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MIER3在結(jié)直腸癌中的表達(dá)及其相關(guān)蛋白的生物信息學(xué)分析

發(fā)布時(shí)間:2018-06-30 01:26

  本文選題:MIER + 增殖; 參考:《南方醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào)》2017年08期


【摘要】:目的構(gòu)建基因真核表達(dá)載體并探討MIER3對(duì)結(jié)直腸癌細(xì)胞生物學(xué)特性的影響,應(yīng)用生物信息學(xué)方法對(duì)MIER3及其相互作用蛋白進(jìn)行預(yù)測(cè)分析。方法應(yīng)用Real-time PCR及Western blot方法檢測(cè)MIER3在8例結(jié)腸癌及相應(yīng)癌旁正常組織中mRNA和蛋白表達(dá)水平的差異表達(dá);通過構(gòu)建真核表達(dá)載體pcDNA3-MIER3,應(yīng)用CCK8增殖實(shí)驗(yàn)、Transwell侵襲實(shí)驗(yàn)檢測(cè)過表達(dá)MIER3對(duì)結(jié)直腸癌細(xì)胞株生物學(xué)特性的影響,進(jìn)一步應(yīng)用生物信息學(xué)方法對(duì)MIER3及其相互作用蛋白進(jìn)行預(yù)測(cè)和分析。結(jié)果 MIER3在8例結(jié)腸癌組織中其mRNA及蛋白水平的表達(dá)明顯低于相應(yīng)正常癌旁組織;酶切及測(cè)序結(jié)果顯示成功克隆構(gòu)建pcDNA3-MIER3真核表達(dá)載體;CCK8增殖實(shí)驗(yàn)、Transwell侵襲實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示過表達(dá)MIER3可明顯抑制結(jié)直腸癌細(xì)胞株的增殖及侵襲能力;應(yīng)用模式生物果蠅相互作用蛋白數(shù)據(jù)庫DIP和基于保守的蛋白相互作用分析方法,預(yù)測(cè)NAT9可能是MIER3的潛在相互作用蛋白,提示MIER3可能與腫瘤的易感性相關(guān)。結(jié)論 MIER3與結(jié)直腸癌增殖、侵襲密切相關(guān),為進(jìn)一步深入闡明MIER3在結(jié)直腸癌發(fā)生發(fā)展中的作用奠定基礎(chǔ)。
[Abstract]:Objective to construct eukaryotic expression vector and to investigate the effect of MIER3 on the biological characteristics of colorectal cancer cells, and to predict and analyze MIER3 and its interacting proteins by bioinformatics. Methods Real-time PCR and Western blot were used to detect the differential expression of MIER3 mRNA and protein in 8 cases of colon cancer and its adjacent normal tissues. By constructing eukaryotic expression vector pcDNA3-MIER3, the effect of overexpression of MIER3 on the biological characteristics of colorectal cancer cell line was detected by CCK8 proliferation assay and Transwell invasion assay, and the bioinformatics method was used to predict and analyze MIER3 and its interacting proteins. Results the mRNA and protein levels of MIER3 in 8 colon cancer tissues were significantly lower than those in normal adjacent tissues. The results of enzyme digestion and sequencing showed that pcDNA3-MIER3 eukaryotic expression vector was successfully cloned and constructed. The results of Transwell invasion assay showed that overexpression of MIER3 could significantly inhibit the proliferation and invasion of colorectal cancer cell lines. Based on the model biological Drosophila interaction protein database dip and conservative protein interaction analysis method, NAT9 was predicted to be the potential interaction protein of MIER3, suggesting that MIER3 may be associated with tumor susceptibility. Conclusion MIER3 is closely related to the proliferation and invasion of colorectal cancer, which lays a foundation for further elucidation of the role of MIER3 in the development of colorectal cancer.
【作者單位】: 南方醫(yī)科大學(xué)南方醫(yī)院病理科;南方醫(yī)科大學(xué)放療科;南方醫(yī)科大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院病理學(xué)系;
【基金】:國(guó)家自然科學(xué)基金(81272763,81672466) 廣東省自然科學(xué)基金(2014A030313286)~~
【分類號(hào)】:R735.34

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本文編號(hào):2084243

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