脂肪酸合成酶作為癌癥治療靶點(diǎn)的生物信息學(xué)分析
發(fā)布時(shí)間:2021-02-16 08:58
目的基于生物信息學(xué)探究脂肪酸合成酶(FASN)在癌癥中的作用,為將FASN作為腫瘤診斷生物標(biāo)志物和防控靶點(diǎn)提供線索。方法從癌癥基因組圖譜TCGA數(shù)據(jù)庫中獲取10 967份樣本資料,采用cBioPortal和GEPIA腫瘤基因分析工具,探究FASN基因在癌癥病人中的序列變化和表達(dá)情況,并進(jìn)一步分析FASN在腫瘤組織和正常組織間的表達(dá)差異;從GEO數(shù)據(jù)庫獲取非酒精性脂肪性肝。∟AFLD)病人的樣本數(shù)據(jù),分析FASN在NAFLD誘發(fā)肝細(xì)胞癌疾病進(jìn)程中的作用;采用String數(shù)據(jù)庫檢索FASN相關(guān)蛋白并進(jìn)行富集功能注釋。結(jié)果 FASN基因在10 967份癌組織樣本中的改變率為4.60%,在肝細(xì)胞癌、膀胱癌等多種實(shí)體瘤中表達(dá)上升;FASN在NAFLD組和對(duì)照組的表達(dá)值為9.78±0.74和8.99±1.21(P<0.05),在重度脂肪變性和輕度脂肪變性患者的表達(dá)值為791.89±420.59和562.85±432.87(P<0.05);FASN相關(guān)蛋白的生物學(xué)功能主要為介導(dǎo)蛋白間結(jié)合、調(diào)節(jié)催化酶活性以及調(diào)控能量代謝。結(jié)論 FASN與多種癌癥的發(fā)生發(fā)展密切相關(guān),靶向抑制FASN有希望...
【文章來源】:現(xiàn)代預(yù)防醫(yī)學(xué). 2020,47(03)北大核心
【文章頁數(shù)】:7 頁
【部分圖文】:
FASN基因在不同癌癥中的變化
在cBioPortal中進(jìn)一步分析FASN mRNA在32種不同腫瘤組織中的表達(dá)情況,我們發(fā)現(xiàn)FASN在乳腺癌、前列腺癌、肝細(xì)胞癌和肺癌等多種腫瘤組織中呈現(xiàn)高表達(dá)(圖2)。為了探究FASN在癌組織與正常組織之間的表達(dá)差異,我們利用GEPIA工具分析TCGA數(shù)據(jù)庫中癌癥病人與匹配病例樣本中FASN的表達(dá),經(jīng)過對(duì)數(shù)轉(zhuǎn)化,得到表達(dá)差異分布圖(圖3)。結(jié)果顯示,FASN在肝細(xì)胞癌、膀胱癌、結(jié)腸癌和胰腺癌等多種實(shí)體瘤中表達(dá)上升(圖3),提示FASN異常表達(dá)增高與上述腫瘤的發(fā)生相關(guān)。圖3 FASN在不同癌組織與正常組織的表達(dá)差異
FASN在不同癌組織與正常組織的表達(dá)差異
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]脂肪酸合成酶在腫瘤細(xì)胞中的作用[J]. 羅一成,王繼辰. 腫瘤代謝與營養(yǎng)電子雜志. 2018(04)
[2]非酒精性脂肪性肝病防治指南(2018更新版)[J]. National Workshop on Fatty Liver and Alcoholic Liver Disease,Chinese Society of Hepatology,Chinese Medical Association;Fatty Liver Expert Committee,Chinese Medical Doctor Association;. 現(xiàn)代醫(yī)藥衛(wèi)生. 2018(05)
本文編號(hào):3036536
【文章來源】:現(xiàn)代預(yù)防醫(yī)學(xué). 2020,47(03)北大核心
【文章頁數(shù)】:7 頁
【部分圖文】:
FASN基因在不同癌癥中的變化
在cBioPortal中進(jìn)一步分析FASN mRNA在32種不同腫瘤組織中的表達(dá)情況,我們發(fā)現(xiàn)FASN在乳腺癌、前列腺癌、肝細(xì)胞癌和肺癌等多種腫瘤組織中呈現(xiàn)高表達(dá)(圖2)。為了探究FASN在癌組織與正常組織之間的表達(dá)差異,我們利用GEPIA工具分析TCGA數(shù)據(jù)庫中癌癥病人與匹配病例樣本中FASN的表達(dá),經(jīng)過對(duì)數(shù)轉(zhuǎn)化,得到表達(dá)差異分布圖(圖3)。結(jié)果顯示,FASN在肝細(xì)胞癌、膀胱癌、結(jié)腸癌和胰腺癌等多種實(shí)體瘤中表達(dá)上升(圖3),提示FASN異常表達(dá)增高與上述腫瘤的發(fā)生相關(guān)。圖3 FASN在不同癌組織與正常組織的表達(dá)差異
FASN在不同癌組織與正常組織的表達(dá)差異
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]脂肪酸合成酶在腫瘤細(xì)胞中的作用[J]. 羅一成,王繼辰. 腫瘤代謝與營養(yǎng)電子雜志. 2018(04)
[2]非酒精性脂肪性肝病防治指南(2018更新版)[J]. National Workshop on Fatty Liver and Alcoholic Liver Disease,Chinese Society of Hepatology,Chinese Medical Association;Fatty Liver Expert Committee,Chinese Medical Doctor Association;. 現(xiàn)代醫(yī)藥衛(wèi)生. 2018(05)
本文編號(hào):3036536
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