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胰腺癌循環(huán)腫瘤細(xì)胞(CTCs)的轉(zhuǎn)錄組分析

發(fā)布時(shí)間:2021-01-28 11:50
  胰腺癌是預(yù)后較差和死亡率較高的惡性腫瘤之一,其中腫瘤細(xì)胞的轉(zhuǎn)移是造成胰腺癌患者死亡的主要原因。胰腺癌中某些細(xì)胞能夠突破基底膜、滲透至血液中,并伴隨循環(huán)系統(tǒng)遷移至其他組織或器官,這些細(xì)胞被稱為循環(huán)腫瘤細(xì)胞(Circulating Tumor Cells,CTCs)。近年來的研究發(fā)現(xiàn),CTCs在患者液體活檢中具有重要的預(yù)后意義。不僅如此,越來越多的證據(jù)表明,CTCs作為腫瘤轉(zhuǎn)移的種子,在脫離原發(fā)病灶后能夠抑制失巢凋亡,在血液循環(huán)中抵抗流體剪切力和并躲避免疫監(jiān)視,其存活現(xiàn)象與內(nèi)在基因表達(dá)機(jī)制可能能夠?yàn)槟[瘤治療和轉(zhuǎn)移阻斷提供新的思路。然而,目前關(guān)于CTCs的內(nèi)在機(jī)制的研究仍不充分,其中的關(guān)鍵調(diào)控因子、不同轉(zhuǎn)錄模式、存活和免疫逃逸機(jī)制以及關(guān)鍵基因與患者生存的確切關(guān)系仍未得到深入的、系統(tǒng)的研究。為了研究胰腺癌CTCs中的關(guān)鍵基因和表達(dá)模式,我們首先下載了來自GEO數(shù)據(jù)庫(kù)的包含75個(gè)胰腺癌CTCs的共187個(gè)樣本的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),識(shí)別其中未被注釋的CTCs特異性的新lncRNA,并通過其表達(dá)調(diào)控作用及共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)的計(jì)算,尋找其中起到關(guān)鍵調(diào)控作用的lncRNA。基于包含新lncRNA的胰腺癌轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),我們... 

【文章來源】:南昌大學(xué)江西省 211工程院校

【文章頁(yè)數(shù)】:81 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

胰腺癌循環(huán)腫瘤細(xì)胞(CTCs)的轉(zhuǎn)錄組分析


本研究技術(shù)路線

轉(zhuǎn)錄本,距離計(jì)算,差異顯著性,相關(guān)系數(shù)


16圖 2.2 基于 TSS 距離計(jì)算出的鄰近的成對(duì)轉(zhuǎn)錄本、隨機(jī)成對(duì)轉(zhuǎn)錄本之間的相關(guān)系數(shù)絕對(duì)分布及各個(gè)分布兩兩之間的差異顯著性。箱圖(A)表示 10 種成對(duì)轉(zhuǎn)錄本之間的轉(zhuǎn)錄相性,下圖(B)表示上圖中兩兩箱圖的相關(guān)性分布之間的差異顯著性,通過四種顏色劃分為 p>0.05, 0.01<p<0.05, 0.001<p<0.01, p<0.001 四個(gè)差異顯著性水平

轉(zhuǎn)錄本,差異顯著性,距離計(jì)算,絕對(duì)值


2.3 基于 gene body 距離計(jì)算出的鄰近的成對(duì)轉(zhuǎn)錄本、隨機(jī)成對(duì)轉(zhuǎn)錄本之間的相關(guān)系對(duì)值分布及各個(gè)分布兩兩之間的差異顯著性。箱圖(A)表示 10 種成對(duì)轉(zhuǎn)錄本之間的相關(guān)性,下圖(B)表示上圖中兩兩箱圖相關(guān)性分布之間的差異顯著性,通過四種顏劃分為 p>0.05, 0.01<p<0.05, 0.001<p<0.01, p<0.001 四個(gè)差異顯著性水平


本文編號(hào):3004946

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