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NAMPT基因多態(tài)性與食管鱗癌發(fā)生風(fēng)險(xiǎn)的相關(guān)性研究

發(fā)布時(shí)間:2018-06-27 15:27

  本文選題:食管鱗狀細(xì)胞癌 + 尼克酰胺磷酸核糖轉(zhuǎn)移酶; 參考:《山東大學(xué)》2015年博士論文


【摘要】:研究背景在世界范圍內(nèi),食管癌的發(fā)病率、死亡率均較高,而我國(guó)正是食管癌高發(fā)區(qū)之一。因?yàn)樵缙谂R床表現(xiàn)不典型,發(fā)現(xiàn)時(shí)多已進(jìn)入中晚期,生存期短,生活質(zhì)量差;但如果發(fā)現(xiàn)及時(shí),內(nèi)鏡下微創(chuàng)治療是可以根治的。因此早發(fā)現(xiàn)、早診斷對(duì)于食管癌的高危人群和患者尤為重要。另外,如果針對(duì)發(fā)病機(jī)制某一關(guān)鍵環(huán)節(jié)加以合理、有效的干預(yù),或許能顯著降低高危人群的患病風(fēng)險(xiǎn),甚至是食管癌治療方法的一個(gè)巨大突破。但目前,食管癌發(fā)病機(jī)制尚不明確,環(huán)境、不健康的生活方式(如熱食、吸煙、酗酒、口腔衛(wèi)生等)、人類乳頭瘤病毒感染等均可能影響食管癌的發(fā)生,除此之外,遺傳易感性也是研究熱點(diǎn)之一。單核苷酸多態(tài)性(SNPs)可通過(guò)影響蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)或表達(dá),間接提高或降低疾病的遺傳易感性。另外,由多個(gè)SNP位點(diǎn)構(gòu)建的單倍型,因?yàn)檎狭硕鄠(gè)位點(diǎn)之間連鎖不平衡的信息,更能有效地體現(xiàn)基因多態(tài)性與疾病遺傳易感性的相關(guān)性。從分子細(xì)胞學(xué)角度看,腫瘤的發(fā)生、發(fā)展,包括食管癌,是致癌物代謝激活與滅活、DNA損傷與修復(fù)、細(xì)胞增殖與凋亡等多方面綜合作用的結(jié)果,F(xiàn)已提出,有關(guān)致癌物代謝基因、DNA修復(fù)基因、細(xì)胞周期控制基因和葉酸代謝基因的基因多態(tài)性可能與食管癌的發(fā)生、發(fā)展相關(guān)。本研究所涉及的基因是尼克酰胺磷酸核糖轉(zhuǎn)移酶(NAMPT),同時(shí)稱為前B細(xì)胞克隆增強(qiáng)因子(PBEF)或內(nèi)臟脂肪素,其表達(dá)的蛋白質(zhì)Nampt具有高度同源的氨基酸序列。首先它在尼克酰胺腺嘌呤二核苷酸(NAD)生物合成過(guò)程中起限速酶作用;而后者參與基因轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)、DNA修復(fù)、細(xì)胞周期、凋亡、鈣離子的平衡、端粒酶的活性、抗氧化、能量代謝、晝夜節(jié)律的維護(hù)以及染色質(zhì)的動(dòng)態(tài)調(diào)節(jié),并是基因穩(wěn)定性、機(jī)體代謝平衡的重要調(diào)節(jié)因子。另外,它有兩種存在方式,細(xì)胞內(nèi)的(iNampt)和細(xì)胞外的(eNampt)。iNampt通過(guò)激活細(xì)胞信號(hào)調(diào)節(jié)蛋白激酶(ERK)1/2通路,促進(jìn)血管內(nèi)皮生長(zhǎng)因子(VEGF)和基質(zhì)金屬蛋白酶(MMP)2/9的生成,對(duì)血管形成有重要的促進(jìn)作用。同時(shí),iNampt參與淋巴細(xì)胞成熟和分化,eNampt則可誘導(dǎo)促炎性細(xì)胞因子、趨化因子的積極表達(dá),由此兩者共同促進(jìn)炎癥發(fā)生。此外,Nampt作為一種新發(fā)現(xiàn)的脂肪因子,具有模擬胰島素功能,可能與腫瘤的發(fā)生有關(guān)。而多個(gè)研究也證實(shí),多種腫瘤患者iNampt和eNampt較健康人群明顯升高,且表達(dá)水平與胃癌、惡性形細(xì)胞膠質(zhì)瘤等腫瘤的惡性程度成正比。所以,我們有理由認(rèn)為,Nampt可能成為針對(duì)惡性腫瘤的一種很好的生物標(biāo)志物;騈AMPT本身相對(duì)較保守,微小的突變就可能導(dǎo)致蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)或功能發(fā)生巨大改變,甚至影響疾病的發(fā)生發(fā)展,例如膀胱癌、肥胖、急性肺損傷等。rs61330082位于啟動(dòng)子,該元件可與轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合,啟動(dòng)轉(zhuǎn)錄開(kāi)始,并有起始特異性。3’端非翻譯區(qū)有多個(gè)TATA基序,為細(xì)胞分泌所需要,rs2505568和rs9034則位于該處。因此,這3個(gè)SNP位點(diǎn)的突變均可能會(huì)影響Nampt蛋白質(zhì)表達(dá),甚至可能通過(guò)上述途徑影響腫瘤的遺傳易感性。目的河南省安陽(yáng)市是中國(guó)食管癌的高發(fā)區(qū)之一,通過(guò)病例-對(duì)照研究,探討NAMPT的3個(gè)SNP位點(diǎn)rs61330082、rs2505568和rs9034基因多態(tài)性,以及相關(guān)的單倍型是否與食管鱗狀細(xì)胞癌(ESCC)的發(fā)生發(fā)展密切相關(guān)。方法在2005年2月至2011年7月期間,來(lái)自于河南省安陽(yáng)腫瘤醫(yī)院的405例ESCC患者作為病例組,隨機(jī)選擇405例來(lái)自于同地區(qū)、同時(shí)期的、無(wú)血緣關(guān)系、無(wú)腫瘤或自身免疫性疾病的健康者作為對(duì)照組,并與病例組在性別、年齡(±1年)方面1:1匹配。研究對(duì)象簽署知情同意書(shū)后,抽血、提取DNA。聚合酶鏈反應(yīng)-限制性片段長(zhǎng)度多態(tài)性法(PCR-RFLP)用來(lái)檢測(cè)NAMPT的3個(gè)SNP位點(diǎn),即rs61330082、rs2505568和rs9034的基因型,并隨機(jī)選擇其中10%的PCR產(chǎn)物進(jìn)行DNA測(cè)序,核對(duì)確定的基因型是否準(zhǔn)確。然后,PHASE 2.1軟件構(gòu)建單倍型,并估計(jì)其頻率。通過(guò)STATA 11.2軟件,利用卡方檢驗(yàn),分析每個(gè)位點(diǎn)的基因型頻率分布是否符合Hardy-Weinberg平衡定律;運(yùn)用Mann-Whitney U檢驗(yàn),分析兩組人群的年齡是否存在分布差異;采用McNemar檢驗(yàn),分析兩組人群的吸煙、飲酒情況是否有分布差異。在條件Logistic回歸模型中,計(jì)算出校正了年齡、性別、吸煙和飲酒等混雜因素后的OR和95%CI,以此分析各位點(diǎn)的基因型、等位基因和單倍型與ESCC發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)之間有無(wú)關(guān)聯(lián)。結(jié)果NAMPT的3個(gè)SNP位點(diǎn),即rs61330082、rs2505568和rs9034均具有基因多態(tài)性,且基因型分布情況均滿足Hardy-Weinberg平衡定律(P0.05)。在病例組中,rs61330082基因型CT、TT和等位基因T的分布頻率均顯著低于對(duì)照組(48.89% vs.53.33%,P0.01;18.52 vs.30.37%,P0.01;42.96% vs.57.04%,P0.01);3種狀態(tài)均能顯著降低攜帶者發(fā)生ESCC的風(fēng)險(xiǎn);反之,基因型CC、等位基因C可使人群ESCC的易感性顯著升高。在rs2505568位點(diǎn)上,未發(fā)現(xiàn)基因型AA,在rs9034位點(diǎn)上,未發(fā)現(xiàn)基因型TT,這兩個(gè)位點(diǎn)的余下兩種基因型在兩組中均無(wú)顯著的分布差異。PHASE 2.1軟件共構(gòu)建出5種相關(guān)單倍型,而病例組的單倍型CTC、CTT或CAC的分布頻率顯著高于對(duì)照組(P0.01, OR=1.57,95% CI:1.16-2.12; P = 0.04, OR=1.72,95% CI:1.03-2.85; P0.01, OR= 3.39,95% CI:1.99-5.75)。結(jié)論在中國(guó)人群中,NAMP1基因rs61330082、rs2505568和rs9034均具有基因多態(tài)性。rs61330082基因型CC、等位基因C可能是ESCC遺傳易感性的危險(xiǎn)因素;而rs2505568、rs9034基因多態(tài)性與ESCC發(fā)病無(wú)明顯相關(guān)性。單倍型CTC(rs61330082 C-rs2505568 T-rs9034 C)、CTT (rs61330082 C-rs2505568 T-rs9034 T)和CAC (rs61330082 C-rs2505568 A-rs9034 C)均可能增加個(gè)體罹患ESCC的風(fēng)險(xiǎn)。因此,NAMP1基因rs61330082多態(tài)性以及單倍型CTC、CTT和CAC可能成為篩選ESCC的高危人群的生物標(biāo)志或基因治療的靶點(diǎn)。
[Abstract]:Background In the world , the incidence and mortality of esophageal cancer are high , and our country is one of the high incidence areas of esophageal cancer . Because early clinical manifestation is not typical , it has entered the middle and late stage , the survival period is short , and the quality of life is poor ;
It is found that early diagnosis is especially important for high - risk populations and patients with esophageal cancer . In addition , genetic susceptibility is one of the hot topics .
It is suggested that Nampt may be a good biomarker for malignant tumors . Three SNP sites of NAMPT , rs61330082 , rs2505568 and rs9034 were randomly selected , and the genotypes of rs61330082 , rs2505568 and rs9034 were detected by PCR - RFLP .
Mann - Whitney U test was used to analyze the distribution difference between the two groups .
In the conditional logistic regression model , the OR and 95 % CIs were calculated for the patients with age , sex , smoking and alcohol consumption . The results showed that the polymorphism of genotype , allele and haplotype was significantly lower than that of the control group ( 48.89 % vs . 53.33 % , P0.01 ) .
18.52 vs.30.37%,P0.01錛,

本文編號(hào):2074372

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