USP29去泛素化并穩(wěn)定Snail蛋白及Ajuba輔轉(zhuǎn)錄激活PPARγ和ERα轉(zhuǎn)錄活性的機(jī)制
發(fā)布時(shí)間:2021-04-02 00:24
胃癌細(xì)胞的轉(zhuǎn)移是胃癌高死亡率的最重要原因。Snail蛋白是促進(jìn)癌細(xì)胞上皮-間質(zhì)轉(zhuǎn)化(EMT)、遷移和轉(zhuǎn)移的關(guān)鍵轉(zhuǎn)錄因子。Snail蛋白穩(wěn)定性的調(diào)節(jié)是決定Snail蛋白表達(dá)水平的關(guān)鍵。許多泛素連接酶E3介導(dǎo)了Snail蛋白的泛素化-蛋白酶體降解,但是Snail的去泛素化酶(DUB)卻鮮有報(bào)道。通過對(duì)DUB家族的成員大量篩查,我們發(fā)現(xiàn)多種DUB可以增強(qiáng)Snail的蛋白水平,包括:USP13、USP28、USP29、USP37、OTUD6A和DUB3,其中USP29對(duì)Snail蛋白的影響在不同細(xì)胞系中最顯著。進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn)Snail和USP29存在直接相互作用。在細(xì)胞核內(nèi),USP29直接去泛素化Snail蛋白抑制Snail蛋白的降解。另外,我們還發(fā)現(xiàn)USP29直接結(jié)合Snail的磷酸酶SCP蛋白,并且促進(jìn)Snail與SCP蛋白的結(jié)合,這為USP29穩(wěn)定Snail蛋白提供了另外的重要機(jī)制。在多種胃癌細(xì)胞中過表達(dá)USP29可以促進(jìn)細(xì)胞EMT、細(xì)胞遷移和增強(qiáng)化療抵抗,而敲低USP29抑制細(xì)胞的遷移能力。通過查詢網(wǎng)上的公共數(shù)據(jù)庫,我們發(fā)現(xiàn)在胃癌病人中,USP29、Snail以及SCP的表達(dá)量都與生存...
【文章來源】:上海交通大學(xué)上海市 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:139 頁
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【部分圖文】:
EMT是多種細(xì)胞內(nèi)外信號(hào)控制的過程
介導(dǎo) Snail 與多種輔轉(zhuǎn)錄抑制復(fù)合物的結(jié)合,進(jìn)而介導(dǎo) Snail 的轉(zhuǎn)錄抑制活性。作為轉(zhuǎn)錄抑制因子,Snail 蛋白可以招募 Sin3A/HDACs、Ajuba/PRMT5PRC1/2、G9a/DNMT 等輔轉(zhuǎn)錄抑制復(fù)合物,直接抑制上皮細(xì)胞 marker 如E-cadherin 的表達(dá)[17-21]。FOXA 是一類增強(qiáng)子結(jié)合蛋白,在上皮細(xì)胞中,F(xiàn)OXA蛋白結(jié)合到 E-cadherin 等基因的增強(qiáng)子上,激活 E-cadherin 等上皮基因的表達(dá)。EMT 過程需要染色質(zhì)結(jié)構(gòu)和基因表達(dá)譜的劇烈變化,作為 EMT 關(guān)鍵的起始因子Snail 通過轉(zhuǎn)錄抑制 FOXA 蛋白家族的表達(dá),關(guān)閉上皮基因的表達(dá)[22]。盡管早期大量的研究都指向 Snail 在 EMT 過程中主要起轉(zhuǎn)錄抑制的功能,但是近些年來 mRNA-seq、ChIP-seq 的結(jié)果表明 Snail 在轉(zhuǎn)錄激活中同樣具有重要作用[23]如 Snail 可以與 NF-kB 協(xié)同性的激活 Fibronectin 的表達(dá)[24];另外 Snail 可以招募組蛋白乙; CBP/P300 并被其乙;揎棧M(jìn)而激活 TNF 等一系列炎癥因子的表達(dá)[25];Snail 也可以直接激活 MMP9 和 PAPSS2 的表達(dá),促進(jìn)細(xì)胞遷移[26]。關(guān)于 Snail 如何激活基因轉(zhuǎn)錄的機(jī)制仍然有待進(jìn)一步研究(圖 1-2)。
圖 1-3:Snail 蛋白結(jié)構(gòu)與修飾Fig1-3: Snail protein structure and modification圖 1-3:Snail 蛋白結(jié)構(gòu)與修飾。Snail 蛋白 C-端由 4 個(gè)串聯(lián)鋅指結(jié)構(gòu)組成 DNA 結(jié)合結(jié)構(gòu)域;N 端含有 SNAG 區(qū)域和核輸出信號(hào)(Nuclear export signal,NES)。S11 可被 PKD1 磷酸化,磷酸化的 S11 招募 FBXO11,Snail 被泛素化降解。第 90-120 位氨基酸為絲氨酸富含區(qū)域(Ser-rich domain,SRD),其中含有 GSK3 磷酸化的兩個(gè)位點(diǎn):2S 和 4S,4S 磷酸化介導(dǎo)Snail 蛋白出核,2S 的磷酸化為 -TRCP 的結(jié)合提供位點(diǎn),兩位點(diǎn)的磷酸化可被 SCP1/2/3 磷酸酶水解。S100 和 S104 可分別被 ATM 和 CK1 磷酸化。S112 位點(diǎn)可以發(fā)生乙酰葡萄糖胺修飾。K98 與 K137 是 Snail 的主要多泛素化修飾位點(diǎn),該位點(diǎn)還可被 LOXL2/3 氧化修飾,阻止多泛素化修飾。K146 與 K187 是組蛋白乙; CBP/P300 的主要修飾位點(diǎn)。K206/234/235可被 A20 進(jìn)行單泛素化修飾。T203 和 S246 可分別被 LATS2 和 PAK1 磷酸化修飾,K234 可發(fā)生 SUMO 化修飾。Fig1-3: Snail protein structure and modification. The C-terminal of Snail protein consists of 4
本文編號(hào):3114236
【文章來源】:上海交通大學(xué)上海市 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:139 頁
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【部分圖文】:
EMT是多種細(xì)胞內(nèi)外信號(hào)控制的過程
介導(dǎo) Snail 與多種輔轉(zhuǎn)錄抑制復(fù)合物的結(jié)合,進(jìn)而介導(dǎo) Snail 的轉(zhuǎn)錄抑制活性。作為轉(zhuǎn)錄抑制因子,Snail 蛋白可以招募 Sin3A/HDACs、Ajuba/PRMT5PRC1/2、G9a/DNMT 等輔轉(zhuǎn)錄抑制復(fù)合物,直接抑制上皮細(xì)胞 marker 如E-cadherin 的表達(dá)[17-21]。FOXA 是一類增強(qiáng)子結(jié)合蛋白,在上皮細(xì)胞中,F(xiàn)OXA蛋白結(jié)合到 E-cadherin 等基因的增強(qiáng)子上,激活 E-cadherin 等上皮基因的表達(dá)。EMT 過程需要染色質(zhì)結(jié)構(gòu)和基因表達(dá)譜的劇烈變化,作為 EMT 關(guān)鍵的起始因子Snail 通過轉(zhuǎn)錄抑制 FOXA 蛋白家族的表達(dá),關(guān)閉上皮基因的表達(dá)[22]。盡管早期大量的研究都指向 Snail 在 EMT 過程中主要起轉(zhuǎn)錄抑制的功能,但是近些年來 mRNA-seq、ChIP-seq 的結(jié)果表明 Snail 在轉(zhuǎn)錄激活中同樣具有重要作用[23]如 Snail 可以與 NF-kB 協(xié)同性的激活 Fibronectin 的表達(dá)[24];另外 Snail 可以招募組蛋白乙; CBP/P300 并被其乙;揎棧M(jìn)而激活 TNF 等一系列炎癥因子的表達(dá)[25];Snail 也可以直接激活 MMP9 和 PAPSS2 的表達(dá),促進(jìn)細(xì)胞遷移[26]。關(guān)于 Snail 如何激活基因轉(zhuǎn)錄的機(jī)制仍然有待進(jìn)一步研究(圖 1-2)。
圖 1-3:Snail 蛋白結(jié)構(gòu)與修飾Fig1-3: Snail protein structure and modification圖 1-3:Snail 蛋白結(jié)構(gòu)與修飾。Snail 蛋白 C-端由 4 個(gè)串聯(lián)鋅指結(jié)構(gòu)組成 DNA 結(jié)合結(jié)構(gòu)域;N 端含有 SNAG 區(qū)域和核輸出信號(hào)(Nuclear export signal,NES)。S11 可被 PKD1 磷酸化,磷酸化的 S11 招募 FBXO11,Snail 被泛素化降解。第 90-120 位氨基酸為絲氨酸富含區(qū)域(Ser-rich domain,SRD),其中含有 GSK3 磷酸化的兩個(gè)位點(diǎn):2S 和 4S,4S 磷酸化介導(dǎo)Snail 蛋白出核,2S 的磷酸化為 -TRCP 的結(jié)合提供位點(diǎn),兩位點(diǎn)的磷酸化可被 SCP1/2/3 磷酸酶水解。S100 和 S104 可分別被 ATM 和 CK1 磷酸化。S112 位點(diǎn)可以發(fā)生乙酰葡萄糖胺修飾。K98 與 K137 是 Snail 的主要多泛素化修飾位點(diǎn),該位點(diǎn)還可被 LOXL2/3 氧化修飾,阻止多泛素化修飾。K146 與 K187 是組蛋白乙; CBP/P300 的主要修飾位點(diǎn)。K206/234/235可被 A20 進(jìn)行單泛素化修飾。T203 和 S246 可分別被 LATS2 和 PAK1 磷酸化修飾,K234 可發(fā)生 SUMO 化修飾。Fig1-3: Snail protein structure and modification. The C-terminal of Snail protein consists of 4
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