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基于TCGA數(shù)據(jù)乳腺癌組織UBE2T表達(dá)臨床意義分析

發(fā)布時(shí)間:2018-08-24 07:13
【摘要】:目的既往研究發(fā)現(xiàn),泛素結(jié)合酶E2T(ubiquitin-conjugating enzyme E2T,UBE2T)在多種腫瘤中表達(dá)升高,然而UBE2T在乳腺癌中是否存在高表達(dá)及意義尚不清楚。本研究探討UBE2T表達(dá)水平在乳腺癌中的臨床意義和可能的機(jī)制。方法從癌癥基因組圖譜(the cancer genome atlas,TCGA)數(shù)據(jù)庫下載正常乳腺組織和乳腺癌組織中UBE2T基因mRNA二代測(cè)序數(shù)據(jù)及臨床信息資料,分析UBE2T mRNA表達(dá)水平與乳腺癌臨床病理學(xué)參數(shù)的相關(guān)性及對(duì)預(yù)后的影響。采用Cox回歸多因素分析探討影響乳腺癌患者預(yù)后的因素,采用基因集富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA)方法預(yù)測(cè)UBE2T可能的調(diào)控通路。結(jié)果 UBE2T mRNA在乳腺癌組織中表達(dá)量為9.28~3 963.54,中位374.18,顯著高于正常乳腺組織中UBE2T表達(dá)量8.54~216.13,中位40.44,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P0.001),而且UBE2T表達(dá)水平與乳腺癌患者年齡、分子分型、T分期、TNM分期、雌激素受體(estrogen receptor,ER)、孕激素受體(progesterone receptor,PR)和人表皮生長因子受體2(human epidermal growth factor receptor 2,HER2)狀態(tài)以及病理類型存在顯著相關(guān),均P0.05。進(jìn)一步分析發(fā)現(xiàn),UBE2T低表達(dá)的患者生存預(yù)后優(yōu)于UBE2T高表達(dá)的患者,χ~2=7.490,P=0.006。Cox多因素分析結(jié)果表明,年齡、分子分型、N分期、M分期和UBE2T表達(dá)水平等均是影響乳腺癌患者預(yù)后的獨(dú)立預(yù)后因素,P0.05。GSEA分析表明,UBE2T低表達(dá)的組織中存在RIGGINS_TAMOXIFEN_RESISTANCE_DN信號(hào)通路(FDR=0.199,P0.001)和ERB2_UP.V1_DN路通(FDR=0.235,P0.001)相關(guān)基因富集。結(jié)論乳腺癌組織中存在UBE2T mRNA水平表達(dá)上調(diào),而且UBE2T的表達(dá)水平與患者臨床病理因素顯著相關(guān),其高表達(dá)是乳腺癌預(yù)后不良因素,其可作為預(yù)后判斷的分子標(biāo)記,是潛在的治療靶點(diǎn)。
[Abstract]:Objective previous studies have found that the expression of ubiquitin-conjugating enzyme E2T (UBE2T) is increased in various tumors. However, it is not clear whether there is a high expression of UBE2T in breast cancer. This study was to investigate the clinical significance and possible mechanism of UBE2T expression in breast cancer. Methods the second generation mRNA sequencing data and clinical information of UBE2T gene from normal breast and breast cancer tissues were downloaded from cancer genome map (the cancer genome atlas,TCGA) database. To analyze the correlation between UBE2T mRNA expression and clinicopathological parameters of breast cancer and its influence on prognosis. Cox regression multivariate analysis was used to investigate the prognostic factors of patients with breast cancer, and the gene set enrichment analysis (gene set enrichment analysis,GSEA) was used to predict the possible regulatory pathway of UBE2T. Results the expression of UBE2T mRNA in breast cancer tissues was 9.28 ~ 3 963.54, with a median of 374.18, which was significantly higher than that in normal breast tissues (8.54 ~ 216.13, P ~ (0.001). The expression level of UBE2T was significantly higher than that in breast cancer patients' age, molecular typing and T stage. Estrogen receptor (estrogen receptor,ER), progesterone receptor (progesterone receptor,PR) and human epidermal growth factor receptor 2 (HER2) were significantly correlated with pathological type (P 0.05). Further analysis showed that the survival prognosis of patients with low expression of UBE2T was better than that of patients with high expression of UBE2T. The analysis of RIGGINS_TAMOXIFEN_RESISTANCE_DN signal pathway (FDR=0.199,P0.001) and ERB2_UP.V1_DN passageway (FDR=0.235,P0.001) related genes in the tissues with low expression of UBE2T by P0.05. GSEA analysis showed that the expression of RIGGINS_TAMOXIFEN_RESISTANCE_DN signal pathway (FDR=0.199,P0.001) and ERB2_UP.V1_DN pathway (FDR=0.235,P0.001) were abundant in the tissues with low expression of UBE2T. Conclusion the expression of UBE2T mRNA is up-regulated in breast cancer, and the expression of UBE2T is related to the clinicopathological factors. The high expression of UBE2T is a poor prognostic factor in breast cancer, and it can be used as a molecular marker to judge the prognosis of breast cancer. Is a potential therapeutic target.
【作者單位】: 汕頭市中心醫(yī)院腫瘤放療科;
【分類號(hào)】:R737.9

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本文編號(hào):2200022

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