目的:近年來,Pdliml/2/7基因已經(jīng)被報道在實體腫瘤的發(fā)生、發(fā)展中起著重要作用,是一種癌基因。然而其在惡性血液系統(tǒng)疾病尤其是急性髓系白血�。╝cute myeloidleukemia,AML）中的作用還有待研究。本研究擬探索AML中Pdliml/2/7基因的表達(dá)、甲基化水平及其對患者預(yù)后的影響,以期為AML患者的預(yù)后分層、療效觀察及病情監(jiān)控提供有效生物標(biāo)志。方法:收集AML患者和健康對照骨髓標(biāo)本,進行RNA、DNA提取,并將RNA逆轉(zhuǎn)錄成cDNA、DNA進行亞硫酸氫鹽修飾。應(yīng)用實時定量熒光PCR（real-time quantitative PCR,RQ-PCR）檢測 AML 患者中 Pdlim1/2/7 基因表達(dá),并利用 SPSS 20.0軟件對數(shù)據(jù)進行處理。通過應(yīng)用蛋白印跡法（Westernblot）檢測白血病細(xì)胞株中Pdlim1蛋白表達(dá)。應(yīng)用實時定量甲基化特異性PCR（real-time quantitative methylation-specific PCR,RQ-MSP）分析 AML 患者中 Pdlim1 啟動子區(qū)甲基化水平。結(jié)果:1.在GEO數(shù)據(jù)集GSE24006和... 

【文章來源】：江蘇大學(xué)江蘇省

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【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

GSE24006及GSE63270中AML和NBM差異表達(dá)的熱圖和火山圖

江蘇大學(xué)碩士學(xué)位論文25圖4.2aGSE24006數(shù)據(jù)集中Pdlim1在AML患者和對照組中的表達(dá)；bGSE63270數(shù)據(jù)集中Pdlim1在AML患者和對照組中的表達(dá)；cGSE63270中Pdlim2在AML患者和對照組中的表達(dá)；dGSE24006中Pdlim7在AML患者和對照組中的表達(dá)。Figure4.2a.ExpressionlevelofPdlim1inAMLpatientsandcontrolsofpublisheddatasetGSE24006；b.ExpressionlevelofPdlim1inAMLpatientsandcontrolsofpublisheddatasetGSE63270；c.ExpressionlevelofPdlim2inAMLpatientsandcontrolsofpublisheddatasetGSE63270；d.ExpressionlevelofPdlim7inAMLpatientsandcontrolsofpublisheddatasetGSE24006.4.2.2Pdlim1表達(dá)在HSC分化過程中呈現(xiàn)動態(tài)變化同時我們對Pdlim1表達(dá)在造血干細(xì)胞（hematopoieticstemcell，HSC）向外周血成熟細(xì)胞分化過程中的變化情況進行研究。我們選取兩組正常造血細(xì)胞的表GSE24006p<0.001GSE63270p<0.001圖4.2aPdlim1圖4.2bPdlim1圖4.2dPdlim7圖4.2cPdlim2GSE63270p<0.001GSE24006p<0.001

Pdlim1/2/7表達(dá)在急性髓系白血病中的臨床意義26達(dá)譜數(shù)據(jù)集GSE42519和GSE13159進行分析來研究HSC髓系分化過程中Pdlim1基因的表達(dá)情況。如圖4.3結(jié)果顯示Pdlim1表達(dá)在AML中與成熟外周血細(xì)胞相比明顯上調(diào)，且該基因在HSC中表達(dá)最高，隨著血細(xì)胞分化成熟其表達(dá)逐漸下調(diào)，由此我們猜測，Pdlim1基因參與HSC向成熟外周血細(xì)胞增殖分化過程，且隨著HSC分化成熟呈現(xiàn)出規(guī)律性動態(tài)變化。以上結(jié)果說明Pdlim1基因與早期造血調(diào)控和造血干細(xì)胞分化密切相關(guān)。圖4.3Pdlim1基因隨著造血細(xì)胞分化過程中的其表達(dá)產(chǎn)生變化（公共數(shù)據(jù)集GSE42519和GSE13159）Figure4.3TheexpressionpatternofPdlim1duringdifferentiationofthemajorhematopoieticlineages（publisheddatasetGSE42519andGSE13159）4.2.3PCR、Westernblot檢測Pdlim1在白血病細(xì)胞株中表達(dá)水平首先用PCR檢測Pdlim1基因在白血病細(xì)胞株中轉(zhuǎn)錄水平，如圖4.4，Pdlim1mRNA在白血病細(xì)胞株U937、SHI-1、THP1、K562、HEL、HL60、SKM1和HEP2高表達(dá)。接著用Westernblot檢測了白血病細(xì)胞株THP1和HL60中Pdlim1的蛋白表達(dá)量，實驗結(jié)果顯示，THP1細(xì)胞株和HL60細(xì)胞株中Pdlim1蛋白水平也較高，結(jié)果見圖4.5。12345678910


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