1株致放化療患者口腔感染霍亂弧菌的鑒定和病原特征分析
發(fā)布時(shí)間:2021-03-13 02:16
目的對(duì)1例食管癌術(shù)后放化療患者口腔感染的霍亂弧菌進(jìn)行菌株鑒定和病原特征分析。方法取患者口腔分泌物進(jìn)行分離培養(yǎng)并觀察細(xì)菌形態(tài)特征,用基質(zhì)輔助激光解吸電離飛行時(shí)間質(zhì)譜(MALDI-TOF MS)進(jìn)行蛋白質(zhì)水平鑒定,并進(jìn)行血清群檢測(cè);用K-B紙片擴(kuò)散法進(jìn)行藥敏試驗(yàn);提取細(xì)菌基因組DNA構(gòu)建文庫(kù)并進(jìn)行細(xì)菌基因組重測(cè)序,通過核糖體多位點(diǎn)序列分型(r MLST)、平均核苷酸相似度(ANI)分析和非冗余蛋白質(zhì)庫(kù)(NR)比對(duì),對(duì)菌株進(jìn)行分子生物學(xué)鑒定,并進(jìn)一步對(duì)其MLST分子分型和毒力基因進(jìn)行分析。結(jié)果 MALDI-TOF MS鑒定分值為2.151,r MLST分析顯示該菌株與霍亂弧菌吻合度為100%,ANI分析顯示ANIb值為96.05%,ANIm值為96.56%,NR數(shù)據(jù)庫(kù)基因注釋得到霍亂弧菌相關(guān)的基因2 981個(gè),血清群檢測(cè)為非O1/O139群霍亂弧菌。藥敏試驗(yàn)結(jié)果顯示該菌對(duì)哌拉西林/他唑巴坦、氨曲南、頭孢哌酮/舒巴坦、頭孢他啶、頭孢吡肟、慶大霉素、阿米卡星、左氧氟沙星、環(huán)丙沙星、亞胺培南、美羅培南均敏感。MLST顯示該菌株為新的ST型(ST-986),且攜帶tox R、hly A、nan H、...
【文章來源】:臨床檢驗(yàn)雜志. 2020,38(11)
【文章頁(yè)數(shù)】:6 頁(yè)
【部分圖文】:
細(xì)菌培養(yǎng)和革蘭染色形態(tài)特征
細(xì)菌全基因組重測(cè)序分析
霍亂弧菌分離株的最小生成樹分析
本文編號(hào):3079399
【文章來源】:臨床檢驗(yàn)雜志. 2020,38(11)
【文章頁(yè)數(shù)】:6 頁(yè)
【部分圖文】:
細(xì)菌培養(yǎng)和革蘭染色形態(tài)特征
細(xì)菌全基因組重測(cè)序分析
霍亂弧菌分離株的最小生成樹分析
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