝癌的生物學(xué)機(jī)制研究現(xiàn)狀
    1.3 VD水平/缺乏與肝癌發(fā)生流行病學(xué)研究現(xiàn)狀
    1.4 觀察法研究易受混雜和反向因果偏倚影響
    1.5 孟德爾隨機(jī)化以遺傳變異作為工具變量,能呈現(xiàn)暴露與疾病間的真實(shí)關(guān)系
    1.6 敏感性分析考察孟德爾隨機(jī)化研究結(jié)果的穩(wěn)健性
    1.7 VD水平關(guān)聯(lián)遺傳變異已驗(yàn)證,為VD與肝癌的孟德爾隨機(jī)化研究提供契機(jī)
課題思路(技術(shù)路線)
第二章 材料與方法
    2.1 確定研究對(duì)象和統(tǒng)計(jì)效能估計(jì)
        2.1.1 確定研究對(duì)象
        2.1.2 統(tǒng)計(jì)效能估計(jì)
    2.2 資料收集和生物樣本采集
        2.2.1 流行病學(xué)調(diào)查和臨床數(shù)據(jù)收集
        2.2.2 血樣標(biāo)本采集和處理
    2.3 選擇遺傳變異
    2.4 實(shí)驗(yàn)室試劑、設(shè)備和耗材
        2.4.1 主要試劑
        2.4.2 專用設(shè)備
        2.4.3 主要耗材
    2.5 實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)
        2.5.1 檢測(cè)血清25(OH)D濃度
        2.5.2 檢測(cè)血清乙肝五項(xiàng)
        2.5.3 提取血液DNA
        2.5.4 檢測(cè)遺傳變異
    2.6 質(zhì)量控制
        2.6.1 收集資料的質(zhì)量控制
        2.6.2 實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)的質(zhì)量控制
    2.7 統(tǒng)計(jì)分析
        2.7.1 研究對(duì)象的特征
        2.7.2 VD水平/缺乏與肝癌發(fā)生風(fēng)險(xiǎn)的關(guān)聯(lián)分析(傳統(tǒng)的觀察法分析)
        2.7.3 驗(yàn)證VD水平/缺乏關(guān)聯(lián)的遺傳變異
        2.7.4 計(jì)算VD水平/缺乏的遺傳風(fēng)險(xiǎn)評(píng)分(構(gòu)建工具變量)
        2.7.5 驗(yàn)證工具變量(遺傳風(fēng)險(xiǎn)評(píng)分,GRS)的穩(wěn)健性
        2.7.6 VD水平/缺乏與肝癌發(fā)生風(fēng)險(xiǎn)的孟德爾隨機(jī)化分析
        2.7.7 多效性檢驗(yàn)
        2.7.8 敏感性分析
第三章 結(jié)果
    3.1 研究對(duì)象的特征
    3.2 VD水平/缺乏與肝癌發(fā)生風(fēng)險(xiǎn)的關(guān)聯(lián)分析
    3.3 健康個(gè)體中驗(yàn)證VD水平/缺乏的遺傳變異
        3.3.1 哈迪溫伯格平衡檢驗(yàn)和連鎖不平衡檢驗(yàn)
        3.3.2 健康個(gè)體中驗(yàn)證VD水平的遺傳變異
        3.3.3 健康個(gè)體中驗(yàn)證VD缺乏的遺傳變異
    3.4 構(gòu)建工具變量(遺傳風(fēng)險(xiǎn)評(píng)分,GRS)
        3.4.1 VD水平的遺傳風(fēng)險(xiǎn)評(píng)分與VD水平的關(guān)聯(lián)分析
        3.4.2 VD缺乏的遺傳風(fēng)險(xiǎn)評(píng)分與VD缺乏的關(guān)聯(lián)分析
        3.4.3 弱工具變量檢驗(yàn)和效能檢驗(yàn)
    3.5 VD水平與肝癌發(fā)生風(fēng)險(xiǎn)的孟德爾隨機(jī)化分析
    3.6 VD缺乏與肝癌發(fā)生風(fēng)險(xiǎn)的孟德爾隨機(jī)化分析
    3.7 檢驗(yàn)工具變量的多效性
        3.7.1 VD水平/缺乏關(guān)聯(lián)遺傳變異與混雜因素的關(guān)聯(lián)分析
        3.7.2 VD水平/缺乏的遺傳風(fēng)險(xiǎn)評(píng)分與混雜因素的關(guān)聯(lián)分析
    3.8 敏感性分析
        3.8.1 新遺傳風(fēng)險(xiǎn)評(píng)分與肝癌因果關(guān)聯(lián)的敏感性分析
        3.8.2 遺傳風(fēng)險(xiǎn)評(píng)分與肝癌因果關(guān)聯(lián)在觀察組二的敏感性分析
第四章 討論
    4.1 傳統(tǒng)的觀察性分析:VD水平/缺乏與肝癌發(fā)生的病例對(duì)照研究
    4.2 孟德爾隨機(jī)化分析:VD水平/缺乏與肝癌發(fā)生的因果推斷
    4.3 驗(yàn)證孟德爾隨機(jī)化研究的前提條件、敏感性分析確保研究結(jié)果的穩(wěn)定性
第五章 創(chuàng)新與不足
    5.1 創(chuàng)新
    5.2 不足
第六章 結(jié)論與展望
    6.1 結(jié)論
    6.2 展望
參考文獻(xiàn)
綜述
    參考文獻(xiàn)
致謝
攻讀碩士學(xué)位期間發(fā)表的論文


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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碩士論文
[1]順德區(qū)30歲以上人群血清VD水平及不同遺傳特征人群VD營養(yǎng)狀況[D]. 周新鳳.廣東藥科大學(xué) 2019



本文編號(hào)：3207932