miR-27a-3p抑制B4GALT3表達對胃癌BGC-823細胞增殖和侵襲的影響及機理研究
【學位授予單位】:南華大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2018
【分類號】:R735.2
【圖文】:
化的主要成分—粘蛋白型 O-糖鏈糖基化在腫瘤中高表達,有利于腫瘤生物標記物的研究[11]。B4GALT3(Gene ID: 8703),全稱 beta-1,4-galactosyltransferase 3,又稱beta4Gal-T3,位于染色體 1q23.3 上,是β1,4 半乳糖基轉(zhuǎn)移酶家族中的第 3 個成員(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/8703)。Zhang M 等人[14]利用人胎盤cDNA 文庫成功克隆出 B4GALT3,并指出在其編碼區(qū)第 77 位,119 位,190 位以及 209 位氨基酸處存在四個保守的半胱氨酸殘基,半胱氨酸殘基對糖基轉(zhuǎn)移酶催化反應中的二硫鍵形成至關(guān)重要[14, 15]。Henrik Clausen 等人[15]在 1997 年對B4GALT3 的全長編碼序列的測序和克隆進行了相關(guān)描述,指出 B4GALT3 序列編碼一個具有 4 個殘基胞漿域、18 個殘基穿膜域、1 個莖區(qū)或頸區(qū)域和 371 個殘基催化域以及具有 4 個潛在 N-鏈糖基化位點的Ⅱ型跨膜糖蛋白。B4GALT3 基因的結(jié)構(gòu)如圖 1.1 所示。而且 B4GALT3 的編碼區(qū)有 6 個外顯子[15],在 5'-非翻譯區(qū)有一個 34 堿基的內(nèi)含子[16],全部序列與 B4GALT1 具有 44%的序列同源性[15]。
第四章 結(jié) 果4.1 B4GALT3 在不同胃癌細胞系中的表達情況Western blot 檢測 B4GALT3 在胃癌 SGC-7901 細胞、MGC-803 細胞和BGC-823 細胞中的蛋白表達水平,并以 GES-1 細胞作為對照。結(jié)果如圖 4.1 所示:相對于 GES-1 細胞,B4GALT3 在胃癌細胞中表達水平明顯上調(diào),具有統(tǒng)計學意義(P<0.05)。
圖 4.2 軟件預測與 B4GALT3 靶向結(jié)合的 miRNAs綠色代表該軟件預測有 miRNA 與 B4GALT3 結(jié)合;紅色代表該軟件沒有預測到 miRNA 與B4GALT3 有結(jié)合;黃色代表預測該 miRNA 的軟件總數(shù)。通過 miRanda 對上一步篩選出的 miRNAs 進行熱力學穩(wěn)定性和序列保守性評分分析,結(jié)果發(fā)現(xiàn)上述 20 個靶 miRNAs 中同時滿足熱力學穩(wěn)定性評分(mirSVR)絕對值≥0.1,且序列保守性評分(PhastCons)在 0.5~0.7 之間的有7 個,分別是 miR-27a,miR-27b,miR-338-3p,miR-125b,miR-28-5p,miR-379,miR-491-5p,如圖 4.3 所示。其中評分位于前兩位的 miR-27a,miR-27b 屬同一家族,調(diào)控的靶基因類似。結(jié)合相關(guān)文獻雙熒光素酶報告基因檢測證實[24],可得出 B4GALT3 是 miR-27a 潛在的分子靶向基因。
【參考文獻】
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1 徐雪琴;潘林鑫;耿慧武;劉曉穎;范禮斌;;人β4GalTⅡ基因在哺乳動物細胞株中的表達與定位[J];安徽醫(yī)科大學學報;2015年11期
2 Minal Garg;;Epithelial-mesenchymal transition-activating transcription factors-multifunctional regulators in cancer[J];World Journal of Stem Cells;2013年04期
3 馬汝海;王冬青;潘忠誠;王天驕;何群;趙雨杰;;小鼠肝癌及肝正常組織B4GalT糖基轉(zhuǎn)移酶家族mRNA表達差異及其對細胞膜相關(guān)糖鏈的影響[J];生命科學研究;2012年01期
4 Binhua P.Zhou;;Epithelial-mesenchymal transition in breast cancer progression and metastasis[J];癌癥;2011年09期
5 賈偉;徐嵐;史寧;邵雪君;周迎會;吳士良;;四類糖基轉(zhuǎn)移酶基因在腫瘤細胞株中表達譜的研究[J];蘇州大學學報(醫(yī)學版);2009年05期
6 丁怡甜;辛現(xiàn)良;耿美玉;;細胞表面β1,4-半乳糖基轉(zhuǎn)移酶1功能研究進展[J];生物物理學報;2007年05期
7 張民,王小柯,胡培蓉,屠強,畢安定,余龍,趙壽元;人類β-1,4-半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶Ⅲ基因的分離與克隆[J];實驗生物學報;1999年03期
8 張春雨,段恩奎,曾國慶,劉以訓;細胞表面半乳糖基轉(zhuǎn)移酶及其生物學功能[J];生物化學與生物物理進展;1997年06期
本文編號:2789250
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