口腔鱗狀細胞癌（oral20squamous20cell20carcinoma,OSCC）是全球十大最常見的癌癥之一,全球每年新增病例大約300,000,而五年生存率大約50%�？谇话┦且粋�廣義的術語,包括了頰部、舌部、舌基底部、牙齦、口底、硬腭等部位的惡性腫瘤,其中約95%的口腔惡性腫瘤是鱗狀細胞癌�？谇击[狀細胞癌的分子機制尚未完全探明。因此,探索口腔鱗癌進展過程中的關鍵分子,闡明其在口腔鱗癌進展中的作用,并為診斷口腔鱗癌尋找一些個性化的分子標志物是十分必要的。同時,這些標志物可以幫助口腔鱗癌患者尋找治療分子靶標,進行預后判斷和個性化定制治療方案。目前隨著高通量測序技術的發(fā)展,相較傳統(tǒng)技術成本更低、更快速且更靈敏。因此,伴隨著高通量測序數(shù)據(jù)的發(fā)展,促進了測序數(shù)據(jù)分析方法的發(fā)展,也為進一步探索生命科學的基因表達調控關系提供了基礎。本研究的目的是通過一系列生物信息學分析探索口腔鱗狀細胞癌與基因表達的關系,篩選出差異表達的RNA,構建ceRNA網(wǎng)絡以及探索潛在的生物學標志物。首先我們從TCGA數(shù)據(jù)庫中下載口腔鱗癌患者的RNA-seq,miRNA-seq和臨床數(shù)據(jù)并進行標準化、注釋以及整合。... 

【文章來源】：南方醫(yī)科大學廣東省

【文章頁數(shù)】：83 頁

【學位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
ABSTRACT
前言
第一章 有關數(shù)據(jù)庫和分析工具的介紹
    1.1 TCGA數(shù)據(jù)庫
    1.2 R語言
    1.3 DAVID
    1.4 Cytoscape可視化工具
    1.5 ceRNA數(shù)據(jù)庫
第二章 TCGA數(shù)據(jù)庫中口腔鱗狀細胞癌的生物學分析
    2.1 研究目的和意義
    2.2 材料和方法
    2.3 結果
    2.4 討論
全文總結
參考文獻
附錄
    病例一
    病例二
    病例三
    病例四
    病例五
中英文對照縮略詞
致謝



本文編號：3176665