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高通量測序分析結(jié)腸腺瘤患者腸道黏膜菌群的構(gòu)成變化

發(fā)布時間:2018-05-16 01:31

  本文選題:結(jié)腸腺瘤 + 腸道菌群 ; 參考:《南方醫(yī)科大學(xué)學(xué)報》2017年09期


【摘要】:目的探討結(jié)直腸癌發(fā)展早期腸道菌群的變化規(guī)律。方法通過結(jié)腸鏡活檢收集31例結(jié)腸腺瘤患者的腺瘤組織以及20例健康志愿者的腸道黏膜,提取基因組DNA,對細(xì)菌16SrRNA基因序列V_3~V_4高變區(qū)進(jìn)行PCR擴(kuò)增,lluminaMiSeq平臺上高通量測序分析。結(jié)果結(jié)腸腺瘤患者的腸道黏膜菌群多樣性比健康對照人群顯著增高(P0.01),腺瘤組黏膜菌群結(jié)構(gòu)和健康對照者相比差異顯著。門水平上:結(jié)腸腺瘤組變形菌門明顯增多(P0.01),厚壁菌門/擬桿菌門比值下降。屬水平上:結(jié)腸腺瘤組乳球菌屬、鏈球菌屬和假單胞菌屬增多(P0.01),而腸球菌屬,桿菌屬豐度明顯下降(P0.01)。不同病理類型腺瘤比較發(fā)現(xiàn):結(jié)腸高級別和低級別上皮內(nèi)瘤變組腸道黏膜菌群整體結(jié)構(gòu)相似,埃希菌-志賀菌屬在高級別上皮內(nèi)瘤變組呈現(xiàn)上升趨勢,但差異無統(tǒng)計學(xué)意義(P0.05)。結(jié)論結(jié)腸腺瘤患者腸道菌群多樣性和構(gòu)成與正常健康人存在明顯差異,腺瘤患者黏膜菌群結(jié)構(gòu)發(fā)生明顯失衡,形成了易于腫瘤生長的腸道微生態(tài)環(huán)境。
[Abstract]:Objective to investigate the changes of intestinal flora in the early stage of colorectal cancer development. Methods the adenoma tissues of 31 patients with colonic adenoma and the intestinal mucosa of 20 healthy volunteers were collected by colonoscopy biopsy. The genomic DNA was extracted and the high throughput sequencing was performed on the V_3~V_4 hypervariable region of bacterial 16SrRNA gene sequence on the platform of Lumina MiSeq. Results the diversity of intestinal mucosal flora in patients with colonic adenoma was significantly higher than that in healthy controls (P 0.01), and the structure of mucosal flora in adenoma was significantly higher than that in healthy controls. At the level of portal, the phylum of Proteus in colonic adenoma group increased significantly (P 0.01), and the ratio of phylum thuringiensis to Bacteroides decreased. The genus of Lactococcus, Streptococcus and Pseudomonas in colonic adenoma group increased P0.01G, while the abundance of Bacillus decreased significantly in Enterococcus. The comparison of adenomas of different pathological types showed that the whole structure of intestinal mucosal flora was similar in the high grade and low grade intraepithelial neoplasia groups, and that the Escherichia coli and Shigella showed an upward trend in the high grade intraepithelial neoplasia group, but the difference was not statistically significant (P 0.05). Conclusion the diversity and composition of intestinal flora in patients with colonic adenoma are significantly different from those in normal controls. The mucosal flora of adenoma patients is out of balance and the intestinal microecological environment is easy to grow.
【作者單位】: 南京醫(yī)科大學(xué)附屬上海一院臨床醫(yī)學(xué)院消化內(nèi)科;
【基金】:國家自然科學(xué)基金(81600500) 上海交通大學(xué)醫(yī)工交叉基金(YG2014ZD10)~~
【分類號】:R735.35

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本文編號:1894846

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