蛋白質(zhì)組學(xué)微量樣本制備新技術(shù)及在肝癌研究中的應(yīng)用
發(fā)布時(shí)間:2021-05-17 11:41
和質(zhì)譜技術(shù)、樣本分離技術(shù)的快速發(fā)展相比,針對(duì)微量樣本的制備技術(shù)顯得比較滯后。樣本處理的一般步驟包括提取蛋白質(zhì)、蛋白質(zhì)變性、蛋白質(zhì)還原反應(yīng)、蛋白質(zhì)烷基化反應(yīng)、蛋白質(zhì)酶切以及這些過程中樣品的洗滌、轉(zhuǎn)移、熱干等。復(fù)雜的樣本制備流程需要較高的蛋白質(zhì)起始量。與之類似的,針對(duì)翻譯后修飾,如糖基化、磷酸化等的蛋白質(zhì)組學(xué)研究,則需要更多的起始蛋白量。而在越來越多的應(yīng)用場景中,能夠獲得的蛋白量非常有限,例如通過流式細(xì)胞術(shù)、超速離心等分選獲得的細(xì)胞、亞細(xì)胞樣本,臨床上針對(duì)腫瘤檢測的穿刺樣本、病理切片組織、小體積的體液樣本等,如果單純依靠現(xiàn)在的技術(shù)手段只能得到較低質(zhì)量的數(shù)據(jù)。因此,本論文研究將致力于發(fā)展適用于微量蛋白質(zhì)組學(xué)樣本處理的裝置和技術(shù)流程,并用于微量細(xì)胞、尿液樣本的蛋白質(zhì)組學(xué)及糖組學(xué)分析。微血管侵犯(MVI)指的是腫瘤細(xì)胞向小血管的侵襲,它與肝細(xì)胞癌預(yù)后好壞密切相關(guān)。目前MVI的確認(rèn)僅能從手術(shù)后標(biāo)本中診斷,術(shù)前很難判斷。因此,本研究的第二個(gè)內(nèi)容,是嘗試將微量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)和肝細(xì)胞癌癌組織蛋白質(zhì)組、尿蛋白質(zhì)組研究結(jié)合,探索發(fā)現(xiàn)可提示MVI存在與否的潛在尿蛋白標(biāo)志分子。本論文分為三個(gè)章節(jié)第一章:首先簡述...
【文章來源】:廣東藥科大學(xué)廣東省
【文章頁數(shù)】:89 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
abstract
第一章 引言
1.1 基于生物質(zhì)譜的蛋白質(zhì)組學(xué)概述
1.2 微量樣本制備技術(shù)研究進(jìn)展
1.3 肝細(xì)胞癌的微血管侵犯概述
1.4 研究內(nèi)容和意義
第二章 蛋白質(zhì)組學(xué)微量樣本制備方案的建立
2.1 實(shí)驗(yàn)部分
2.1.1 儀器與試劑
2.1.2 實(shí)驗(yàn)方法
2.1.3 質(zhì)譜分析
2.1.4 數(shù)據(jù)處理
2.2 結(jié)果與討論
2.2.1 Micro-SPAT方案應(yīng)用于HepG2細(xì)胞全蛋白消化
2.2.2 Micro-SPAT酶切方案與溶液酶切方案對(duì)比
2.2.3 Micro-SPAT方案應(yīng)用于N-糖鏈的制備
2.3 本章小結(jié)
第三章 Micro-SPAT應(yīng)用于肝細(xì)胞癌尿液樣本的蛋白質(zhì)組學(xué)分析
3.1 實(shí)驗(yàn)部分
3.1.1 儀器與試劑
3.1.2 技術(shù)路線
3.1.3 尿蛋白建庫
3.1.4 DIA樣品采集以及數(shù)據(jù)分析
3.2 結(jié)果討論
3.2.1 S-Ⅰ型和S-Ⅲ型肝細(xì)胞癌患者癌組織樣本的蛋白質(zhì)組學(xué)分析
3.2.2 S-Ⅲ型中的MVI+和MVI-患者的蛋白質(zhì)組學(xué)分析
3.2.3 健康人尿液樣本重復(fù)檢測的穩(wěn)定性評(píng)估
3.2.4 肝細(xì)胞癌患者尿液樣本MVI相關(guān)蛋白質(zhì)組學(xué)數(shù)據(jù)分析
3.3 本章小結(jié)
第四章 結(jié)論與展望
4.1 結(jié)論
4.2 展望
參考文獻(xiàn)
附錄
致謝
攻讀碩士學(xué)位期間發(fā)表的論文
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]MR功能成像對(duì)肝細(xì)胞癌微血管侵犯的評(píng)估價(jià)值[J]. 王莉莉,李俊峰,竇郁,郭順林,雷軍強(qiáng). 臨床肝膽病雜志. 2018(12)
[2]CT和MRI在肝細(xì)胞癌微血管浸潤中的診斷價(jià)值[J]. 胡納,楊國慶,付泉水. 中國臨床醫(yī)學(xué)影像雜志. 2018(08)
[3]擴(kuò)散峰度成像評(píng)價(jià)肝細(xì)胞癌微血管浸潤[J]. W.T.Wang,L.Yang,Z.X.Yang,X.X.Hu,Y.Ding,X.Yan,劉春明. 國際醫(yī)學(xué)放射學(xué)雜志. 2018(02)
本文編號(hào):3191701
【文章來源】:廣東藥科大學(xué)廣東省
【文章頁數(shù)】:89 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
abstract
第一章 引言
1.1 基于生物質(zhì)譜的蛋白質(zhì)組學(xué)概述
1.2 微量樣本制備技術(shù)研究進(jìn)展
1.3 肝細(xì)胞癌的微血管侵犯概述
1.4 研究內(nèi)容和意義
第二章 蛋白質(zhì)組學(xué)微量樣本制備方案的建立
2.1 實(shí)驗(yàn)部分
2.1.1 儀器與試劑
2.1.2 實(shí)驗(yàn)方法
2.1.3 質(zhì)譜分析
2.1.4 數(shù)據(jù)處理
2.2 結(jié)果與討論
2.2.1 Micro-SPAT方案應(yīng)用于HepG2細(xì)胞全蛋白消化
2.2.2 Micro-SPAT酶切方案與溶液酶切方案對(duì)比
2.2.3 Micro-SPAT方案應(yīng)用于N-糖鏈的制備
2.3 本章小結(jié)
第三章 Micro-SPAT應(yīng)用于肝細(xì)胞癌尿液樣本的蛋白質(zhì)組學(xué)分析
3.1 實(shí)驗(yàn)部分
3.1.1 儀器與試劑
3.1.2 技術(shù)路線
3.1.3 尿蛋白建庫
3.1.4 DIA樣品采集以及數(shù)據(jù)分析
3.2 結(jié)果討論
3.2.1 S-Ⅰ型和S-Ⅲ型肝細(xì)胞癌患者癌組織樣本的蛋白質(zhì)組學(xué)分析
3.2.2 S-Ⅲ型中的MVI+和MVI-患者的蛋白質(zhì)組學(xué)分析
3.2.3 健康人尿液樣本重復(fù)檢測的穩(wěn)定性評(píng)估
3.2.4 肝細(xì)胞癌患者尿液樣本MVI相關(guān)蛋白質(zhì)組學(xué)數(shù)據(jù)分析
3.3 本章小結(jié)
第四章 結(jié)論與展望
4.1 結(jié)論
4.2 展望
參考文獻(xiàn)
附錄
致謝
攻讀碩士學(xué)位期間發(fā)表的論文
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]MR功能成像對(duì)肝細(xì)胞癌微血管侵犯的評(píng)估價(jià)值[J]. 王莉莉,李俊峰,竇郁,郭順林,雷軍強(qiáng). 臨床肝膽病雜志. 2018(12)
[2]CT和MRI在肝細(xì)胞癌微血管浸潤中的診斷價(jià)值[J]. 胡納,楊國慶,付泉水. 中國臨床醫(yī)學(xué)影像雜志. 2018(08)
[3]擴(kuò)散峰度成像評(píng)價(jià)肝細(xì)胞癌微血管浸潤[J]. W.T.Wang,L.Yang,Z.X.Yang,X.X.Hu,Y.Ding,X.Yan,劉春明. 國際醫(yī)學(xué)放射學(xué)雜志. 2018(02)
本文編號(hào):3191701
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