【摘要】：目的:胃癌的遺傳性機(jī)制尚未完全闡明,本研究希望通過(guò)應(yīng)用二代基因測(cè)序技術(shù)對(duì)我們收集到的一個(gè)胃癌家系進(jìn)行腫瘤相關(guān)基因篩查,從而明確本家系的致病基因。方法:收集就診于蘭大二院的一個(gè)胃癌家系,同一代的子女3人(1人去世)發(fā)病,對(duì)2名患者進(jìn)行病史采集、實(shí)驗(yàn)室檢查、腹部CT檢查等,并在獲得該家系成員知情同意后,對(duì)家系成員完善臨床診斷(實(shí)驗(yàn)室檢查、腹部彩超、胃鏡檢查、病理檢查等),采集該家系成員的外周血于蘭大二院腫瘤研究中心存放,待檢�？偨Y(jié)家系臨床-遺傳特點(diǎn),構(gòu)建家族譜。采用二代基因測(cè)序技術(shù)對(duì)該家系4成員進(jìn)行遺傳腫瘤致病基因檢測(cè),檢測(cè)該家系的基因突變情況。結(jié)果:該家系中共有患者3人,1人為高-中分化腺癌,1人為印戒細(xì)胞癌,1人病理類(lèi)型不詳,1個(gè)家系成員患胃外惡性腫瘤,12個(gè)家系成員行胃鏡檢查,其中9人診斷患胃良性疾病,8個(gè)家系成員行Hp檢查其中7人診斷患幽門(mén)螺桿菌感染。4名家系成員樣本經(jīng)測(cè)序分析后,得到平均172×以上的測(cè)序深度,所檢測(cè)總變異數(shù)為112864個(gè),共獲得了3個(gè)可疑致病基因(CDH1、SMAD4、TP53)。但是遺憾的是,由于家系的復(fù)雜性,通過(guò)對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行分析處理,SMAD4基因和TP53基因突變僅存在于部分家系成員,尚不能確定相關(guān)基因致病可能。4名家系成員共同存在CDH1基因突變,可是突變位點(diǎn)不保守且測(cè)序深度較低,故而可能存在誤差,最終未發(fā)現(xiàn)該家系明確致病突變。結(jié)論:在該胃癌家系中家系成員的臨床表現(xiàn)體現(xiàn)出存在較高比例的Hp感染,在該家系第三代成員較早出現(xiàn)萎縮、腸化,而目前防治胃癌最為有效的方法是對(duì)胃癌家系成員定期行相關(guān)檢查。對(duì)該家系成員應(yīng)用基因芯片測(cè)序,已排大部分常見(jiàn)遺傳性腫瘤致病基因致病可能,證實(shí)該家系致病基因可能并非目前已知常見(jiàn)的71種腫瘤相關(guān)致病基因,有可能是這71個(gè)基因之外的其他胃癌相關(guān)基因,也可能是一種目前未被發(fā)現(xiàn)的胃癌相關(guān)致病基因。通過(guò)第二代測(cè)序,發(fā)現(xiàn)許多新發(fā)SNPs和Indels,揭示了第二代測(cè)序基因檢測(cè)技術(shù)在胃癌的臨床診斷和分子診斷中發(fā)揮越來(lái)越重要的作用,彌補(bǔ)了傳統(tǒng)遺傳咨詢(xún)模式的不足,為有胃癌家族史的患者提供更為有效的幫助,同時(shí)為胃癌的早發(fā)現(xiàn)、早治療提供幫助。
[Abstract]:Objective: the genetic mechanism of gastric cancer has not been fully clarified. This study hopes to screen a gastric cancer family with tumor-related genes by using the second generation gene sequencing technique, so as to clarify the pathogenic genes of this family. Methods: three children of the same generation (1 died) were collected from a family of gastric cancer in the second Hospital of Landa University. 2 patients were examined by medical history, laboratory examination and abdominal CT examination, and the clinical diagnosis (laboratory examination, abdominal color Doppler ultrasound, gastroscopy, pathological examination, etc.) was improved after obtaining the informed consent of the family members. The peripheral blood of the family members was collected and stored in the tumor Research Center of Lan sophomore Hospital for examination. The clinical and genetic characteristics of the family were summarized and the family spectrum was constructed. The genetic tumor pathogenic genes of 4 members of the family were detected by the second generation gene sequencing technique, and the gene mutation of the family was detected. Results: there were 3 patients, 1 patient with highly differentiated adenocarcinoma, 1 patient with Indian ring cell carcinoma, 1 patient with unknown pathological type, 1 family member with extragastric malignant tumor, 12 family members were diagnosed with benign gastric diseases, and 7 of 8 family members were diagnosed with HP infection by Hp. The samples of 4 family members were analyzed by sequencing. An average sequencing depth of more than 172 脳 was obtained, the total number of variants was 112864, and three suspected pathogenic genes (CDH1,SMAD4,TP53) were obtained. Unfortunately, due to the complexity of the family, SMAD4 gene and TP53 gene mutations only exist in some family members, and it is not possible to determine the pathogenicity of the related genes. Four family members co-exist CDH1 gene mutations, but the mutation sites are not conservative and the sequencing depth is low, so there may be errors, and finally no clear pathogenic mutations were found in the family. Conclusion: there is a high proportion of Hp infection in the clinical manifestations of the family members of this family, and the third generation members of the family have atrophy and intestinal metathesis. at present, the most effective method for the prevention and treatment of gastric cancer is to carry out regular correlation examination on the family members of gastric cancer. Most of the common genetic tumor pathogenic genes have been sequenced by gene chip sequencing. It is confirmed that the pathogenic genes in this family may not be 71 kinds of tumor related genes known at present, may be other gastric cancer related genes other than these 71 genes, or may be a kind of gastric cancer related pathogenic genes which have not been found at present. Through the second generation sequencing, it is found that many new SNPs and Indels, reveal that the second generation sequencing gene detection technology plays a more and more important role in the clinical diagnosis and molecular diagnosis of gastric cancer, makes up for the deficiency of traditional genetic counseling model, provides more effective help for patients with family history of gastric cancer, and provides help for early detection and early treatment of gastric cancer.
【學(xué)位授予單位】：蘭州大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2017
【分類(lèi)號(hào)】：R735.2

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本文編號(hào)：2502936