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脂肪酸合成酶作為癌癥治療靶點的生物信息學分析

發(fā)布時間:2021-02-16 08:58
  目的基于生物信息學探究脂肪酸合成酶(FASN)在癌癥中的作用,為將FASN作為腫瘤診斷生物標志物和防控靶點提供線索。方法從癌癥基因組圖譜TCGA數(shù)據(jù)庫中獲取10 967份樣本資料,采用cBioPortal和GEPIA腫瘤基因分析工具,探究FASN基因在癌癥病人中的序列變化和表達情況,并進一步分析FASN在腫瘤組織和正常組織間的表達差異;從GEO數(shù)據(jù)庫獲取非酒精性脂肪性肝。∟AFLD)病人的樣本數(shù)據(jù),分析FASN在NAFLD誘發(fā)肝細胞癌疾病進程中的作用;采用String數(shù)據(jù)庫檢索FASN相關蛋白并進行富集功能注釋。結果 FASN基因在10 967份癌組織樣本中的改變率為4.60%,在肝細胞癌、膀胱癌等多種實體瘤中表達上升;FASN在NAFLD組和對照組的表達值為9.78±0.74和8.99±1.21(P<0.05),在重度脂肪變性和輕度脂肪變性患者的表達值為791.89±420.59和562.85±432.87(P<0.05);FASN相關蛋白的生物學功能主要為介導蛋白間結合、調節(jié)催化酶活性以及調控能量代謝。結論 FASN與多種癌癥的發(fā)生發(fā)展密切相關,靶向抑制FASN有希望... 

【文章來源】:現(xiàn)代預防醫(yī)學. 2020,47(03)北大核心

【文章頁數(shù)】:7 頁

【部分圖文】:

脂肪酸合成酶作為癌癥治療靶點的生物信息學分析


FASN基因在不同癌癥中的變化

分布圖,癌癥,腫瘤


在cBioPortal中進一步分析FASN mRNA在32種不同腫瘤組織中的表達情況,我們發(fā)現(xiàn)FASN在乳腺癌、前列腺癌、肝細胞癌和肺癌等多種腫瘤組織中呈現(xiàn)高表達(圖2)。為了探究FASN在癌組織與正常組織之間的表達差異,我們利用GEPIA工具分析TCGA數(shù)據(jù)庫中癌癥病人與匹配病例樣本中FASN的表達,經過對數(shù)轉化,得到表達差異分布圖(圖3)。結果顯示,FASN在肝細胞癌、膀胱癌、結腸癌和胰腺癌等多種實體瘤中表達上升(圖3),提示FASN異常表達增高與上述腫瘤的發(fā)生相關。圖3 FASN在不同癌組織與正常組織的表達差異

癌癥,肝癌


FASN在不同癌組織與正常組織的表達差異

【參考文獻】:
期刊論文
[1]脂肪酸合成酶在腫瘤細胞中的作用[J]. 羅一成,王繼辰.  腫瘤代謝與營養(yǎng)電子雜志. 2018(04)
[2]非酒精性脂肪性肝病防治指南(2018更新版)[J]. National Workshop on Fatty Liver and Alcoholic Liver Disease,Chinese Society of Hepatology,Chinese Medical Association;Fatty Liver Expert Committee,Chinese Medical Doctor Association;.  現(xiàn)代醫(yī)藥衛(wèi)生. 2018(05)



本文編號:3036536

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