本文選題：癌 + 肝細(xì)胞�。� 參考：《中國普通外科雜志》2017年01期

【摘要】：目的:探討環(huán)狀RNA(circ RNA)在肝細(xì)胞癌(HCC)與正常肝組織中表達(dá)譜的差異。方法:利用circ RNA芯片技術(shù)檢測3例HCC組織和癌旁肝組織circ RNA的表達(dá)譜,經(jīng)過對原始數(shù)據(jù)進(jìn)行預(yù)處理、均一化后,找出差異表達(dá)的circ RNA(與癌旁肝組織比較,HCC組織中1.5倍以上變化并且差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義的circ RNA定義為差異表達(dá)的circ RNA)。根據(jù)表達(dá)差異倍數(shù)較高和樣本間一致性較好的原則篩選circ RNA,借助生物信息學(xué)軟件預(yù)測可能受其調(diào)控的mi RNA,結(jié)合文獻(xiàn)檢索初步確定可能在HCC中具有重要作用的circ RNA。結(jié)果:與癌旁肝組織比較,HCC組織中的circ RNA表達(dá)譜發(fā)生了明顯變化。HCC組織中,1.5倍以上變化的circ RNA共82條,其中上調(diào)21條,下調(diào)61條;5倍以上變化的circ RNA共3條,其中上調(diào)2條,下調(diào)1條。最終篩選出在HCC組織中明顯上調(diào)的hsa-circ-0043278(8.15倍,P=0.002)、hsacirc-0006220(12.73倍,P=0.033)和明顯下調(diào)的hsa-circ-0065214(6.28倍,P=0.019);生物信息學(xué)分析和文獻(xiàn)檢索顯示,hsa-mi R-520可能受hsa-circ-0043278和hsa-circ-0006220調(diào)控而影響HCC的發(fā)生和進(jìn)展。結(jié)論:HCC組織circ RNA表達(dá)譜發(fā)生了顯著變化;hsa-circ-0043278和hsa-circ-0006220可能在HCC的發(fā)生和進(jìn)展中發(fā)揮重要作用。
[Abstract]:Objective: to investigate the difference of cyclic RNA(circ expression profile in hepatocellular carcinoma (HCC) and normal liver tissues. Methods: the expression profiles of circ RNA in 3 cases of HCC and adjacent liver tissues were detected by circ RNA chip technique. The original data were preprocessed and homogenized. To find out the differentially expressed circ (circ RNA is defined as differentially expressed circ RNAs as compared with that in paracarcinomatous liver tissues by more than 1.5 times and the difference is statistically significant. Circ RNAs were screened according to the principle of high expression difference ratio and good consistency among samples. The circ RNAs were predicted by bioinformatics software, and circ RNAs which might play an important role in HCC were preliminarily identified by literature retrieval. Results: compared with the adjacent liver tissues, the expression profile of circ RNA in HCC was significantly changed. There were 82 circ RNA with more than 1.5-fold change in HCC tissue. Among them, 21 were up-regulated, and 61 were down-regulated by more than 5 times, 3 were up-regulated, among which 2 were up-regulated. Cut by one. Finally, we screened out the up-regulation of hsa-circ-0043278(8.15 in HCC tissues, which were obviously up-regulated by hsa-circ-0043278(8.15, which was 0.002hsacirc-0006220 / 12.73) and the down-regulation of hsa-circ-0065214(6.28 / P0. 019. Bioinformatics analysis and literature retrieval showed that hsa-circ-0043278 and hsa-circ-0006220 might influence the occurrence and progress of HCC. Conclusion the expression profile of circ RNA in human hepatocellular carcinoma (HCC) may play an important role in the pathogenesis and progression of HCC. The expression profile of hsa-circ-0043278 and hsa-circ-0006220 may play an important role in the pathogenesis and progression of HCC.
【作者單位】： 北京大學(xué)人民醫(yī)院肝膽外科/北京市肝硬化肝癌基礎(chǔ)研究重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【基金】：北京大學(xué)人民醫(yī)院研究與發(fā)展基金資助項(xiàng)目(RDC2015-01)
【分類號】：R735.7

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本文編號：1955273