全外顯子組測(cè)序鑒定甲狀腺癌全新抑癌lncRNA GAS8-AS1及其抑癌分子機(jī)制研究
發(fā)布時(shí)間:2021-01-30 14:22
癌癥的形成原因十分復(fù)雜,與環(huán)境因素和遺傳因素都緊密相關(guān),因此對(duì)癌癥體細(xì)胞突變及機(jī)制研究十分必要。本研究分為兩部分:第一部分是用全外顯子測(cè)序技術(shù)分析乳頭狀甲狀腺癌的體細(xì)胞突變譜,研究發(fā)現(xiàn)了中國(guó)人群中高頻突變基因長(zhǎng)鏈非編碼RNA(lncRNA)GAS8-AS1;第二部分是探究GAS8-AS1的抑癌分子機(jī)制,以及對(duì)肝細(xì)胞癌發(fā)生發(fā)展的影響。甲狀腺癌是最近幾年發(fā)病率增長(zhǎng)最快、最常見(jiàn)的內(nèi)分泌系統(tǒng)惡性腫瘤。但是,中國(guó)人群的甲狀腺癌體細(xì)胞突變譜圖尚不清楚。全外顯子組測(cè)序信息能夠提供癌癥基因組的全景式突變信息。因此,本研究在402例中國(guó)乳頭狀甲狀腺患者的腫瘤及正常組織標(biāo)本中鑒定體細(xì)胞突變情況,其中實(shí)驗(yàn)組91例患者組織進(jìn)行全外顯子組測(cè)序;驗(yàn)證組的311例患者組織用Sanger測(cè)序進(jìn)行驗(yàn)證。我們繪制了中國(guó)人群的甲狀腺癌體細(xì)胞突變譜,以及突變基因圖譜,并且發(fā)現(xiàn)了三個(gè)中國(guó)人特異性基因突變特征,與在白人的甲狀腺癌突變特征有顯著不同。研究發(fā)現(xiàn)了 23個(gè)含有≥3個(gè)體細(xì)胞突變位點(diǎn)的相關(guān)基因,其中BRAF V600E基因突變位點(diǎn)是甲狀腺癌的突變熱點(diǎn),在59%的患者中都發(fā)現(xiàn)了 BRAF突變,并且在存在腫瘤細(xì)胞淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移患者...
【文章來(lái)源】:北京化工大學(xué)北京市 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:128 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【部分圖文】:
癌癥的特點(diǎn)及治療分子靶標(biāo)I21Figl-1TherapeuticTargetingoftheHallmarksofCancer
圖1-2?lllumina公司的Hiseq?2000二代測(cè)序原理圖??Fig?1-2?Schematic?Diagram?of?Hiseq2000?sequencing?from?Illumina??圖引自:TUCF?Genomics?(http://tucf-genomics.tufts.edU/home/faq#Q01)??2014年,詹啟敏院士的科研團(tuán)隊(duì)首次用全外顯子組測(cè)序分析了中國(guó)人群中食管鱗??
北京化工大學(xué)博士學(xué)位論文??據(jù)報(bào)道,新型棒狀超分子納米聚合物CPG是由可降解聚天冬氨酸(PAsp)衍生??枝纖維素納米晶體(CNCs)和富含羥基的聚陽(yáng)離子(PGEA)通過(guò)典型CB[8]為??的遞送有抑癌效應(yīng)的多條ncRNAs治療肝細(xì)胞癌。CNC是一種天然多糖納米具有良好的生物相容性和獨(dú)特的物理化學(xué)性質(zhì)屬性。具有豐富羥基的PGEA是一??希望的基因載體具有低細(xì)胞毒性。PAsp可以使分解和可降解性受益細(xì)胞內(nèi)的納??裝。超分子納米材料CPG能夠有效復(fù)合和IncRNA?AffiGJ。在細(xì)胞實(shí)??,基因-載體復(fù)合物有較強(qiáng)的抑制細(xì)胞生長(zhǎng)的功能。構(gòu)建裸鼠荷瘤模型,用納米通過(guò)尾靜脈給藥,在多種組織器官中都發(fā)現(xiàn)了抑癌基因的表達(dá),并且有被動(dòng)靶臟的功能,小鼠移植瘤也得到了很好的抑制。由此,這樣的棒狀超分子納米裝配??供一種有光明的前景,高效的遞送多功能腫瘤抑制性載體核酸[72]。??
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]Cancer incidence and mortality in China in 2013:an analysis based on urbanization level[J]. Wanqing Chen,Rongshou Zheng,Siwei Zhang,Hongmei Zeng,Tingting Zuo,Changfa Xia,Zhixun Yang,Jie He. Chinese Journal of Cancer Research. 2017(01)
[2]Annual report on status of cancer in China, 2011[J]. Wanqing Chen,Rongshou Zheng,Hongmei Zeng,Siwei Zhang,Jie He. Chinese Journal of Cancer Research. 2015(01)
碩士論文
[1]全外顯子組測(cè)序技術(shù)對(duì)兩個(gè)眼前節(jié)發(fā)育不良家系致病基因檢測(cè)[D]. 王凱.天津醫(yī)科大學(xué) 2017
[2]基于GPU并行化計(jì)算的宏基因組第二代測(cè)序模擬系統(tǒng)[D]. 宣黎明.華東理工大學(xué) 2012
本文編號(hào):3009053
【文章來(lái)源】:北京化工大學(xué)北京市 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:128 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【部分圖文】:
癌癥的特點(diǎn)及治療分子靶標(biāo)I21Figl-1TherapeuticTargetingoftheHallmarksofCancer
圖1-2?lllumina公司的Hiseq?2000二代測(cè)序原理圖??Fig?1-2?Schematic?Diagram?of?Hiseq2000?sequencing?from?Illumina??圖引自:TUCF?Genomics?(http://tucf-genomics.tufts.edU/home/faq#Q01)??2014年,詹啟敏院士的科研團(tuán)隊(duì)首次用全外顯子組測(cè)序分析了中國(guó)人群中食管鱗??
北京化工大學(xué)博士學(xué)位論文??據(jù)報(bào)道,新型棒狀超分子納米聚合物CPG是由可降解聚天冬氨酸(PAsp)衍生??枝纖維素納米晶體(CNCs)和富含羥基的聚陽(yáng)離子(PGEA)通過(guò)典型CB[8]為??的遞送有抑癌效應(yīng)的多條ncRNAs治療肝細(xì)胞癌。CNC是一種天然多糖納米具有良好的生物相容性和獨(dú)特的物理化學(xué)性質(zhì)屬性。具有豐富羥基的PGEA是一??希望的基因載體具有低細(xì)胞毒性。PAsp可以使分解和可降解性受益細(xì)胞內(nèi)的納??裝。超分子納米材料CPG能夠有效復(fù)合和IncRNA?AffiGJ。在細(xì)胞實(shí)??,基因-載體復(fù)合物有較強(qiáng)的抑制細(xì)胞生長(zhǎng)的功能。構(gòu)建裸鼠荷瘤模型,用納米通過(guò)尾靜脈給藥,在多種組織器官中都發(fā)現(xiàn)了抑癌基因的表達(dá),并且有被動(dòng)靶臟的功能,小鼠移植瘤也得到了很好的抑制。由此,這樣的棒狀超分子納米裝配??供一種有光明的前景,高效的遞送多功能腫瘤抑制性載體核酸[72]。??
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]Cancer incidence and mortality in China in 2013:an analysis based on urbanization level[J]. Wanqing Chen,Rongshou Zheng,Siwei Zhang,Hongmei Zeng,Tingting Zuo,Changfa Xia,Zhixun Yang,Jie He. Chinese Journal of Cancer Research. 2017(01)
[2]Annual report on status of cancer in China, 2011[J]. Wanqing Chen,Rongshou Zheng,Hongmei Zeng,Siwei Zhang,Jie He. Chinese Journal of Cancer Research. 2015(01)
碩士論文
[1]全外顯子組測(cè)序技術(shù)對(duì)兩個(gè)眼前節(jié)發(fā)育不良家系致病基因檢測(cè)[D]. 王凱.天津醫(yī)科大學(xué) 2017
[2]基于GPU并行化計(jì)算的宏基因組第二代測(cè)序模擬系統(tǒng)[D]. 宣黎明.華東理工大學(xué) 2012
本文編號(hào):3009053
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