胃癌差異蛋白的無標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)研究
本文選題:胃癌 + 定量蛋白質(zhì)組學(xué); 參考:《第四軍醫(yī)大學(xué)》2016年博士論文
【摘要】:癌癥是導(dǎo)致人類死亡的一大頑癥。2012年全球腫瘤流行病統(tǒng)計數(shù)據(jù)解析,肺癌、乳腺癌和結(jié)直腸癌是世界范圍內(nèi)診斷最常見的癌癥,而肺癌、肝癌和胃癌則是最主要的致死癌癥。報告中指出,中國新增和死亡癌癥患者居世界第一。2014年全國腫瘤登記中心最新研究顯示,肺癌、胃癌和肝癌是我國范圍內(nèi)診斷常見的前三位癌癥,而肺癌、肝癌和胃癌則是前三位致死癌癥。由此可見,癌癥乃至胃癌嚴(yán)重危害著我國人口健康,對其進行預(yù)防、診斷和治療顯得等至關(guān)重要。胃癌是遺傳因素和環(huán)境因素相互作用引發(fā)的惡性腫瘤。臨床上用于治療胃癌的方法有手術(shù)、化學(xué)療法和放射療法,但由于其缺乏明顯的臨床特征,大多數(shù)患者一旦確診已是晚期,故手術(shù)和化療的5年生存率均不高,約為10%-30%。近年來,靶向治療在臨床上引發(fā)了革命性的突破,成為腫瘤治療的希望。但是,靶向治療的發(fā)展仍然存在著許多障礙,特別是腫瘤細(xì)胞的關(guān)鍵信號通路不清、所知理想靶位不足,有效的藥物不多。因此,早期診斷標(biāo)志物、藥物靶分子發(fā)現(xiàn)和臨床治療靶向藥物研發(fā)是目前亟待解決的重要問題。闡明胃癌發(fā)生發(fā)展的相關(guān)分子及其調(diào)控機制,不僅有可能為該病的早期診斷提供標(biāo)志物,還可能為臨床治療提供候選靶分子和新策略。本研究通過收集胃癌患者手術(shù)切除配對胃癌-癌旁的中-低分化腺癌組織,利用無標(biāo)記定量蛋白組學(xué)方法獲得配對癌旁-胃癌組織差異表達(dá)蛋白,并進行生物信息學(xué)的功能注釋和疾病關(guān)聯(lián)性分析,一方面闡述差異表達(dá)蛋白在胃癌發(fā)生發(fā)展過程參與的可能分子調(diào)控機制,另一方面確定有望成為生物標(biāo)志物的候選分子,對其進行實時定量pcr、蛋白印跡和免疫組化多層次驗證。此外,通過免疫熒光、基因轉(zhuǎn)染、流式細(xì)胞術(shù)、mtt、transwell小室、實時定量pcr、免疫共沉淀與蛋白印跡等技術(shù)在細(xì)胞水平上首次探討了核不均一核糖核蛋白d(hnrnpd)在胃癌發(fā)生過程中的分子機制,為其作為有效分子標(biāo)志物提供相應(yīng)的理論基礎(chǔ)。通過以上一系列實驗研究,我們獲得了以下的結(jié)果與結(jié)論。首先,通過無標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)分析配對胃癌-癌旁組織,分別鑒定到3100-3700種蛋白質(zhì),進一步篩選后獲得146種差異表達(dá)蛋白,其中81種在胃癌組織中表達(dá)下調(diào),65種在胃癌組織中表達(dá)上調(diào)。其次,通過生物信息學(xué)工具分析,146種差異表達(dá)蛋白與癌癥息息相關(guān),最多一類為核酸結(jié)合蛋白,具有核苷酸結(jié)合活性、催化活性、結(jié)構(gòu)分子活性和轉(zhuǎn)運體活性等分子功能,形成相互關(guān)聯(lián)網(wǎng)絡(luò),參與代謝物和能量產(chǎn)生、氧化磷酸化、基因表達(dá)、核苷酸合成、rna剪切與加工、轉(zhuǎn)錄調(diào)控等生物學(xué)過程及相關(guān)信號通路,調(diào)控胃癌的發(fā)生發(fā)展。第三,針對其中4種差異表達(dá)分子,利用實時定量pcr、蛋白印跡和免疫組化驗證了hnrnpa2b1、hnrnpd、hnrnpl和ybx-1在胃癌組織中高表達(dá),癌旁組織中低表達(dá),且hnrnpa2b1與hnrnpd的表達(dá)分布特征與ybx-1在胃癌組織中高度一致,均發(fā)生了質(zhì)-核轉(zhuǎn)移。其中,對hnrnpd和hnrnpl在胃癌組織中高表達(dá)的鑒定屬于首次報道。最后,為了探討hnrnpd與胃癌發(fā)生發(fā)展的關(guān)系及其可能的分子機制,首先利用免疫熒光實驗再次證實了hnrnpd在胃癌細(xì)胞表達(dá)主要分布于細(xì)胞核;其次利用基因轉(zhuǎn)染、流式細(xì)胞術(shù)、mtt、transwell小室、實時定量pcr、免疫共沉淀與蛋白印跡等技術(shù)探討了hnrnpd能夠促進胃癌細(xì)胞增殖與遷移,調(diào)控細(xì)胞周期,抑制細(xì)胞凋亡;并結(jié)合一系列細(xì)胞周期調(diào)控因子和原癌基因mrna,介導(dǎo)相關(guān)mrna表達(dá)水平發(fā)生改變以及極有可能通過ybx-1-pi3k/akt信號通路參與胃癌細(xì)胞的增殖,影響胃癌的發(fā)生發(fā)展。
[Abstract]:Cancer is a global epidemic of cancer epidemic statistics that causes human death in.2012. Lung, breast and colorectal cancer are the most common cancers diagnosed worldwide, while lung, liver and gastric cancer are the most fatal cancers. The report points out that the new and dead cancer patients in China live in the first.2014 of the world. The latest research in the cancer registration center shows that lung cancer, gastric cancer and liver cancer are the most common first three cancers in our country, while lung cancer, liver cancer and gastric cancer are the top three fatal cancers. Thus, cancer and even gastric cancer are seriously endangering the health of our population. It is very important to prevent, diagnose and treat it. The malignant tumor caused by the interaction of factors and environmental factors. The methods of clinical use for the treatment of gastric cancer are surgery, chemotherapy and radiotherapy, but because of their lack of obvious clinical features, the 5 year survival rate of the operation and chemotherapy is not high, due to the lack of obvious clinical features. It is about 10%-30%. in recent years, and the targeted therapy is in clinical practice. However, there are still many obstacles to the development of targeted therapy, especially the poor key signal pathways of the tumor cells, lack of ideal targets and few effective drugs. Therefore, early diagnostic markers, drug target molecular discovery and clinical therapy target drug development are It is an important problem to be solved urgently. It is not only possible to provide markers for the early diagnosis of the disease, but also provide candidate targets and new strategies for the clinical treatment of gastric cancer. On the one hand, the possible molecular regulation mechanism of differential expression proteins involved in the development and development of gastric cancer is described. On the other hand, the possible molecular markers in the carcinogenesis and development of gastric cancer are discussed. In addition, the nuclear inhomogeneous ribonucleoprotein D (hnrnpd) in gastric cancer was first discussed at the cell level by immunofluorescence, gene transfection, flow cytometry, MTT, Transwell chamber, real-time quantitative PCR, immunoprecipitation and Western blotting, in addition to the real-time quantitative PCR, Western blot and immunohistochemistry. The molecular mechanism in the course provides a theoretical basis for its effective molecular markers. Through a series of experimental studies above, we have obtained the following results and conclusions. First, 3100-3700 kinds of proteins were identified by unmarked quantitative proteomic techniques, respectively. 146 differentially expressed proteins, of which 81 were down regulated in gastric cancer tissues, and 65 were up-regulated in gastric cancer tissues. Secondly, through bioinformatics analysis, 146 differentially expressed proteins were closely related to cancer, the most one was nucleic acid binding protein, with nucleotides binding activity, catalytic activity, structural molecular activity and transporter activity. Sex and other molecular functions, form interrelated networks, participate in metabolites and energy production, oxidative phosphorylation, gene expression, nucleotide synthesis, RNA shearing and processing, transcriptional regulation and other biological processes and related signaling pathways to regulate the occurrence and development of gastric cancer. Third, 4 differentially expressed molecules are used in real time quantitative PCR, Western blot and Immunohistochemistry showed that hnrnpa2b1, hnrnpd, hnrnpl and ybx-1 were highly expressed in gastric cancer tissues, low expression in para cancerous tissues, and the distribution characteristics of hnrnpa2b1 and hnrnpd were highly consistent with ybx-1 in gastric cancer tissues, and both of them had a mass nuclear transfer. Among them, the identification of high expression of hnrnpd and hnrnpl in gastric cancer was the first report. Finally, In order to explore the relationship between hnrnpd and the development of gastric cancer and its possible molecular mechanism, first of all, the expression of hnrnpd in gastric cancer cells was mainly distributed in the nucleus by immunofluorescence, and then h was explored by gene transfection, flow cytometry, MTT, Transwell chamber, real-time PCR, immunoprecipitation and Western blotting. Nrnpd can promote the proliferation and migration of gastric cancer cells, regulate cell cycle and inhibit cell apoptosis, and combine a series of cell cycle regulators and proto oncogene mRNA, mediate the change of related mRNA expression level and possibly participate in the proliferation of gastric cancer cells through the ybx-1-pi3k/akt signaling pathway, and affect the development of gastric cancer.
【學(xué)位授予單位】:第四軍醫(yī)大學(xué)
【學(xué)位級別】:博士
【學(xué)位授予年份】:2016
【分類號】:R735.2
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