研究背景宮頸癌是女性生殖系統(tǒng)中最常見的惡性腫瘤,嚴(yán)重危及女性健康。我國大部分患者診斷時(shí)已是局部晚期,盆腔放療是患者綜合治療過程中重要的手段。越來越多的研究表明,接受盆腔放療的婦科腫瘤患者會(huì)發(fā)生腸道菌群失調(diào)。然而目前缺乏宮頸癌放療患者腸道菌群結(jié)構(gòu)和功能代謝方面的臨床研究。研究目的通過對(duì)宮頸癌放療患者腸道菌群多樣性、群落結(jié)構(gòu)、物種豐度和功能代謝的研究,探討盆腔放療對(duì)宮頸癌患者腸道微生態(tài)的影響,揭示這種影響造成的腸道菌群失平衡問題的生物學(xué)意義。研究方法2018年5月1日到2018年12月31日期間,在安徽醫(yī)科大學(xué)附屬省立醫(yī)院西區(qū)腫瘤營養(yǎng)與代謝治療科辦理住院的宮頸癌放療后患者,入選標(biāo)準(zhǔn):（1）年齡≥18歲;（2）KPS≥60;（3）病理明確診斷宮頸惡性腫瘤;（4）既往接受盆腔放射治療;（5）伴或不伴有放射性腸損傷臨床表現(xiàn)。本研究共納入34例宮頸癌放療患者,錄入人口學(xué)因素和腫瘤學(xué)特征等臨床信息,并依據(jù)取樣標(biāo)準(zhǔn)和要求采集入組患者的糞便標(biāo)本。利用Illumina Mi Seq高通量測序平臺(tái)對(duì)腸道菌群的16S r RNA基因v4區(qū)序列進(jìn)行測序分析,并用QIIME 2等軟件對(duì)測序序列進(jìn)行生物信息學(xué)分析。... 

【文章來源】：安徽醫(yī)科大學(xué)安徽省

【文章頁數(shù)】：68 頁

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

腸道損傷組（IG）與腸道非損傷組（NIG）腸道細(xì)菌群落的豐富度和Alpha多樣性比較

安徽醫(yī)科大學(xué)碩士學(xué)位論文15PCoA分析方法，每個(gè)點(diǎn)代表一個(gè)樣本，橢圓組代表兩個(gè)不同的臨床分組。對(duì)兩組進(jìn)行Beta多樣性顯著性分析，結(jié)果示兩組差異無明顯統(tǒng)計(jì)學(xué)意義（P>0.05）(如圖2A和圖2B)[25-27]。圖2利用Bray-Curtis距離、非加權(quán)和加權(quán)Unifrac度量對(duì)腸道損傷組（IG）與腸道非損傷組（NIG）腸道微生物多樣性進(jìn)行PCoA分析Fig2Principalcoordinateanalysis(PCoA)profileofmicrobialdiversityacrossIntestinalinjurygroup(IG)andIntestinalnon-injurygroup(NIG)usingBray-Curtisdistance,UnweightedandWeightedUnifracdistance注：P值范圍為：*P<0.05，**P<0.01，***P<0.001，ns:P>0.053.3.3不同組間腸道菌群組成及差異分析腸道損傷組（IG）和腸道非損傷組（NIG）組間分類概況的比較顯示，在屬水平上，兩組共篩選出5種菌屬豐度具有顯著性差異，分別為g_Acidaminococcus、g_Pyramidobacter、g_Dialister、g_Megasphaera、f_Dethiosulfovibrionaceae_uncl,結(jié)果示差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義（如圖3）。

安徽醫(yī)科大學(xué)碩士學(xué)位論文16圖3腸道損傷組（IG）與腸道非損傷組（NIG）中相對(duì)豐度存在顯著差異的屬Fig3GenusoftherelativeabundanceofIntestinalinjurygroup(IG)andIntestinalnon-injurygroup(NIG)注：P值范圍為：*P<0.05，**P<0.01，***P<0.001，ns:P>0.053.3.4兩組患者腸道菌群功能與代謝通路分析為了評(píng)價(jià)兩組腸道菌群代謝功能的差異，我們使用PICRUSt（PhylogeneticInvestigationofCommunitiesbyReconstructionofUnobservedStates）軟件對(duì)腸道菌群代謝功能進(jìn)行預(yù)測，以此分析。先將預(yù)測的宏基因組數(shù)據(jù)與KEGG數(shù)據(jù)庫進(jìn)行比對(duì)做出功能推斷，然后使用Leftse（LinearDiscriminantAnalysisEffectSize）確定具有差異豐富的KEGG代謝途徑[28-30]。結(jié)果示腸道損傷組（IG）患者中發(fā)現(xiàn)4種顯著富集的代謝途徑，而腸道非損傷組（NIG）患者中發(fā)現(xiàn)3種顯著富集的代謝途徑（如圖4）。腸道損傷組（IG）患者中富集途徑與萜類和聚酮類代謝、其他次生代謝產(chǎn)物的生物合成、其他氨基酸代謝、輔因子和維生素的代謝有關(guān)，例如：香葉醇降解、丁酰苷菌素和新霉素生物合成、β-丙氨酸代謝及視黃醇代謝。而腸道非損傷組（NIG）患者與膜轉(zhuǎn)運(yùn)、碳水化合物代謝、遺傳信息翻譯有關(guān)，例如：細(xì)菌分泌系統(tǒng)、乙醛酸和二羧酸鹽代謝、RNA轉(zhuǎn)運(yùn)。


本文編號(hào)：3000203