APOBEC3A/B啟動(dòng)子單核苷酸多態(tài)性對(duì)膽道系統(tǒng)癌癥發(fā)生風(fēng)險(xiǎn)影響及機(jī)制的研究
發(fā)布時(shí)間：2021-03-18 14:30
研究背景和目的膽道系統(tǒng)腫瘤（Bile tract cancer BTC）,是指發(fā)生于膽道上皮的惡性腫瘤,包括膽管癌（Cholangiocarcinoma CCA）和膽囊癌（Gallbladder cancer GBC）。膽管癌約占消化系統(tǒng)腫瘤的3%,按照解剖位置不同,可進(jìn)一步分為肝內(nèi)膽管癌（Intrahepatic cholangiocarcinoma ICC）、肝門部膽管癌（Perihilar cholangiocarcinoma p CC）和遠(yuǎn)端膽管癌（Distal cholangiocarcinoma d CC）,后兩者按第三版《國(guó)際腫瘤分類》應(yīng)歸于肝外膽管癌（Extrahepatic Cholangiocarcinoma ECC）范疇[1];膽囊癌則是消化系統(tǒng)第6位常見(jiàn)腫瘤[6]。雖屬同一系統(tǒng),但上述腫瘤在致病誘因、易患人群、發(fā)生率、病死率方面均存在顯著差別:從致病誘因來(lái)看,泰國(guó)等沿海地區(qū)以寄生蟲感染（肝吸蟲）為主要誘因,而我國(guó)以膽道結(jié)石及其導(dǎo)致的慢性炎癥為主要病因,歐美國(guó)家則主要以原發(fā)性硬化性膽管炎（PSC）為主要致病危險(xiǎn)因素
【文章來(lái)源】：中國(guó)人民解放軍海軍軍醫(yī)大學(xué)上海市 211工程院校
【文章頁(yè)數(shù)】：96 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】：博士
【部分圖文】：
APOBEC3A rs12157810位點(diǎn)分析
Ensembl數(shù)據(jù)庫(kù)顯示rs2267401(-338bp,T>G)位點(diǎn)低頻基因型(G型)的檢出率為34.3%,同樣利用Hapmap和Haploview4.2軟件對(duì)APOBEC3B啟動(dòng)子區(qū)域進(jìn)行分析后,結(jié)果顯示該啟動(dòng)子包含相同的單體基因型共7個(gè),但彼此之間存在連鎖不平衡性(r2=0.95),且該位點(diǎn)最接近APOBEC3B基因編碼區(qū),因此將該位點(diǎn)納入待研究位點(diǎn)。(圖2)(3)APOBEC3B rs12628403(+4340bp,APOBEC3A,內(nèi)含子4區(qū),A>C,APOBEC3B缺失型“代理”位點(diǎn))
本研究使用熒光探針實(shí)時(shí)定量PCR技術(shù),3個(gè)目標(biāo)SNP位點(diǎn)在99%以上的樣本中成功獲得了基因分型,由Roche Lightcycle480實(shí)時(shí)定量PCR儀計(jì)算并生成樣本的分型散點(diǎn)圖,在Hardy-Weinberg遺傳平衡檢驗(yàn)中APOBEC3A rs12628403(+4340bp,APOBEC3A,內(nèi)含子4區(qū),A>C,APOBEC3B缺失型“代理”位點(diǎn))及APOBEC3B rs2267401(-338bp,APOBEC3B啟動(dòng)子區(qū)域,T>G)符合平衡定律,但樣本測(cè)得APOBEC3A rs12157810(-525bp,APOBEC3A啟動(dòng)子區(qū)域,A>C)不符合平衡定律,為探究原因排除檢驗(yàn)錯(cuò)誤,遂隨機(jī)送樣40例進(jìn)行Sanger測(cè)序,測(cè)序結(jié)果(GenBank No.MH229491-MH229530)與本中心檢驗(yàn)結(jié)果完全相符。(圖3、4、5)圖4 APOBEC3A rs12628403分型檢測(cè)結(jié)果
【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]膽管癌診斷與治療——外科專家共識(shí)[J]. Chinese Chapter of International Hepato-Pancreato-Biliary Association;Hepatic Surgery Group,Chinese Society of Surgery,Chinese Medical Association;. 臨床肝膽病雜志. 2015(01)
[2]Salmonella typhi and gallbladder cancer:report from an endemic region[J]. Mallika Tewari,Raghvendra R Mishra,Hari S Shukla. Hepatobiliary & Pancreatic Diseases International. 2010(05)
[3]原發(fā)性膽囊癌的流行病學(xué)研究[J]. 石景森. 肝膽胰外科雜志. 2003(01)
本文編號(hào)：3088481
【文章來(lái)源】：中國(guó)人民解放軍海軍軍醫(yī)大學(xué)上海市 211工程院校
【文章頁(yè)數(shù)】：96 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】：博士
【部分圖文】：
APOBEC3A rs12157810位點(diǎn)分析
Ensembl數(shù)據(jù)庫(kù)顯示rs2267401(-338bp,T>G)位點(diǎn)低頻基因型(G型)的檢出率為34.3%,同樣利用Hapmap和Haploview4.2軟件對(duì)APOBEC3B啟動(dòng)子區(qū)域進(jìn)行分析后,結(jié)果顯示該啟動(dòng)子包含相同的單體基因型共7個(gè),但彼此之間存在連鎖不平衡性(r2=0.95),且該位點(diǎn)最接近APOBEC3B基因編碼區(qū),因此將該位點(diǎn)納入待研究位點(diǎn)。(圖2)(3)APOBEC3B rs12628403(+4340bp,APOBEC3A,內(nèi)含子4區(qū),A>C,APOBEC3B缺失型“代理”位點(diǎn))
本研究使用熒光探針實(shí)時(shí)定量PCR技術(shù),3個(gè)目標(biāo)SNP位點(diǎn)在99%以上的樣本中成功獲得了基因分型,由Roche Lightcycle480實(shí)時(shí)定量PCR儀計(jì)算并生成樣本的分型散點(diǎn)圖,在Hardy-Weinberg遺傳平衡檢驗(yàn)中APOBEC3A rs12628403(+4340bp,APOBEC3A,內(nèi)含子4區(qū),A>C,APOBEC3B缺失型“代理”位點(diǎn))及APOBEC3B rs2267401(-338bp,APOBEC3B啟動(dòng)子區(qū)域,T>G)符合平衡定律,但樣本測(cè)得APOBEC3A rs12157810(-525bp,APOBEC3A啟動(dòng)子區(qū)域,A>C)不符合平衡定律,為探究原因排除檢驗(yàn)錯(cuò)誤,遂隨機(jī)送樣40例進(jìn)行Sanger測(cè)序,測(cè)序結(jié)果(GenBank No.MH229491-MH229530)與本中心檢驗(yàn)結(jié)果完全相符。(圖3、4、5)圖4 APOBEC3A rs12628403分型檢測(cè)結(jié)果
【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]膽管癌診斷與治療——外科專家共識(shí)[J]. Chinese Chapter of International Hepato-Pancreato-Biliary Association;Hepatic Surgery Group,Chinese Society of Surgery,Chinese Medical Association;. 臨床肝膽病雜志. 2015(01)
[2]Salmonella typhi and gallbladder cancer:report from an endemic region[J]. Mallika Tewari,Raghvendra R Mishra,Hari S Shukla. Hepatobiliary & Pancreatic Diseases International. 2010(05)
[3]原發(fā)性膽囊癌的流行病學(xué)研究[J]. 石景森. 肝膽胰外科雜志. 2003(01)
本文編號(hào)：3088481
本文鏈接：http://sikaile.net/yixuelunwen/zlx/3088481.html
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