基于Cell-SELEX膠質(zhì)肉瘤與膠質(zhì)瘤干細(xì)胞核酸適配體的篩選及初步應(yīng)用研究
本文選題:膠質(zhì)肉瘤 + 膠質(zhì)瘤干細(xì)胞; 參考:《福建醫(yī)科大學(xué)》2016年博士論文
【摘要】:目的:1.通過體外篩選獲得針對(duì)腦膠質(zhì)肉瘤細(xì)胞特異性的、高親和力的核酸適配體,用于識(shí)別膠質(zhì)肉瘤細(xì)胞和臨床腦膠質(zhì)肉瘤病理組織。2.通過體外篩選獲得針對(duì)腦膠質(zhì)瘤干細(xì)胞特異性的、高親和力的核酸適配體,作為一種新的分子探針用于膠質(zhì)瘤干細(xì)胞的鑒定和分選。方法:1.通過化學(xué)合成一個(gè)隨機(jī)寡核苷酸文庫(kù),包含分別為18個(gè)堿基的前、后引物區(qū),以及含45個(gè)堿基的隨機(jī)核苷酸區(qū)。采用Cell-SELEX(配體指數(shù)富集系統(tǒng)進(jìn)化)技術(shù),以取自臨床腦膠質(zhì)肉瘤的病理組織,經(jīng)原代培養(yǎng)、傳代而獲得的細(xì)胞系k308作為靶細(xì)胞,以正常腦星形膠質(zhì)細(xì)胞SVGp12作為對(duì)照細(xì)胞,經(jīng)過施加不同的篩選條件,使DNA文庫(kù)不斷富集;隨后將富集的DNA文庫(kù)進(jìn)行PCR擴(kuò)增、克隆測(cè)序,得到候選的核酸適配體并進(jìn)一步表征。以測(cè)定平衡解離常數(shù)K_d值來評(píng)估核酸適配體的親和力;選取膠質(zhì)瘤細(xì)胞U251、U87、T98G以及來源于乳腺、結(jié)腸、肝、宮頸、肺的癌細(xì)胞以流式細(xì)胞術(shù)分析核酸適配體的選擇性。另外分別選取臨床腦膠質(zhì)肉瘤病理組織切片以及其它器官來源的腫瘤組織切片,用激光共聚焦顯微鏡組織成像技術(shù)檢測(cè)核酸適配體的識(shí)別能力。2.合成一個(gè)序列長(zhǎng)度為80個(gè)堿基的隨機(jī)寡核苷酸文庫(kù):5’-ATA CCA GCT TAT TCA ATT-40N-AGA TAG TAA GTG CAA TCT-3’。以膠質(zhì)瘤干細(xì)胞為正篩細(xì)胞,經(jīng)CD133磁珠分選,免疫細(xì)胞化學(xué)染色及Western-Blot、RT-PCR等方法鑒定;以膠質(zhì)瘤細(xì)胞U87作為反篩細(xì)胞,采用Cell-SELEX技術(shù),得到候選的核酸適配體并進(jìn)一步表征。測(cè)定其平衡解離常數(shù)K_d值,用激光共聚焦熒光顯微鏡檢測(cè)核酸適配體的識(shí)別能力。選擇U251、T98G、k308、Hu H-7、Hela、SW480、MDA-MB-231以及膠質(zhì)瘤干細(xì)胞經(jīng)分化后的細(xì)胞,以流式細(xì)胞術(shù)分析核酸適配體的選擇性。用胰酶消化方式來考察核酸適配體靶標(biāo)性質(zhì)。通過同CD133蛋白、CD133抗體結(jié)合及競(jìng)爭(zhēng)實(shí)驗(yàn)進(jìn)一步考察核酸適配體實(shí)際應(yīng)用。結(jié)果:1.經(jīng)過16個(gè)循環(huán)的篩選,最終獲得5條特異靶向膠質(zhì)肉瘤細(xì)胞的核酸適配體。這些核酸適配體K_d值介于10-100 nmol/L,流式細(xì)胞術(shù)及激光共聚焦顯微鏡檢測(cè)發(fā)現(xiàn)他們可以特異性地結(jié)合膠質(zhì)肉瘤細(xì)胞,將其中親和力和特異性最佳的核酸適配體WQY-9序列進(jìn)一步優(yōu)化,得到序列長(zhǎng)度為63個(gè)堿基的核酸適配體WQY-9-B,測(cè)定其K_d值為23±5 n M,能夠在4℃和37℃條件下識(shí)別膠質(zhì)肉瘤細(xì)胞,而不與U251、U87、T98G及其他組織來源的癌細(xì)胞發(fā)生結(jié)合。經(jīng)胰蛋白酶消化處理后的膠質(zhì)肉瘤細(xì)胞k308,核酸適配體WQY-9-B不能再與之結(jié)合;同時(shí)用WQY-9-B檢測(cè)臨床膠質(zhì)肉瘤病理組織切片的陽(yáng)性率為73.3%,對(duì)來源于其他器官的腫瘤組織幾乎不結(jié)合。2.膠質(zhì)瘤干細(xì)胞具有成球生長(zhǎng)、多向分化、裸鼠移植成瘤的干細(xì)胞特性。經(jīng)過20個(gè)循環(huán)的篩選,最終獲得5條特異靶向膠質(zhì)瘤干細(xì)胞的核酸適配體。其中核酸適配體W5的親和力和特異性均最佳,K_d值為4.9±1.4 n M,選擇W5進(jìn)行序列截短優(yōu)化,得到序列長(zhǎng)度為66個(gè)堿基的核酸適配體W5-7,測(cè)定K_d值為4.4±1.1 n M。流式細(xì)胞術(shù)及激光共聚焦顯微鏡檢測(cè)發(fā)現(xiàn)W5-7在4℃和37℃時(shí)具有同樣識(shí)別膠質(zhì)瘤干細(xì)胞的能力。與經(jīng)過胰蛋白酶預(yù)先處理后的膠質(zhì)瘤干細(xì)胞孵育,W5-7喪失原有的結(jié)合力;同時(shí)W5-7能夠識(shí)別CD133陽(yáng)性表達(dá)的膠質(zhì)瘤干細(xì)胞,但不結(jié)合CD133蛋白,與CD133抗體在膠質(zhì)瘤干細(xì)胞上的結(jié)合不存在競(jìng)爭(zhēng)關(guān)系。結(jié)論:1.所得到膠質(zhì)肉瘤的核酸適配體WQY-9及WQY-9-B具有特異性以及高親和力;可以用于區(qū)分膠質(zhì)肉瘤與膠質(zhì)瘤細(xì)胞;核酸適配體WQY-9-B的靶標(biāo)可能為膠質(zhì)肉瘤細(xì)胞表面的某種膜蛋白;WQY-9-B具有針對(duì)臨床膠質(zhì)肉瘤病理組織優(yōu)良的識(shí)別能力,可以作為膠質(zhì)肉瘤的一種分子探針,將在膠質(zhì)肉瘤的早期診斷、靶向遞藥、改善預(yù)后等方面發(fā)揮重要作用。2.所得到膠質(zhì)瘤干細(xì)胞的核酸適配體W5及W5-7具有高親和力和特異性;可以區(qū)分膠質(zhì)瘤干細(xì)胞和膠質(zhì)瘤細(xì)胞及其他組織來源的腫瘤細(xì)胞;W5-7可以對(duì)膠質(zhì)瘤干細(xì)胞進(jìn)行成像;W5-7的靶標(biāo)可能為膠質(zhì)瘤干細(xì)胞表面的某種膜蛋白;W5-7可以替代CD133抗體來鑒定和分選膠質(zhì)瘤干細(xì)胞,并用以甄定出膠質(zhì)瘤干細(xì)胞的特異性標(biāo)記物;將對(duì)實(shí)現(xiàn)從膠質(zhì)瘤源頭上的精準(zhǔn)診療,提高膠質(zhì)瘤的整體療效等方面具有重要的臨床意義。
[Abstract]:Objective : 1 . To obtain a nucleic acid aptamer with high affinity for glioma stem cells and to identify the affinity of nucleic acid aptamer by using cell - SELEX ( ligand index enrichment system evolution ) . Human glioma stem cells ( WQY - 9 - B ) were screened by trypsinization . The results were as follows : 1 . The results were as follows : 1 . The affinity and specificity of CD133 protein and CD133 antibody could not be combined with those of U251 , U87 , T98G and other tissues . It has important clinical significance to realize accurate diagnosis and treatment from the source of glioma and improve the overall curative effect of glioma .
【學(xué)位授予單位】:福建醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【學(xué)位授予年份】:2016
【分類號(hào)】:R739.41
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,本文編號(hào):1859458
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