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胰腺癌循環(huán)腫瘤細胞(CTCs)的轉(zhuǎn)錄組分析

發(fā)布時間:2021-01-28 11:50
  胰腺癌是預后較差和死亡率較高的惡性腫瘤之一,其中腫瘤細胞的轉(zhuǎn)移是造成胰腺癌患者死亡的主要原因。胰腺癌中某些細胞能夠突破基底膜、滲透至血液中,并伴隨循環(huán)系統(tǒng)遷移至其他組織或器官,這些細胞被稱為循環(huán)腫瘤細胞(Circulating Tumor Cells,CTCs)。近年來的研究發(fā)現(xiàn),CTCs在患者液體活檢中具有重要的預后意義。不僅如此,越來越多的證據(jù)表明,CTCs作為腫瘤轉(zhuǎn)移的種子,在脫離原發(fā)病灶后能夠抑制失巢凋亡,在血液循環(huán)中抵抗流體剪切力和并躲避免疫監(jiān)視,其存活現(xiàn)象與內(nèi)在基因表達機制可能能夠為腫瘤治療和轉(zhuǎn)移阻斷提供新的思路。然而,目前關于CTCs的內(nèi)在機制的研究仍不充分,其中的關鍵調(diào)控因子、不同轉(zhuǎn)錄模式、存活和免疫逃逸機制以及關鍵基因與患者生存的確切關系仍未得到深入的、系統(tǒng)的研究。為了研究胰腺癌CTCs中的關鍵基因和表達模式,我們首先下載了來自GEO數(shù)據(jù)庫的包含75個胰腺癌CTCs的共187個樣本的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),識別其中未被注釋的CTCs特異性的新lncRNA,并通過其表達調(diào)控作用及共表達網(wǎng)絡的計算,尋找其中起到關鍵調(diào)控作用的lncRNA;诎耹ncRNA的胰腺癌轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),我們... 

【文章來源】:南昌大學江西省 211工程院校

【文章頁數(shù)】:81 頁

【學位級別】:碩士

【部分圖文】:

胰腺癌循環(huán)腫瘤細胞(CTCs)的轉(zhuǎn)錄組分析


本研究技術路線

轉(zhuǎn)錄本,距離計算,差異顯著性,相關系數(shù)


16圖 2.2 基于 TSS 距離計算出的鄰近的成對轉(zhuǎn)錄本、隨機成對轉(zhuǎn)錄本之間的相關系數(shù)絕對分布及各個分布兩兩之間的差異顯著性。箱圖(A)表示 10 種成對轉(zhuǎn)錄本之間的轉(zhuǎn)錄相性,下圖(B)表示上圖中兩兩箱圖的相關性分布之間的差異顯著性,通過四種顏色劃分為 p>0.05, 0.01<p<0.05, 0.001<p<0.01, p<0.001 四個差異顯著性水平

轉(zhuǎn)錄本,差異顯著性,距離計算,絕對值


2.3 基于 gene body 距離計算出的鄰近的成對轉(zhuǎn)錄本、隨機成對轉(zhuǎn)錄本之間的相關系對值分布及各個分布兩兩之間的差異顯著性。箱圖(A)表示 10 種成對轉(zhuǎn)錄本之間的相關性,下圖(B)表示上圖中兩兩箱圖相關性分布之間的差異顯著性,通過四種顏劃分為 p>0.05, 0.01<p<0.05, 0.001<p<0.01, p<0.001 四個差異顯著性水平


本文編號:3004946

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