口腔鱗狀細(xì)胞癌（oral20squamous20cell20carcinoma,OSCC）是全球十大最常見(jiàn)的癌癥之一,全球每年新增病例大約300,000,而五年生存率大約50%�？谇话┦且粋�(gè)廣義的術(shù)語(yǔ),包括了頰部、舌部、舌基底部、牙齦、口底、硬腭等部位的惡性腫瘤,其中約95%的口腔惡性腫瘤是鱗狀細(xì)胞癌�？谇击[狀細(xì)胞癌的分子機(jī)制尚未完全探明。因此,探索口腔鱗癌進(jìn)展過(guò)程中的關(guān)鍵分子,闡明其在口腔鱗癌進(jìn)展中的作用,并為診斷口腔鱗癌尋找一些個(gè)性化的分子標(biāo)志物是十分必要的。同時(shí),這些標(biāo)志物可以幫助口腔鱗癌患者尋找治療分子靶標(biāo),進(jìn)行預(yù)后判斷和個(gè)性化定制治療方案。目前隨著高通量測(cè)序技術(shù)的發(fā)展,相較傳統(tǒng)技術(shù)成本更低、更快速且更靈敏。因此,伴隨著高通量測(cè)序數(shù)據(jù)的發(fā)展,促進(jìn)了測(cè)序數(shù)據(jù)分析方法的發(fā)展,也為進(jìn)一步探索生命科學(xué)的基因表達(dá)調(diào)控關(guān)系提供了基礎(chǔ)。本研究的目的是通過(guò)一系列生物信息學(xué)分析探索口腔鱗狀細(xì)胞癌與基因表達(dá)的關(guān)系,篩選出差異表達(dá)的RNA,構(gòu)建ceRNA網(wǎng)絡(luò)以及探索潛在的生物學(xué)標(biāo)志物。首先我們從TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)中下載口腔鱗癌患者的RNA-seq,miRNA-seq和臨床數(shù)據(jù)并進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化、注釋以及整合。... 

【文章來(lái)源】：南方醫(yī)科大學(xué)廣東省

【文章頁(yè)數(shù)】：83 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
ABSTRACT
前言
第一章 有關(guān)數(shù)據(jù)庫(kù)和分析工具的介紹
    1.1 TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)
    1.2 R語(yǔ)言
    1.3 DAVID
    1.4 Cytoscape可視化工具
    1.5 ceRNA數(shù)據(jù)庫(kù)
第二章 TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)中口腔鱗狀細(xì)胞癌的生物學(xué)分析
    2.1 研究目的和意義
    2.2 材料和方法
    2.3 結(jié)果
    2.4 討論
全文總結(jié)
參考文獻(xiàn)
附錄
    病例一
    病例二
    病例三
    病例四
    病例五
中英文對(duì)照縮略詞
致謝



本文編號(hào)：3176665